RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	C20orf197	Q8N268	126 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GPS1-223	ENST00000584229	NDUFC1	O43677	76 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GPS1-223	ENST00000584229	DMAC1	Q96GE9	116 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		11.6	□□□□□ -0.55
GPS1-223	ENST00000584229	COX7C	P15954	63 aa		11.56	□□□□□ -0.56
GPS1-223	ENST00000584229	ACYP2	P14621	99 aa		11.52	□□□□□ -0.57
GPS1-223	ENST00000584229	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		11.5	□□□□□ -0.57
GPS1-223	ENST00000584229	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		11.49	□□□□□ -0.57
GPS1-223	ENST00000584229	LCE2B	O14633	110 aa		11.48	□□□□□ -0.57
GPS1-223	ENST00000584229	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		11.48	□□□□□ -0.57
GPS1-223	ENST00000584229	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		11.44	□□□□□ -0.58
GPS1-223	ENST00000584229	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		11.4	□□□□□ -0.58
GPS1-223	ENST00000584229	USH2A	O75445	5202 aa		11.37	□□□□□ -0.59
GPS1-223	ENST00000584229		H0YAA0	97 aa		11.36	□□□□□ -0.59
GPS1-223	ENST00000584229	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		11.36	□□□□□ -0.59
GPS1-223	ENST00000584229	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		11.32	□□□□□ -0.6
GPS1-223	ENST00000584229	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		11.29	□□□□□ -0.6
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		11.26	□□□□□ -0.61
GPS1-223	ENST00000584229		H7BZZ5	65 aa		11.24	□□□□□ -0.61
GPS1-223	ENST00000584229	CRIPT	Q9P021	101 aa		11.23	□□□□□ -0.61
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC179	H3BU77	68 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GPS1-223	ENST00000584229	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GPS1-223	ENST00000584229	COA5	Q86WW8	74 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GPS1-223	ENST00000584229	SSPO	A2VEC9	5147 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GPS1-223	ENST00000584229		P0C880	135 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GPS1-223	ENST00000584229		Q5VV11	94 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		11.05	□□□□□ -0.64
GPS1-223	ENST00000584229		R4GN34	69 aa		11.05	□□□□□ -0.64
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		11.03	□□□□□ -0.64
GPS1-223	ENST00000584229		M0QZ58	72 aa		10.99	□□□□□ -0.65
GPS1-223	ENST00000584229	MT1B	P07438	61 aa		10.99	□□□□□ -0.65
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		10.97	□□□□□ -0.65
GPS1-223	ENST00000584229	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	10.9	□□□□□ -0.66
GPS1-223	ENST00000584229	LINC01554	Q52M75	96 aa		10.86	□□□□□ -0.67
GPS1-223	ENST00000584229	SEC61G	P60059	68 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GPS1-223	ENST00000584229	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM258	P61165	79 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GPS1-223	ENST00000584229	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GPS1-223	ENST00000584229		A6NN06	94 aa		10.76	□□□□□ -0.69
GPS1-223	ENST00000584229	PLAC4	Q8WY50	150 aa		10.75	□□□□□ -0.69
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP10-5	P60370	271 aa		10.64	□□□□□ -0.71
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1B0GU69	56 aa		10.61	□□□□□ -0.71
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		10.58	□□□□□ -0.72
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1B0GU33	70 aa		10.53	□□□□□ -0.72
GPS1-223	ENST00000584229	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		10.52	□□□□□ -0.73
GPS1-223	ENST00000584229	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
GPS1-223	ENST00000584229	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		10.47	□□□□□ -0.73
GPS1-223	ENST00000584229	PRR15L	Q9BU68	103 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GPS1-223	ENST00000584229		A0A0D9SG42	100 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GPS1-223	ENST00000584229	MT1X	P80297	61 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GPS1-223	ENST00000584229	PCP4	P48539	62 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GPS1-223	ENST00000584229	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		10.38	□□□□□ -0.75
GPS1-223	ENST00000584229	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		10.28	□□□□□ -0.76
GPS1-223	ENST00000584229	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
GPS1-223	ENST00000584229	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GPS1-223	ENST00000584229	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GPS1-223	ENST00000584229		A8MU10	97 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP12-1	P59990	96 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GPS1-223	ENST00000584229		V9GYY9	64 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GPS1-223	ENST00000584229	UQCR11	O14957	56 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP12-2	P59991	146 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GPS1-223	ENST00000584229	PSPHP1	O15172	72 aa		10.04	□□□□□ -0.8
GPS1-223	ENST00000584229		Q1T7F1	81 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
GPS1-223	ENST00000584229	KMT2D	O14686	5537 aa		9.93	□□□□□ -0.82
GPS1-223	ENST00000584229	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	9.92	□□□□□ -0.82
GPS1-223	ENST00000584229	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		9.91	□□□□□ -0.82
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		9.9	□□□□□ -0.82
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP10-12	P60413	245 aa		9.89	□□□□□ -0.83
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		9.85	□□□□□ -0.83
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		9.85	□□□□□ -0.83
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP5-9	P26371	169 aa		9.82	□□□□□ -0.84
GPS1-223	ENST00000584229	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		9.78	□□□□□ -0.84
GPS1-223	ENST00000584229		A6NED7	52 aa		9.75	□□□□□ -0.85
GPS1-223	ENST00000584229	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		9.67	□□□□□ -0.86
GPS1-223	ENST00000584229		K7ERS5	55 aa		9.67	□□□□□ -0.86
GPS1-223	ENST00000584229	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		9.63	□□□□□ -0.87
GPS1-223	ENST00000584229	NEB	P20929	6669 aa		9.57	□□□□□ -0.88
GPS1-223	ENST00000584229	TNP1	P09430	55 aa		9.56	□□□□□ -0.88
GPS1-223	ENST00000584229	SPRR2E	P22531	72 aa		9.52	□□□□□ -0.89
GPS1-223	ENST00000584229	SPRR2B	P35325	72 aa		9.52	□□□□□ -0.89
GPS1-223	ENST00000584229	SPRR2A	P35326	72 aa		9.52	□□□□□ -0.89
GPS1-223	ENST00000584229	MDN1	Q9NU22	5596 aa		9.45	□□□□□ -0.9
GPS1-223	ENST00000584229	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GPS1-223	ENST00000584229	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		9.34	□□□□□ -0.91
GPS1-223	ENST00000584229	LCE3A	Q5TA76	89 aa		9.33	□□□□□ -0.92
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		9.3	□□□□□ -0.92
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		9.27	□□□□□ -0.93
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		9.23	□□□□□ -0.93
GPS1-223	ENST00000584229	MT1E	P04732	61 aa		9.22	□□□□□ -0.93
GPS1-223	ENST00000584229	SPRR2D	P22532	72 aa		9.2	□□□□□ -0.94
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GPS1-223	ENST00000584229	ROMO1	P60602	79 aa		9.06	□□□□□ -0.96
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		9.05	□□□□□ -0.96
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		9.04	□□□□□ -0.96

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