RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592944.1

ITGA2B-210, Transcript of integrin subunit alpha 2b, humanhuman

TSL 5

Gene ITGA2B, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2B-210ENST00000592944 C20orf197Q8N268 126 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA2B-210ENST00000592944 MP68P56378 58 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA2B-210ENST00000592944 S4R3F8 94 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA2B-210ENST00000592944 LINC00208Q96KT6 92 aa7.44□□□□□ -1.22
ITGA2B-210ENST00000592944 C5orf47Q569G3 176 aa7.42□□□□□ -1.22
ITGA2B-210ENST00000592944 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.42□□□□□ -1.22
ITGA2B-210ENST00000592944 FSIP2Q5CZC0 6907 aa7.4□□□□□ -1.23
ITGA2B-210ENST00000592944 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.39□□□□□ -1.23
ITGA2B-210ENST00000592944 H3BPC8 53 aa7.38□□□□□ -1.23
ITGA2B-210ENST00000592944 H7BZZ5 65 aa7.38□□□□□ -1.23
ITGA2B-210ENST00000592944 LCA10Q71F78 164 aa7.38□□□□□ -1.23
ITGA2B-210ENST00000592944 CSAG1Q6PB30 78 aa7.36□□□□□ -1.23
ITGA2B-210ENST00000592944 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.34□□□□□ -1.23
ITGA2B-210ENST00000592944 A8MUN3 132 aa7.32□□□□□ -1.24
ITGA2B-210ENST00000592944 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.32□□□□□ -1.24
ITGA2B-210ENST00000592944 SNURFQ9Y675 71 aa7.31□□□□□ -1.24
ITGA2B-210ENST00000592944 LCE2BO14633 110 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGA2B-210ENST00000592944 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGA2B-210ENST00000592944 USH2AO75445 5202 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGA2B-210ENST00000592944 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.18□□□□□ -1.26
ITGA2B-210ENST00000592944 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.17□□□□□ -1.26
ITGA2B-210ENST00000592944 DMAC1Q96GE9 116 aa7.17□□□□□ -1.26
ITGA2B-210ENST00000592944 SSPOA2VEC9 5147 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGA2B-210ENST00000592944 H0YAA0 97 aa7.11□□□□□ -1.27
ITGA2B-210ENST00000592944 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.1□□□□□ -1.27
ITGA2B-210ENST00000592944 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.07□□□□□ -1.28
ITGA2B-210ENST00000592944 CRIPTQ9P021 101 aa7.06□□□□□ -1.28
ITGA2B-210ENST00000592944 ACYP2P14621 99 aa7.05□□□□□ -1.28
ITGA2B-210ENST00000592944 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa7.03□□□□□ -1.28
ITGA2B-210ENST00000592944 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.02□□□□□ -1.29
ITGA2B-210ENST00000592944 V9GYY9 64 aa7.02□□□□□ -1.29
ITGA2B-210ENST00000592944 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.99□□□□□ -1.29
ITGA2B-210ENST00000592944 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
ITGA2B-210ENST00000592944 Q5VV11 94 aa6.98□□□□□ -1.29
ITGA2B-210ENST00000592944 Q1T7F1 81 aa6.95□□□□□ -1.3
ITGA2B-210ENST00000592944 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.95□□□□□ -1.3
ITGA2B-210ENST00000592944 MT1BP07438 61 aa6.94□□□□□ -1.3
ITGA2B-210ENST00000592944 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.93□□□□□ -1.3
ITGA2B-210ENST00000592944 SVIPQ8NHG7 77 aa6.93□□□□□ -1.3
ITGA2B-210ENST00000592944 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
ITGA2B-210ENST00000592944 P0C880 135 aa6.88□□□□□ -1.31
ITGA2B-210ENST00000592944 COA5Q86WW8 74 aa6.87□□□□□ -1.31
ITGA2B-210ENST00000592944 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.85□□□□□ -1.31
ITGA2B-210ENST00000592944 R4GN34 69 aa6.84□□□□□ -1.31
ITGA2B-210ENST00000592944 A6NN06 94 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA2B-210ENST00000592944 M0QZ58 72 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGA2B-210ENST00000592944 PRO0628Q9UI54 55 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA2B-210ENST00000592944 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.75□□□□□ -1.33
ITGA2B-210ENST00000592944 KRTAP10-5P60370 271 aa6.75□□□□□ -1.33
ITGA2B-210ENST00000592944 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.74□□□□□ -1.33
ITGA2B-210ENST00000592944 PLAC4Q8WY50 150 aa6.7□□□□□ -1.34
ITGA2B-210ENST00000592944 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
ITGA2B-210ENST00000592944 BRK1Q8WUW1 75 aa6.69□□□□□ -1.34
ITGA2B-210ENST00000592944 PSPHP1O15172 72 aa6.67□□□□□ -1.34
ITGA2B-210ENST00000592944 LINC01554Q52M75 96 aa6.67□□□□□ -1.34
ITGA2B-210ENST00000592944 PRR15LQ9BU68 103 aa6.67□□□□□ -1.34
ITGA2B-210ENST00000592944 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.62□□□□□ -1.35
ITGA2B-210ENST00000592944 SEC61GP60059 68 aa6.59□□□□□ -1.35
ITGA2B-210ENST00000592944 A6NED7 52 aa6.56□□□□□ -1.36
ITGA2B-210ENST00000592944 MT1XP80297 61 aa6.56□□□□□ -1.36
ITGA2B-210ENST00000592944 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
ITGA2B-210ENST00000592944 A0A1B0GU69 56 aa6.54□□□□□ -1.36
ITGA2B-210ENST00000592944 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.54□□□□□ -1.36
ITGA2B-210ENST00000592944 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.53□□□□□ -1.36
ITGA2B-210ENST00000592944 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.5□□□□□ -1.37
ITGA2B-210ENST00000592944 A0A1B0GU33 70 aa6.43□□□□□ -1.38
ITGA2B-210ENST00000592944 UQCR11O14957 56 aa6.43□□□□□ -1.38
ITGA2B-210ENST00000592944 KRTAP12-2P59991 146 aa6.39□□□□□ -1.39
ITGA2B-210ENST00000592944 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.38□□□□□ -1.39
ITGA2B-210ENST00000592944 PMAIP1Q13794 54 aa6.36□□□□□ -1.39
ITGA2B-210ENST00000592944 A0A0D9SG42 100 aa6.34□□□□□ -1.39
ITGA2B-210ENST00000592944 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.34□□□□□ -1.39
ITGA2B-210ENST00000592944 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.33□□□□□ -1.4
ITGA2B-210ENST00000592944 KRTAP5-9P26371 169 aa6.32□□□□□ -1.4
ITGA2B-210ENST00000592944 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
ITGA2B-210ENST00000592944 KMT2DO14686 5537 aa6.25□□□□□ -1.41
ITGA2B-210ENST00000592944 A8MU10 97 aa6.25□□□□□ -1.41
ITGA2B-210ENST00000592944 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.25□□□□□ -1.41
ITGA2B-210ENST00000592944 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.25□□□□□ -1.41
ITGA2B-210ENST00000592944 KRTAP10-12P60413 245 aa6.24□□□□□ -1.41
ITGA2B-210ENST00000592944 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.24□□□□□ -1.41
ITGA2B-210ENST00000592944 KRTAP12-1P59990 96 aa6.23□□□□□ -1.41
ITGA2B-210ENST00000592944 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.2□□□□□ -1.42
ITGA2B-210ENST00000592944 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.19□□□□□ -1.42
ITGA2B-210ENST00000592944 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.19□□□□□ -1.42
ITGA2B-210ENST00000592944 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.19□□□□□ -1.42
ITGA2B-210ENST00000592944 NEBP20929 6669 aa6.16□□□□□ -1.42
ITGA2B-210ENST00000592944 K7ERS5 55 aa6.13□□□□□ -1.43
ITGA2B-210ENST00000592944 MDN1Q9NU22 5596 aa6.13□□□□□ -1.43
ITGA2B-210ENST00000592944 SPRR2EP22531 72 aa6.05□□□□□ -1.44
ITGA2B-210ENST00000592944 SPRR2BP35325 72 aa6.05□□□□□ -1.44
ITGA2B-210ENST00000592944 SPRR2AP35326 72 aa6.05□□□□□ -1.44
ITGA2B-210ENST00000592944 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.99□□□□□ -1.45
ITGA2B-210ENST00000592944 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.95□□□□□ -1.46
ITGA2B-210ENST00000592944 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.92□□□□□ -1.46
ITGA2B-210ENST00000592944 TNP1P09430 55 aa5.9□□□□□ -1.46
ITGA2B-210ENST00000592944 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.86□□□□□ -1.47
ITGA2B-210ENST00000592944 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.85□□□□□ -1.47
ITGA2B-210ENST00000592944 SPRR2DP22532 72 aa5.85□□□□□ -1.47
ITGA2B-210ENST00000592944 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms