RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559573.3

FAM227B-208, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, human

TSL 3

Gene FAM227B, Length 2,204 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM227B-208	ENST00000559573	LINC01554	Q52M75	96 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FAM227B-208	ENST00000559573	PCOTH	Q58A44	107 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FAM227B-208	ENST00000559573	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		5.62	□□□□□ -1.51
FAM227B-208	ENST00000559573		H3BS24	57 aa		5.62	□□□□□ -1.51
FAM227B-208	ENST00000559573	HRES1	P13985	223 aa		5.62	□□□□□ -1.51
FAM227B-208	ENST00000559573	PRAC1	Q96KF2	57 aa		5.6	□□□□□ -1.51
FAM227B-208	ENST00000559573	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		5.59	□□□□□ -1.51
FAM227B-208	ENST00000559573	TPRXL	Q17RH7	258 aa		5.56	□□□□□ -1.52
FAM227B-208	ENST00000559573	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		5.55	□□□□□ -1.52
FAM227B-208	ENST00000559573	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		5.55	□□□□□ -1.52
FAM227B-208	ENST00000559573	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
FAM227B-208	ENST00000559573	XP32	Q5T750	250 aa		5.53	□□□□□ -1.52
FAM227B-208	ENST00000559573	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		5.52	□□□□□ -1.53
FAM227B-208	ENST00000559573	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		5.51	□□□□□ -1.53
FAM227B-208	ENST00000559573	MUC17	Q685J3	4493 aa		5.5	□□□□□ -1.53
FAM227B-208	ENST00000559573	ACYP2	P14621	99 aa		5.49	□□□□□ -1.53
FAM227B-208	ENST00000559573		Q96NJ1	140 aa		5.48	□□□□□ -1.53
FAM227B-208	ENST00000559573	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
FAM227B-208	ENST00000559573		A0A1B0GVX0	72 aa		5.46	□□□□□ -1.54
FAM227B-208	ENST00000559573	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		5.46	□□□□□ -1.54
FAM227B-208	ENST00000559573		A0A1B0GU69	56 aa		5.44	□□□□□ -1.54
FAM227B-208	ENST00000559573	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		5.44	□□□□□ -1.54
FAM227B-208	ENST00000559573	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		5.43	□□□□□ -1.54
FAM227B-208	ENST00000559573	UQCR11	O14957	56 aa		5.42	□□□□□ -1.54
FAM227B-208	ENST00000559573	CSAG1	Q6PB30	78 aa		5.42	□□□□□ -1.54
FAM227B-208	ENST00000559573	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		5.42	□□□□□ -1.54
FAM227B-208	ENST00000559573	DMAC1	Q96GE9	116 aa		5.41	□□□□□ -1.54
FAM227B-208	ENST00000559573	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
FAM227B-208	ENST00000559573		Q5W150	140 aa		5.37	□□□□□ -1.55
FAM227B-208	ENST00000559573	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
FAM227B-208	ENST00000559573	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		5.33	□□□□□ -1.56
FAM227B-208	ENST00000559573	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	5.31	□□□□□ -1.56
FAM227B-208	ENST00000559573	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		5.31	□□□□□ -1.56
FAM227B-208	ENST00000559573	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		5.3	□□□□□ -1.56
FAM227B-208	ENST00000559573	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		5.29	□□□□□ -1.56
FAM227B-208	ENST00000559573	IGKV2-30	P06310	120 aa		5.26	□□□□□ -1.57
FAM227B-208	ENST00000559573	ROMO1	P60602	79 aa		5.26	□□□□□ -1.57
FAM227B-208	ENST00000559573	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		5.26	□□□□□ -1.57
FAM227B-208	ENST00000559573	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		5.26	□□□□□ -1.57
FAM227B-208	ENST00000559573	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
FAM227B-208	ENST00000559573		A8MUU9	505 aa		5.25	□□□□□ -1.57
FAM227B-208	ENST00000559573	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		5.23	□□□□□ -1.57
FAM227B-208	ENST00000559573	MT1H	P80294	61 aa		5.2	□□□□□ -1.58
FAM227B-208	ENST00000559573	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		5.19	□□□□□ -1.58
FAM227B-208	ENST00000559573	LCE3B	Q5TA77	95 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FAM227B-208	ENST00000559573	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		5.16	□□□□□ -1.58
FAM227B-208	ENST00000559573		M0R2T5	61 aa		5.13	□□□□□ -1.59
FAM227B-208	ENST00000559573		H0YAA0	97 aa		5.12	□□□□□ -1.59
FAM227B-208	ENST00000559573		P0C880	135 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM227B-208	ENST00000559573	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM227B-208	ENST00000559573		A0A1B0GU33	70 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM227B-208	ENST00000559573	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
FAM227B-208	ENST00000559573	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM227B-208	ENST00000559573	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM227B-208	ENST00000559573	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAM227B-208	ENST00000559573	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		5.03	□□□□□ -1.6
FAM227B-208	ENST00000559573		K7ERS5	55 aa		5.02	□□□□□ -1.61
FAM227B-208	ENST00000559573	USH2A	O75445	5202 aa		5	□□□□□ -1.61
FAM227B-208	ENST00000559573	CRIPT	Q9P021	101 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM227B-208	ENST00000559573	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM227B-208	ENST00000559573	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM227B-208	ENST00000559573	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM227B-208	ENST00000559573	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM227B-208	ENST00000559573	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM227B-208	ENST00000559573	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM227B-208	ENST00000559573	MT2A	P02795	61 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM227B-208	ENST00000559573	MT1F	P04733	61 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM227B-208	ENST00000559573	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM227B-208	ENST00000559573	KRTAP10-10	P60014	251 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM227B-208	ENST00000559573	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.84	□□□□□ -1.64
FAM227B-208	ENST00000559573		A0A0A0MQY5	61 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM227B-208	ENST00000559573	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM227B-208	ENST00000559573	SSPO	A2VEC9	5147 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM227B-208	ENST00000559573	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM227B-208	ENST00000559573	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM227B-208	ENST00000559573		S4R3F8	94 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM227B-208	ENST00000559573	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM227B-208	ENST00000559573	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM227B-208	ENST00000559573		A0A0D9SG42	100 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM227B-208	ENST00000559573	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FAM227B-208	ENST00000559573	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
FAM227B-208	ENST00000559573	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM227B-208	ENST00000559573	KRTAP12-2	P59991	146 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM227B-208	ENST00000559573	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FAM227B-208	ENST00000559573	KRTAP12-1	P59990	96 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM227B-208	ENST00000559573	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM227B-208	ENST00000559573	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM227B-208	ENST00000559573	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.5	□□□□□ -1.69
FAM227B-208	ENST00000559573	MT1B	P07438	61 aa		4.49	□□□□□ -1.69
FAM227B-208	ENST00000559573	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.49	□□□□□ -1.69
FAM227B-208	ENST00000559573	PLAC4	Q8WY50	150 aa		4.48	□□□□□ -1.69
FAM227B-208	ENST00000559573	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		4.47	□□□□□ -1.69
FAM227B-208	ENST00000559573		M0QZ58	72 aa		4.46	□□□□□ -1.69
FAM227B-208	ENST00000559573	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.46	□□□□□ -1.69
FAM227B-208	ENST00000559573	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		4.45	□□□□□ -1.7
FAM227B-208	ENST00000559573	KMT2D	O14686	5537 aa		4.43	□□□□□ -1.7
FAM227B-208	ENST00000559573	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		4.4	□□□□□ -1.7
FAM227B-208	ENST00000559573		R4GN34	69 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FAM227B-208	ENST00000559573	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.33	□□□□□ -1.72
FAM227B-208	ENST00000559573	KRTAP10-5	P60370	271 aa		4.29	□□□□□ -1.72

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