RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541434.5

CADM1-211, Transcript of cell adhesion molecule 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CADM1, Length 1,112 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1-211ENST00000541434 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
CADM1-211ENST00000541434 S4R3F8 94 aa7.7□□□□□ -1.18
CADM1-211ENST00000541434 ACYP2P14621 99 aa7.69□□□□□ -1.18
CADM1-211ENST00000541434 PCP4P48539 62 aa7.68□□□□□ -1.18
CADM1-211ENST00000541434 LCA10Q71F78 164 aa7.66□□□□□ -1.18
CADM1-211ENST00000541434 CSAG1Q6PB30 78 aa7.59□□□□□ -1.19
CADM1-211ENST00000541434 TMEM258P61165 79 aa7.56□□□□□ -1.2
CADM1-211ENST00000541434 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa7.55□□□□□ -1.2
CADM1-211ENST00000541434 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CADM1-211ENST00000541434 COA5Q86WW8 74 aa7.52□□□□□ -1.21
CADM1-211ENST00000541434 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CADM1-211ENST00000541434 SPTSSBQ8NFR3 76 aa7.48□□□□□ -1.21
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.45□□□□□ -1.22
CADM1-211ENST00000541434 MT2AP02795 61 aa7.39□□□□□ -1.23
CADM1-211ENST00000541434 H0YAA0 97 aa7.35□□□□□ -1.23
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP10-10P60014 251 aa7.35□□□□□ -1.23
CADM1-211ENST00000541434 MT1FP04733 61 aa7.34□□□□□ -1.23
CADM1-211ENST00000541434 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.34□□□□□ -1.23
CADM1-211ENST00000541434 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.33□□□□□ -1.24
CADM1-211ENST00000541434 P0C880 135 aa7.22□□□□□ -1.25
CADM1-211ENST00000541434 SEC61GP60059 68 aa7.21□□□□□ -1.26
CADM1-211ENST00000541434 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.2□□□□□ -1.26
CADM1-211ENST00000541434 CRIPTQ9P021 101 aa7.17□□□□□ -1.26
CADM1-211ENST00000541434 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.14□□□□□ -1.27
CADM1-211ENST00000541434 A0A1B0GU69 56 aa7.13□□□□□ -1.27
CADM1-211ENST00000541434 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.11□□□□□ -1.27
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.09□□□□□ -1.27
CADM1-211ENST00000541434 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.08□□□□□ -1.28
CADM1-211ENST00000541434 R4GN34 69 aa7.08□□□□□ -1.28
CADM1-211ENST00000541434 PRR15LQ9BU68 103 aa7.07□□□□□ -1.28
CADM1-211ENST00000541434 V9GYY9 64 aa7.06□□□□□ -1.28
CADM1-211ENST00000541434 M0QZ58 72 aa7.05□□□□□ -1.28
CADM1-211ENST00000541434 Q1T7F1 81 aa7.05□□□□□ -1.28
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.05□□□□□ -1.28
CADM1-211ENST00000541434 LCE2BO14633 110 aa7.04□□□□□ -1.28
CADM1-211ENST00000541434 A0A1B0GU33 70 aa7.03□□□□□ -1.28
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.96□□□□□ -1.3
CADM1-211ENST00000541434 PSPHP1O15172 72 aa6.95□□□□□ -1.3
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.95□□□□□ -1.3
CADM1-211ENST00000541434 LINC01554Q52M75 96 aa6.94□□□□□ -1.3
CADM1-211ENST00000541434 Q5VV11 94 aa6.92□□□□□ -1.3
CADM1-211ENST00000541434 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.92□□□□□ -1.3
CADM1-211ENST00000541434 USH2AO75445 5202 aa6.9□□□□□ -1.3
CADM1-211ENST00000541434 MT1BP07438 61 aa6.87□□□□□ -1.31
CADM1-211ENST00000541434 UQCR11O14957 56 aa6.86□□□□□ -1.31
CADM1-211ENST00000541434 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.85□□□□□ -1.31
CADM1-211ENST00000541434 A0A0D9SG42 100 aa6.83□□□□□ -1.32
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.82□□□□□ -1.32
CADM1-211ENST00000541434 PLAC4Q8WY50 150 aa6.81□□□□□ -1.32
CADM1-211ENST00000541434 A6NN06 94 aa6.79□□□□□ -1.32
CADM1-211ENST00000541434 A8MU10 97 aa6.77□□□□□ -1.33
CADM1-211ENST00000541434 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.76□□□□□ -1.33
CADM1-211ENST00000541434 SSPOA2VEC9 5147 aa6.73□□□□□ -1.33
CADM1-211ENST00000541434 A6NED7 52 aa6.73□□□□□ -1.33
CADM1-211ENST00000541434 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.73□□□□□ -1.33
CADM1-211ENST00000541434 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.7□□□□□ -1.34
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.69□□□□□ -1.34
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP12-1P59990 96 aa6.68□□□□□ -1.34
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP12-2P59991 146 aa6.65□□□□□ -1.34
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP10-5P60370 271 aa6.6□□□□□ -1.35
CADM1-211ENST00000541434 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.6□□□□□ -1.35
CADM1-211ENST00000541434 MT1XP80297 61 aa6.58□□□□□ -1.36
CADM1-211ENST00000541434 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.57□□□□□ -1.36
CADM1-211ENST00000541434 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.56□□□□□ -1.36
CADM1-211ENST00000541434 K7ERS5 55 aa6.52□□□□□ -1.37
CADM1-211ENST00000541434 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CADM1-211ENST00000541434 BRK1Q8WUW1 75 aa6.41□□□□□ -1.38
CADM1-211ENST00000541434 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.36□□□□□ -1.39
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP10-12P60413 245 aa6.25□□□□□ -1.41
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CADM1-211ENST00000541434 TNP1P09430 55 aa6.23□□□□□ -1.41
CADM1-211ENST00000541434 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CADM1-211ENST00000541434 ROMO1P60602 79 aa6.19□□□□□ -1.42
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.15□□□□□ -1.42
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.15□□□□□ -1.42
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.14□□□□□ -1.43
CADM1-211ENST00000541434 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.13□□□□□ -1.43
CADM1-211ENST00000541434 KMT2DO14686 5537 aa6.1□□□□□ -1.43
CADM1-211ENST00000541434 PRO0628Q9UI54 55 aa6.09□□□□□ -1.43
CADM1-211ENST00000541434 PMAIP1Q13794 54 aa6.07□□□□□ -1.44
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.07□□□□□ -1.44
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.01□□□□□ -1.45
CADM1-211ENST00000541434 LCE3AQ5TA76 89 aa6□□□□□ -1.45
CADM1-211ENST00000541434 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.94□□□□□ -1.46
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.94□□□□□ -1.46
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP5-9P26371 169 aa5.94□□□□□ -1.46
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.94□□□□□ -1.46
CADM1-211ENST00000541434 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.92□□□□□ -1.46
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.88□□□□□ -1.47
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.87□□□□□ -1.47
CADM1-211ENST00000541434 PP632Q6XCG6 107 aa5.85□□□□□ -1.47
CADM1-211ENST00000541434 MT1EP04732 61 aa5.79□□□□□ -1.48
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP12-3P60328 96 aa5.79□□□□□ -1.48
CADM1-211ENST00000541434 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.74□□□□□ -1.49
CADM1-211ENST00000541434 SPRR2EP22531 72 aa5.7□□□□□ -1.5
CADM1-211ENST00000541434 SPRR2BP35325 72 aa5.7□□□□□ -1.5
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