RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567987.5

INO80E-211, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene INO80E, Length 1,926 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-211ENST00000567987 PRO0628Q9UI54 55 aa9.58□□□□□ -0.88
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INO80E-211ENST00000567987 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.26□□□□□ -1.25
INO80E-211ENST00000567987 KMT2DO14686 5537 aa7.26□□□□□ -1.25
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INO80E-211ENST00000567987 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
INO80E-211ENST00000567987 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.98□□□□□ -1.29
INO80E-211ENST00000567987 NDUFAF8A1L188 74 aa6.97□□□□□ -1.29
INO80E-211ENST00000567987 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
INO80E-211ENST00000567987 MT1EP04732 61 aa6.85□□□□□ -1.31
INO80E-211ENST00000567987 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.78□□□□□ -1.32
INO80E-211ENST00000567987 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.73□□□□□ -1.33
INO80E-211ENST00000567987 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.72□□□□□ -1.33
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