RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 IGKV2-30P06310 120 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-231ENST00000552222 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-231ENST00000552222 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-231ENST00000552222 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-231ENST00000552222 H3BPC8 53 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-231ENST00000552222 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-231ENST00000552222 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-231ENST00000552222 NDUFC1O43677 76 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-231ENST00000552222 MP68P56378 58 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-231ENST00000552222 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-231ENST00000552222 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-231ENST00000552222 FAM236CP0DP71 79 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-231ENST00000552222 SNURFQ9Y675 71 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-231ENST00000552222 H0Y9P7 68 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-231ENST00000552222 H7BZZ5 65 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-231ENST00000552222 TMEM258P61165 79 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-231ENST00000552222 LINC00208Q96KT6 92 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-231ENST00000552222 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-231ENST00000552222 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-231ENST00000552222 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-231ENST00000552222 C4orf26Q17RF5 130 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-231ENST00000552222 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CS-231ENST00000552222 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-231ENST00000552222 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-231ENST00000552222 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-231ENST00000552222 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CS-231ENST00000552222 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-231ENST00000552222 S4R3F8 94 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-231ENST00000552222 KMT2DO14686 5537 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-231ENST00000552222 MDN1Q9NU22 5596 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-231ENST00000552222 A8MUN3 132 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-231ENST00000552222 LCA10Q71F78 164 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-231ENST00000552222 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-231ENST00000552222 DMAC1Q96GE9 116 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-231ENST00000552222 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-231ENST00000552222 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-231ENST00000552222 KRTAP5-9P26371 169 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-231ENST00000552222 CSAG1Q6PB30 78 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-231ENST00000552222 ACYP2P14621 99 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-231ENST00000552222 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-231ENST00000552222 A6NN06 94 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-231ENST00000552222 COA5Q86WW8 74 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-231ENST00000552222 MT1BP07438 61 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-231ENST00000552222 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-231ENST00000552222 Q1T7F1 81 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-231ENST00000552222 V9GYY9 64 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-231ENST00000552222 H0YAA0 97 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-231ENST00000552222 SPRR2EP22531 72 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-231ENST00000552222 SPRR2BP35325 72 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-231ENST00000552222 SPRR2AP35326 72 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-231ENST00000552222 KRTAP10-5P60370 271 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-231ENST00000552222 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-231ENST00000552222 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-231ENST00000552222 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-231ENST00000552222 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-231ENST00000552222 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-231ENST00000552222 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-231ENST00000552222 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-231ENST00000552222 Q5VV11 94 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-231ENST00000552222 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-231ENST00000552222 CRIPTQ9P021 101 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-231ENST00000552222 PRR15LQ9BU68 103 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-231ENST00000552222 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-231ENST00000552222 PSPHP1O15172 72 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-231ENST00000552222 P0C880 135 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-231ENST00000552222 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-231ENST00000552222 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-231ENST00000552222 A0A1B0GU69 56 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-231ENST00000552222 SPRR2DP22532 72 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-231ENST00000552222 SEC61GP60059 68 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-231ENST00000552222 R4GN34 69 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-231ENST00000552222 M0QZ58 72 aa5.93□□□□□ -1.46
CS-231ENST00000552222 A6NED7 52 aa5.91□□□□□ -1.46
CS-231ENST00000552222 LCE3BQ5TA77 95 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-231ENST00000552222 UQCR11O14957 56 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-231ENST00000552222 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-231ENST00000552222 BRK1Q8WUW1 75 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-231ENST00000552222 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-231ENST00000552222 A0A1B0GU33 70 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-231ENST00000552222 LINC01554Q52M75 96 aa5.82□□□□□ -1.48
CS-231ENST00000552222 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.82□□□□□ -1.48
CS-231ENST00000552222 PRO0628Q9UI54 55 aa5.82□□□□□ -1.48
CS-231ENST00000552222 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.8□□□□□ -1.48
CS-231ENST00000552222 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.8□□□□□ -1.48
CS-231ENST00000552222 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.8□□□□□ -1.48
CS-231ENST00000552222 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.8□□□□□ -1.48
CS-231ENST00000552222 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
CS-231ENST00000552222 PLAC4Q8WY50 150 aa5.78□□□□□ -1.48
CS-231ENST00000552222 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.78□□□□□ -1.48
CS-231ENST00000552222 A8MU10 97 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-231ENST00000552222 MT1XP80297 61 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-231ENST00000552222 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-231ENST00000552222 A0A0D9SG42 100 aa5.62□□□□□ -1.51
CS-231ENST00000552222 KRTAP12-2P59991 146 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-231ENST00000552222 KRTAP12-1P59990 96 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-231ENST00000552222 PMAIP1Q13794 54 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-231ENST00000552222 K7ERS5 55 aa5.54□□□□□ -1.52
CS-231ENST00000552222 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.52□□□□□ -1.53
CS-231ENST00000552222 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.52□□□□□ -1.53
CS-231ENST00000552222 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms