RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612104.1

5S_rRNA.20-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 118 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 S4R3F8 94 aa3.68□□□□□ -1.82
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 USH2AO75445 5202 aa3.68□□□□□ -1.82
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 SSPOA2VEC9 5147 aa3.67□□□□□ -1.82
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 COX7CP15954 63 aa3.65□□□□□ -1.83
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 DMAC1Q96GE9 116 aa3.64□□□□□ -1.83
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.64□□□□□ -1.83
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 CCDC179H3BU77 68 aa3.62□□□□□ -1.83
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 KRTAP10-10P60014 251 aa3.62□□□□□ -1.83
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 ANAPC13Q9BS18 74 aa3.62□□□□□ -1.83
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 A8MUN3 132 aa3.6□□□□□ -1.83
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.6□□□□□ -1.83
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 LCE2BO14633 110 aa3.59□□□□□ -1.83
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 CSAG1Q6PB30 78 aa3.59□□□□□ -1.83
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 H7BZZ5 65 aa3.57□□□□□ -1.84
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 NDUFC1O43677 76 aa3.55□□□□□ -1.84
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa3.55□□□□□ -1.84
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.53□□□□□ -1.84
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 ACYP2P14621 99 aa3.52□□□□□ -1.85
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.51□□□□□ -1.85
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa3.51□□□□□ -1.85
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 P0C880 135 aa3.5□□□□□ -1.85
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 COA5Q86WW8 74 aa3.5□□□□□ -1.85
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 H0YAA0 97 aa3.47□□□□□ -1.85
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.47□□□□□ -1.85
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.45□□□□□ -1.86
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 MT1BP07438 61 aa3.44□□□□□ -1.86
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.42□□□□□ -1.86
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.4□□□□□ -1.87
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.4□□□□□ -1.87
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 TMEM258P61165 79 aa3.39□□□□□ -1.87
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.39□□□□□ -1.87
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 M0QZ58 72 aa3.38□□□□□ -1.87
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 PCP4P48539 62 aa3.37□□□□□ -1.87
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 CRIPTQ9P021 101 aa3.37□□□□□ -1.87
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 Q5VV11 94 aa3.36□□□□□ -1.87
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 R4GN34 69 aa3.35□□□□□ -1.87
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 LINC01554Q52M75 96 aa3.34□□□□□ -1.87
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.33□□□□□ -1.88
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.29□□□□□ -1.88
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 SERP1Q9Y6X1 66 aa3.29□□□□□ -1.88
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 KRTAP10-5P60370 271 aa3.28□□□□□ -1.88
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 A0A1B0GU69 56 aa3.27□□□□□ -1.89
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 MT1XP80297 61 aa3.27□□□□□ -1.89
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.26□□□□□ -1.89
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 A0A0D9SG42 100 aa3.25□□□□□ -1.89
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 A0A1B0GU33 70 aa3.25□□□□□ -1.89
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 A6NN06 94 aa3.25□□□□□ -1.89
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 SEC61GP60059 68 aa3.25□□□□□ -1.89
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 A8MU10 97 aa3.23□□□□□ -1.89
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 PLAC4Q8WY50 150 aa3.23□□□□□ -1.89
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 PRR15LQ9BU68 103 aa3.21□□□□□ -1.9
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 KMT2DO14686 5537 aa3.2□□□□□ -1.9
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.19□□□□□ -1.9
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 KRTAP12-2P59991 146 aa3.19□□□□□ -1.9
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 NEBP20929 6669 aa3.18□□□□□ -1.9
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 PSPHP1O15172 72 aa3.18□□□□□ -1.9
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 KRTAP12-1P59990 96 aa3.18□□□□□ -1.9
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.18□□□□□ -1.9
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 Q1T7F1 81 aa3.16□□□□□ -1.9
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.15□□□□□ -1.91
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.15□□□□□ -1.91
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.12□□□□□ -1.91
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.11□□□□□ -1.91
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.1□□□□□ -1.91
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 UQCR11O14957 56 aa3.1□□□□□ -1.91
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.1□□□□□ -1.91
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 V9GYY9 64 aa3.09□□□□□ -1.91
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.08□□□□□ -1.92
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 KRTAP10-12P60413 245 aa3.07□□□□□ -1.92
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 MDN1Q9NU22 5596 aa3.06□□□□□ -1.92
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 KRTAP5-9P26371 169 aa3.06□□□□□ -1.92
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.05□□□□□ -1.92
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 A6NED7 52 aa3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 SPRR2FQ96RM1 72 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 SPRR2EP22531 72 aa2.94□□□□□ -1.94
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 SPRR2BP35325 72 aa2.94□□□□□ -1.94
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 SPRR2AP35326 72 aa2.94□□□□□ -1.94
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa2.94□□□□□ -1.94
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.93□□□□□ -1.94
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 LCE3AQ5TA76 89 aa2.93□□□□□ -1.94
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.92□□□□□ -1.94
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.92□□□□□ -1.94
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 TNP1P09430 55 aa2.9□□□□□ -1.95
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.9□□□□□ -1.95
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 K7ERS5 55 aa2.89□□□□□ -1.95
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 MT1EP04732 61 aa2.88□□□□□ -1.95
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa2.84□□□□□ -1.95
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 BRK1Q8WUW1 75 aa2.84□□□□□ -1.95
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.84□□□□□ -1.95
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 SPRR2DP22532 72 aa2.83□□□□□ -1.96
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa2.82□□□□□ -1.96
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 ROMO1P60602 79 aa2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107 ms