RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588707.5

GTF3C2-AS1-205, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 607 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 COA5Q86WW8 74 aa3.76□□□□□ -1.81
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MT1HP80294 61 aa3.74□□□□□ -1.81
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.73□□□□□ -1.81
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.73□□□□□ -1.81
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.72□□□□□ -1.81
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MPLKIPQ8TAP9 179 aa3.71□□□□□ -1.82
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 V9GYY9 64 aa3.7□□□□□ -1.82
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.69□□□□□ -1.82
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa3.69□□□□□ -1.82
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LORP23490 312 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 M0R2T5 61 aa3.66□□□□□ -1.82
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 S4R3F8 94 aa3.66□□□□□ -1.82
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 Q1T7F1 81 aa3.65□□□□□ -1.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.63□□□□□ -1.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SEC61GP60059 68 aa3.62□□□□□ -1.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LCA10Q71F78 164 aa3.62□□□□□ -1.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PRR15LQ9BU68 103 aa3.62□□□□□ -1.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.62□□□□□ -1.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CSAG1Q6PB30 78 aa3.6□□□□□ -1.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 A0A1B0GU69 56 aa3.59□□□□□ -1.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.58□□□□□ -1.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa3.58□□□□□ -1.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PSPHP1O15172 72 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 H0YAA0 97 aa3.53□□□□□ -1.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.53□□□□□ -1.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 Q5VV11 94 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 UQCR11O14957 56 aa3.49□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 A0A1B0GU33 70 aa3.48□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 A6NED7 52 aa3.48□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MT2AP02795 61 aa3.48□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.48□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MT1FP04733 61 aa3.46□□□□□ -1.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SVIPQ8NHG7 77 aa3.45□□□□□ -1.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP10-10P60014 251 aa3.43□□□□□ -1.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.43□□□□□ -1.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa3.43□□□□□ -1.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 M0QZ58 72 aa3.42□□□□□ -1.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LCE2BO14633 110 aa3.42□□□□□ -1.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 P0C880 135 aa3.42□□□□□ -1.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 BRK1Q8WUW1 75 aa3.42□□□□□ -1.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.42□□□□□ -1.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.42□□□□□ -1.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 USH2AO75445 5202 aa3.42□□□□□ -1.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.41□□□□□ -1.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CRIPTQ9P021 101 aa3.41□□□□□ -1.86
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SSPOA2VEC9 5147 aa3.4□□□□□ -1.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 R4GN34 69 aa3.39□□□□□ -1.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.37□□□□□ -1.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 K7ERS5 55 aa3.35□□□□□ -1.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PRO0628Q9UI54 55 aa3.35□□□□□ -1.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.34□□□□□ -1.87
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.32□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 A0A0D9SG42 100 aa3.3□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 A8MU10 97 aa3.3□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.29□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 A6NN06 94 aa3.28□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LINC01554Q52M75 96 aa3.28□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.27□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PMAIP1Q13794 54 aa3.25□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.25□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP12-1P59990 96 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP12-2P59991 146 aa3.21□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PLAC4Q8WY50 150 aa3.21□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.18□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.18□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MT1BP07438 61 aa3.16□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ROMO1P60602 79 aa3.14□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.14□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.11□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP10-5P60370 271 aa3.09□□□□□ -1.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.08□□□□□ -1.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.04□□□□□ -1.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.04□□□□□ -1.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TNP1P09430 55 aa3.03□□□□□ -1.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MT1XP80297 61 aa3□□□□□ -1.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP5-9P26371 169 aa2.99□□□□□ -1.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.97□□□□□ -1.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PP632Q6XCG6 107 aa2.97□□□□□ -1.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PRAC1Q96KF2 57 aa2.97□□□□□ -1.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP23-1A1A580 65 aa2.96□□□□□ -1.94
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.93□□□□□ -1.94
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KMT2DO14686 5537 aa2.92□□□□□ -1.94
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SPRR2FQ96RM1 72 aa2.91□□□□□ -1.94
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP10-12P60413 245 aa2.89□□□□□ -1.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NEBP20929 6669 aa2.89□□□□□ -1.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2.88□□□□□ -1.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MDN1Q9NU22 5596 aa2.88□□□□□ -1.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa2.86□□□□□ -1.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SPRR2EP22531 72 aa2.86□□□□□ -1.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SPRR2BP35325 72 aa2.86□□□□□ -1.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SPRR2AP35326 72 aa2.86□□□□□ -1.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms