RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598960.5

FCHO1-227, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-227ENST00000598960 LCA10Q71F78 164 aa6.99□□□□□ -1.29
FCHO1-227ENST00000598960 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.99□□□□□ -1.29
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.96□□□□□ -1.3
FCHO1-227ENST00000598960 Q1T7F1 81 aa6.94□□□□□ -1.3
FCHO1-227ENST00000598960 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.92□□□□□ -1.3
FCHO1-227ENST00000598960 V9GYY9 64 aa6.92□□□□□ -1.3
FCHO1-227ENST00000598960 LCE2CQ5TA81 110 aa6.88□□□□□ -1.31
FCHO1-227ENST00000598960 RNF213Q63HN8 5207 aa6.88□□□□□ -1.31
FCHO1-227ENST00000598960 CSAG1Q6PB30 78 aa6.85□□□□□ -1.31
FCHO1-227ENST00000598960 PRR15LQ9BU68 103 aa6.83□□□□□ -1.32
FCHO1-227ENST00000598960 A0A1B0GU69 56 aa6.8□□□□□ -1.32
FCHO1-227ENST00000598960 PSPHP1O15172 72 aa6.8□□□□□ -1.32
FCHO1-227ENST00000598960 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
FCHO1-227ENST00000598960 Q5VV11 94 aa6.78□□□□□ -1.32
FCHO1-227ENST00000598960 MUC2Q02817 5179 aa6.77□□□□□ -1.33
FCHO1-227ENST00000598960 SEC61GP60059 68 aa6.76□□□□□ -1.33
FCHO1-227ENST00000598960 MT1HP80294 61 aa6.75□□□□□ -1.33
FCHO1-227ENST00000598960 H0YAA0 97 aa6.72□□□□□ -1.33
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.71□□□□□ -1.34
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
FCHO1-227ENST00000598960 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.69□□□□□ -1.34
FCHO1-227ENST00000598960 P0C880 135 aa6.65□□□□□ -1.34
FCHO1-227ENST00000598960 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.65□□□□□ -1.35
FCHO1-227ENST00000598960 M0R2T5 61 aa6.64□□□□□ -1.35
FCHO1-227ENST00000598960 A6NED7 52 aa6.61□□□□□ -1.35
FCHO1-227ENST00000598960 A0A1B0GU33 70 aa6.6□□□□□ -1.35
FCHO1-227ENST00000598960 UQCR11O14957 56 aa6.58□□□□□ -1.36
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.52□□□□□ -1.37
FCHO1-227ENST00000598960 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
FCHO1-227ENST00000598960 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.51□□□□□ -1.37
FCHO1-227ENST00000598960 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.5□□□□□ -1.37
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.5□□□□□ -1.37
FCHO1-227ENST00000598960 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.5□□□□□ -1.37
FCHO1-227ENST00000598960 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
FCHO1-227ENST00000598960 BRK1Q8WUW1 75 aa6.49□□□□□ -1.37
FCHO1-227ENST00000598960 M0QZ58 72 aa6.48□□□□□ -1.37
FCHO1-227ENST00000598960 MT2AP02795 61 aa6.48□□□□□ -1.37
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.48□□□□□ -1.37
FCHO1-227ENST00000598960 A8MU10 97 aa6.45□□□□□ -1.38
FCHO1-227ENST00000598960 MT1FP04733 61 aa6.44□□□□□ -1.38
FCHO1-227ENST00000598960 CRIPTQ9P021 101 aa6.44□□□□□ -1.38
FCHO1-227ENST00000598960 R4GN34 69 aa6.44□□□□□ -1.38
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.43□□□□□ -1.38
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP10-10P60014 251 aa6.39□□□□□ -1.39
FCHO1-227ENST00000598960 A0A0D9SG42 100 aa6.36□□□□□ -1.39
FCHO1-227ENST00000598960 PRO0628Q9UI54 55 aa6.33□□□□□ -1.4
FCHO1-227ENST00000598960 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.32□□□□□ -1.4
FCHO1-227ENST00000598960 LINC01554Q52M75 96 aa6.31□□□□□ -1.4
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.31□□□□□ -1.4
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP12-1P59990 96 aa6.26□□□□□ -1.41
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.26□□□□□ -1.41
FCHO1-227ENST00000598960 A6NN06 94 aa6.24□□□□□ -1.41
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP12-2P59991 146 aa6.23□□□□□ -1.41
FCHO1-227ENST00000598960 K7ERS5 55 aa6.22□□□□□ -1.41
FCHO1-227ENST00000598960 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.21□□□□□ -1.42
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.18□□□□□ -1.42
FCHO1-227ENST00000598960 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.12□□□□□ -1.43
FCHO1-227ENST00000598960 PMAIP1Q13794 54 aa6.11□□□□□ -1.43
FCHO1-227ENST00000598960 MT1BP07438 61 aa6.1□□□□□ -1.43
FCHO1-227ENST00000598960 LCE2BO14633 110 aa6.09□□□□□ -1.43
FCHO1-227ENST00000598960 PLAC4Q8WY50 150 aa6.07□□□□□ -1.44
FCHO1-227ENST00000598960 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
FCHO1-227ENST00000598960 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.06□□□□□ -1.44
FCHO1-227ENST00000598960 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.03□□□□□ -1.44
FCHO1-227ENST00000598960 ROMO1P60602 79 aa5.97□□□□□ -1.45
FCHO1-227ENST00000598960 SVIPQ8NHG7 77 aa5.97□□□□□ -1.45
FCHO1-227ENST00000598960 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.93□□□□□ -1.46
FCHO1-227ENST00000598960 MT1XP80297 61 aa5.88□□□□□ -1.47
FCHO1-227ENST00000598960 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.88□□□□□ -1.47
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP10-5P60370 271 aa5.86□□□□□ -1.47
FCHO1-227ENST00000598960 USH2AO75445 5202 aa5.82□□□□□ -1.48
FCHO1-227ENST00000598960 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.81□□□□□ -1.48
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.77□□□□□ -1.49
FCHO1-227ENST00000598960 PRAC1Q96KF2 57 aa5.77□□□□□ -1.49
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.74□□□□□ -1.49
FCHO1-227ENST00000598960 TNP1P09430 55 aa5.74□□□□□ -1.49
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.74□□□□□ -1.49
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
FCHO1-227ENST00000598960 SSPOA2VEC9 5147 aa5.66□□□□□ -1.5
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP10-12P60413 245 aa5.57□□□□□ -1.52
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.56□□□□□ -1.52
FCHO1-227ENST00000598960 PP632Q6XCG6 107 aa5.55□□□□□ -1.52
FCHO1-227ENST00000598960 LCE3AQ5TA76 89 aa5.52□□□□□ -1.53
FCHO1-227ENST00000598960 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
FCHO1-227ENST00000598960 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
FCHO1-227ENST00000598960 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.41□□□□□ -1.54
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.4□□□□□ -1.54
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.4□□□□□ -1.54
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP12-3P60328 96 aa5.29□□□□□ -1.56
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.29□□□□□ -1.56
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.25□□□□□ -1.57
FCHO1-227ENST00000598960 KMT2DO14686 5537 aa5.22□□□□□ -1.57
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.17□□□□□ -1.58
FCHO1-227ENST00000598960 MT1EP04732 61 aa5.16□□□□□ -1.58
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.16□□□□□ -1.58
FCHO1-227ENST00000598960 NEBP20929 6669 aa5.12□□□□□ -1.59
FCHO1-227ENST00000598960 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.08□□□□□ -1.6
FCHO1-227ENST00000598960 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.07□□□□□ -1.6
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