RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587914.1

EFTUD2-208, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-208ENST00000587914 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.96□□□□□ -1.78
EFTUD2-208ENST00000587914 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3.96□□□□□ -1.78
EFTUD2-208ENST00000587914 RETNLBQ9BQ08 111 aa3.94□□□□□ -1.78
EFTUD2-208ENST00000587914 RYR2Q92736 4967 aa3.94□□□□□ -1.78
EFTUD2-208ENST00000587914 APOBP04114 4563 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
EFTUD2-208ENST00000587914 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.92□□□□□ -1.78
EFTUD2-208ENST00000587914 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa3.91□□□□□ -1.78
EFTUD2-208ENST00000587914 A6NED7 52 aa3.91□□□□□ -1.78
EFTUD2-208ENST00000587914 KRTAP10-8P60410 259 aa3.91□□□□□ -1.78
EFTUD2-208ENST00000587914 PKHD1P08F94 4074 aa3.9□□□□□ -1.78
EFTUD2-208ENST00000587914 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.9□□□□□ -1.79
EFTUD2-208ENST00000587914 NDUFAF8A1L188 74 aa3.89□□□□□ -1.79
EFTUD2-208ENST00000587914 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa3.89□□□□□ -1.79
EFTUD2-208ENST00000587914 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.89□□□□□ -1.79
EFTUD2-208ENST00000587914 Q5VSD8 79 aa3.88□□□□□ -1.79
EFTUD2-208ENST00000587914 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.88□□□□□ -1.79
EFTUD2-208ENST00000587914 A0A1B0GU69 56 aa3.87□□□□□ -1.79
EFTUD2-208ENST00000587914 C9orf92A6NGG3 77 aa3.87□□□□□ -1.79
EFTUD2-208ENST00000587914 RYR3Q15413 4870 aa3.87□□□□□ -1.79
EFTUD2-208ENST00000587914 LCA10Q71F78 164 aa3.86□□□□□ -1.79
EFTUD2-208ENST00000587914 FAT1Q14517 4588 aa3.85□□□□□ -1.79
EFTUD2-208ENST00000587914 SPINK7P58062 85 aa3.84□□□□□ -1.79
EFTUD2-208ENST00000587914 UQCR11O14957 56 aa3.81□□□□□ -1.8
EFTUD2-208ENST00000587914 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
EFTUD2-208ENST00000587914 PMAIP1Q13794 54 aa3.81□□□□□ -1.8
EFTUD2-208ENST00000587914 COX6B2Q6YFQ2 88 aa3.81□□□□□ -1.8
EFTUD2-208ENST00000587914 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.8□□□□□ -1.8
EFTUD2-208ENST00000587914 A8MU10 97 aa3.79□□□□□ -1.8
EFTUD2-208ENST00000587914 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
EFTUD2-208ENST00000587914 RYR1P21817 5038 aa3.77□□□□□ -1.81
EFTUD2-208ENST00000587914 A6NN06 94 aa3.77□□□□□ -1.81
EFTUD2-208ENST00000587914 MT1HL1P0DM35 61 aa3.77□□□□□ -1.81
EFTUD2-208ENST00000587914 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.77□□□□□ -1.81
EFTUD2-208ENST00000587914 HSPG2P98160 4391 aa3.77□□□□□ -1.81
EFTUD2-208ENST00000587914 FAT3Q8TDW7 4589 aa3.75□□□□□ -1.81
EFTUD2-208ENST00000587914 TNXBP22105 4242 aa3.74□□□□□ -1.81
EFTUD2-208ENST00000587914 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.74□□□□□ -1.81
EFTUD2-208ENST00000587914 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
EFTUD2-208ENST00000587914 TPRXLQ17RH7 258 aa3.72□□□□□ -1.81
EFTUD2-208ENST00000587914 BIRC6Q9NR09 4857 aa3.7□□□□□ -1.82
EFTUD2-208ENST00000587914 A0A1B0GU33 70 aa3.69□□□□□ -1.82
EFTUD2-208ENST00000587914 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.68□□□□□ -1.82
EFTUD2-208ENST00000587914 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
EFTUD2-208ENST00000587914 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.66□□□□□ -1.82
EFTUD2-208ENST00000587914 S4R3F8 94 aa3.66□□□□□ -1.82
EFTUD2-208ENST00000587914 KIAA1109Q2LD37 5005 aa3.64□□□□□ -1.83
EFTUD2-208ENST00000587914 H0YAA0 97 aa3.64□□□□□ -1.83
EFTUD2-208ENST00000587914 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.64□□□□□ -1.83
EFTUD2-208ENST00000587914 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa3.62□□□□□ -1.83
