RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593048.5

CIRBP-241, Transcript of cold inducible RNA binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene CIRBP, Length 650 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-241ENST00000593048 HRES1P13985 223 aa8.08□□□□□ -1.12
CIRBP-241ENST00000593048 RPS28P62857 69 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
CIRBP-241ENST00000593048 Q5W150 140 aa8.05□□□□□ -1.12
CIRBP-241ENST00000593048 MPLKIPQ8TAP9 179 aa8.05□□□□□ -1.12
CIRBP-241ENST00000593048 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa8.02□□□□□ -1.13
CIRBP-241ENST00000593048 MT2AP02795 61 aa8.01□□□□□ -1.13
CIRBP-241ENST00000593048 IGKV2-30P06310 120 aa8.01□□□□□ -1.13
CIRBP-241ENST00000593048 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.99□□□□□ -1.13
CIRBP-241ENST00000593048 SPINK7P58062 85 aa7.97□□□□□ -1.13
CIRBP-241ENST00000593048 KRTAP10-10P60014 251 aa7.97□□□□□ -1.13
CIRBP-241ENST00000593048 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
CIRBP-241ENST00000593048 MT1FP04733 61 aa7.95□□□□□ -1.14
CIRBP-241ENST00000593048 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.95□□□□□ -1.14
CIRBP-241ENST00000593048 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.88□□□□□ -1.15
CIRBP-241ENST00000593048 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CIRBP-241ENST00000593048 LCE2BO14633 110 aa7.87□□□□□ -1.15
CIRBP-241ENST00000593048 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.87□□□□□ -1.15
CIRBP-241ENST00000593048 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa7.86□□□□□ -1.15
CIRBP-241ENST00000593048 A8MUN3 132 aa7.84□□□□□ -1.15
CIRBP-241ENST00000593048 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
CIRBP-241ENST00000593048 ACYP2P14621 99 aa7.83□□□□□ -1.16
CIRBP-241ENST00000593048 DMAC1Q96GE9 116 aa7.82□□□□□ -1.16
CIRBP-241ENST00000593048 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.8□□□□□ -1.16
CIRBP-241ENST00000593048 COA5Q86WW8 74 aa7.73□□□□□ -1.17
CIRBP-241ENST00000593048 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.71□□□□□ -1.18
CIRBP-241ENST00000593048 V9GYY9 64 aa7.71□□□□□ -1.18
CIRBP-241ENST00000593048 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa7.65□□□□□ -1.18
CIRBP-241ENST00000593048 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa7.64□□□□□ -1.19
CIRBP-241ENST00000593048 C4orf26Q17RF5 130 aa7.64□□□□□ -1.19
CIRBP-241ENST00000593048 Q1T7F1 81 aa7.64□□□□□ -1.19
CIRBP-241ENST00000593048 SPTSSBQ8NFR3 76 aa7.62□□□□□ -1.19
CIRBP-241ENST00000593048 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.54□□□□□ -1.2
CIRBP-241ENST00000593048 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.53□□□□□ -1.2
CIRBP-241ENST00000593048 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa7.52□□□□□ -1.21
CIRBP-241ENST00000593048 PRR15LQ9BU68 103 aa7.45□□□□□ -1.22
CIRBP-241ENST00000593048 S4R3F8 94 aa7.42□□□□□ -1.22
CIRBP-241ENST00000593048 NEBP20929 6669 aa7.42□□□□□ -1.22
CIRBP-241ENST00000593048 CSAG1Q6PB30 78 aa7.39□□□□□ -1.23
CIRBP-241ENST00000593048 SEC61GP60059 68 aa7.38□□□□□ -1.23
CIRBP-241ENST00000593048 A0A1B0GU69 56 aa7.36□□□□□ -1.23
CIRBP-241ENST00000593048 LCA10Q71F78 164 aa7.34□□□□□ -1.23
CIRBP-241ENST00000593048 PSPHP1O15172 72 aa7.33□□□□□ -1.24
CIRBP-241ENST00000593048 Q5VV11 94 aa7.33□□□□□ -1.24
CIRBP-241ENST00000593048 A6NN06 94 aa7.29□□□□□ -1.24
CIRBP-241ENST00000593048 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.29□□□□□ -1.24
CIRBP-241ENST00000593048 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.25□□□□□ -1.25
CIRBP-241ENST00000593048 MT1BP07438 61 aa7.25□□□□□ -1.25
CIRBP-241ENST00000593048 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.25□□□□□ -1.25
CIRBP-241ENST00000593048 H0YAA0 97 aa7.22□□□□□ -1.25
CIRBP-241ENST00000593048 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.22□□□□□ -1.25
CIRBP-241ENST00000593048 UQCR11O14957 56 aa7.2□□□□□ -1.26
CIRBP-241ENST00000593048 A6NED7 52 aa7.19□□□□□ -1.26
CIRBP-241ENST00000593048 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa7.14□□□□□ -1.27
CIRBP-241ENST00000593048 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.14□□□□□ -1.27
CIRBP-241ENST00000593048 KRTAP10-5P60370 271 aa7.13□□□□□ -1.27
CIRBP-241ENST00000593048 A0A1B0GU33 70 aa7.12□□□□□ -1.27
CIRBP-241ENST00000593048 BRK1Q8WUW1 75 aa7.12□□□□□ -1.27
CIRBP-241ENST00000593048 CRIPTQ9P021 101 aa7.12□□□□□ -1.27
CIRBP-241ENST00000593048 PRO0628Q9UI54 55 aa7.11□□□□□ -1.27
CIRBP-241ENST00000593048 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.1□□□□□ -1.27
CIRBP-241ENST00000593048 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.07□□□□□ -1.28
CIRBP-241ENST00000593048 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.05□□□□□ -1.28
CIRBP-241ENST00000593048 KRTAP5-9P26371 169 aa7.04□□□□□ -1.28
CIRBP-241ENST00000593048 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.02□□□□□ -1.29
CIRBP-241ENST00000593048 M0QZ58 72 aa7□□□□□ -1.29
CIRBP-241ENST00000593048 KMT2DO14686 5537 aa6.98□□□□□ -1.29
CIRBP-241ENST00000593048 MDN1Q9NU22 5596 aa6.95□□□□□ -1.3
CIRBP-241ENST00000593048 P0C880 135 aa6.94□□□□□ -1.3
CIRBP-241ENST00000593048 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.87□□□□□ -1.31
CIRBP-241ENST00000593048 K7ERS5 55 aa6.86□□□□□ -1.31
CIRBP-241ENST00000593048 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.85□□□□□ -1.31
CIRBP-241ENST00000593048 PLAC4Q8WY50 150 aa6.85□□□□□ -1.31
CIRBP-241ENST00000593048 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.85□□□□□ -1.31
CIRBP-241ENST00000593048 R4GN34 69 aa6.84□□□□□ -1.31
CIRBP-241ENST00000593048 A8MU10 97 aa6.82□□□□□ -1.32
CIRBP-241ENST00000593048 PMAIP1Q13794 54 aa6.79□□□□□ -1.32
CIRBP-241ENST00000593048 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.79□□□□□ -1.32
CIRBP-241ENST00000593048 MT1XP80297 61 aa6.77□□□□□ -1.33
CIRBP-241ENST00000593048 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.75□□□□□ -1.33
CIRBP-241ENST00000593048 SPRR2EP22531 72 aa6.69□□□□□ -1.34
CIRBP-241ENST00000593048 SPRR2BP35325 72 aa6.69□□□□□ -1.34
CIRBP-241ENST00000593048 SPRR2AP35326 72 aa6.69□□□□□ -1.34
CIRBP-241ENST00000593048 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.69□□□□□ -1.34
CIRBP-241ENST00000593048 LINC01554Q52M75 96 aa6.68□□□□□ -1.34
CIRBP-241ENST00000593048 A0A0D9SG42 100 aa6.67□□□□□ -1.34
CIRBP-241ENST00000593048 SVIPQ8NHG7 77 aa6.67□□□□□ -1.34
CIRBP-241ENST00000593048 KRTAP12-2P59991 146 aa6.63□□□□□ -1.35
CIRBP-241ENST00000593048 KRTAP12-1P59990 96 aa6.62□□□□□ -1.35
CIRBP-241ENST00000593048 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.6□□□□□ -1.35
CIRBP-241ENST00000593048 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.6□□□□□ -1.35
CIRBP-241ENST00000593048 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.58□□□□□ -1.36
CIRBP-241ENST00000593048 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.57□□□□□ -1.36
CIRBP-241ENST00000593048 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.56□□□□□ -1.36
CIRBP-241ENST00000593048 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.53□□□□□ -1.36
CIRBP-241ENST00000593048 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.53□□□□□ -1.36
CIRBP-241ENST00000593048 ROMO1P60602 79 aa6.49□□□□□ -1.37
CIRBP-241ENST00000593048 SPRR2DP22532 72 aa6.47□□□□□ -1.37
CIRBP-241ENST00000593048 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CIRBP-241ENST00000593048 KRTAP10-12P60413 245 aa6.42□□□□□ -1.38
CIRBP-241ENST00000593048 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.39□□□□□ -1.39
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