EFTUD2-208ENST00000587914 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
EFTUD2-208ENST00000587914 K7ERS5 55 aa3.6□□□□□ -1.83
EFTUD2-208ENST00000587914 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
EFTUD2-208ENST00000587914 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.58□□□□□ -1.84
EFTUD2-208ENST00000587914 MYCBP2O75592 4640 aa3.57□□□□□ -1.84
EFTUD2-208ENST00000587914 HERC2O95714 4834 aa3.57□□□□□ -1.84
EFTUD2-208ENST00000587914 CSAG1Q6PB30 78 aa3.57□□□□□ -1.84
EFTUD2-208ENST00000587914 MT3P25713 68 aa3.56□□□□□ -1.84
EFTUD2-208ENST00000587914 M0QZ58 72 aa3.51□□□□□ -1.85
EFTUD2-208ENST00000587914 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.51□□□□□ -1.85
EFTUD2-208ENST00000587914 PCLOQ9Y6V0 5065 aa3.49□□□□□ -1.85
EFTUD2-208ENST00000587914 P0C880 135 aa3.49□□□□□ -1.85
EFTUD2-208ENST00000587914 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.48□□□□□ -1.85
EFTUD2-208ENST00000587914 ROMO1P60602 79 aa3.46□□□□□ -1.86
EFTUD2-208ENST00000587914 LRP2P98164 4655 aa3.44□□□□□ -1.86
EFTUD2-208ENST00000587914 LINC01554Q52M75 96 aa3.44□□□□□ -1.86
EFTUD2-208ENST00000587914 A0A0D9SG42 100 aa3.43□□□□□ -1.86
EFTUD2-208ENST00000587914 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.43□□□□□ -1.86
EFTUD2-208ENST00000587914 ABCA13Q86UQ4 5058 aa3.43□□□□□ -1.86
EFTUD2-208ENST00000587914 MUC17Q685J3 4493 aa3.41□□□□□ -1.86
EFTUD2-208ENST00000587914 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.41□□□□□ -1.86
EFTUD2-208ENST00000587914 KRTAP12-1P59990 96 aa3.4□□□□□ -1.87
EFTUD2-208ENST00000587914 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.4□□□□□ -1.87
EFTUD2-208ENST00000587914 KRTAP12-2P59991 146 aa3.38□□□□□ -1.87
EFTUD2-208ENST00000587914 R4GN34 69 aa3.37□□□□□ -1.87
EFTUD2-208ENST00000587914 LPAP08519 4548 aa3.37□□□□□ -1.87
EFTUD2-208ENST00000587914 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.36□□□□□ -1.87
EFTUD2-208ENST00000587914 HERC1Q15751 4861 aa3.35□□□□□ -1.87
EFTUD2-208ENST00000587914 CRIPTQ9P021 101 aa3.34□□□□□ -1.87
EFTUD2-208ENST00000587914 LUZP6Q538Z0 58 aa3.33□□□□□ -1.88
EFTUD2-208ENST00000587914 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.27□□□□□ -1.89
EFTUD2-208ENST00000587914 LCE1FQ5T754 118 aa3.23□□□□□ -1.89
EFTUD2-208ENST00000587914 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.23□□□□□ -1.89
EFTUD2-208ENST00000587914 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
EFTUD2-208ENST00000587914 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.2□□□□□ -1.9
EFTUD2-208ENST00000587914 PP632Q6XCG6 107 aa3.18□□□□□ -1.9
EFTUD2-208ENST00000587914 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.17□□□□□ -1.9
EFTUD2-208ENST00000587914 MT1HP80294 61 aa3.15□□□□□ -1.91
EFTUD2-208ENST00000587914 UBR4Q5T4S7 5183 aa3.14□□□□□ -1.91
EFTUD2-208ENST00000587914 M0R2T5 61 aa3.13□□□□□ -1.91
EFTUD2-208ENST00000587914 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
EFTUD2-208ENST00000587914 PLAC4Q8WY50 150 aa3.11□□□□□ -1.91
EFTUD2-208ENST00000587914 TNP1P09430 55 aa3.09□□□□□ -1.91
EFTUD2-208ENST00000587914 MUC2Q02817 5179 aa3.09□□□□□ -1.92
EFTUD2-208ENST00000587914 MT2AP02795 61 aa3.08□□□□□ -1.92
EFTUD2-208ENST00000587914 RNF213Q63HN8 5207 aa3.08□□□□□ -1.92
EFTUD2-208ENST00000587914 KRTAP10-10P60014 251 aa3.06□□□□□ -1.92
EFTUD2-208ENST00000587914 MT1FP04733 61 aa3.05□□□□□ -1.92
EFTUD2-208ENST00000587914 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.05□□□□□ -1.92
EFTUD2-208ENST00000587914 KRTAP10-12P60413 245 aa3.04□□□□□ -1.92
EFTUD2-208ENST00000587914 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.01□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms