RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538020.1

LMO3-218, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 622 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-218ENST00000538020 S4R3F8 94 aa5.91□□□□□ -1.46
LMO3-218ENST00000538020 MT1HP80294 61 aa5.87□□□□□ -1.47
LMO3-218ENST00000538020 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
LMO3-218ENST00000538020 LCA10Q71F78 164 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-218ENST00000538020 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-218ENST00000538020 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.84□□□□□ -1.47
LMO3-218ENST00000538020 M0R2T5 61 aa5.84□□□□□ -1.47
LMO3-218ENST00000538020 COA5Q86WW8 74 aa5.82□□□□□ -1.48
LMO3-218ENST00000538020 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.81□□□□□ -1.48
LMO3-218ENST00000538020 CSAG1Q6PB30 78 aa5.8□□□□□ -1.48
LMO3-218ENST00000538020 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
LMO3-218ENST00000538020 LCE2BO14633 110 aa5.75□□□□□ -1.49
LMO3-218ENST00000538020 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.73□□□□□ -1.49
LMO3-218ENST00000538020 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
LMO3-218ENST00000538020 H0YAA0 97 aa5.66□□□□□ -1.5
LMO3-218ENST00000538020 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
LMO3-218ENST00000538020 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
LMO3-218ENST00000538020 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.61□□□□□ -1.51
LMO3-218ENST00000538020 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.6□□□□□ -1.51
LMO3-218ENST00000538020 SEC61GP60059 68 aa5.59□□□□□ -1.51
LMO3-218ENST00000538020 MT2AP02795 61 aa5.58□□□□□ -1.52
LMO3-218ENST00000538020 KRTAP10-10P60014 251 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-218ENST00000538020 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-218ENST00000538020 MT1FP04733 61 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-218ENST00000538020 A0A1B0GU69 56 aa5.53□□□□□ -1.52
LMO3-218ENST00000538020 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.53□□□□□ -1.52
LMO3-218ENST00000538020 V9GYY9 64 aa5.52□□□□□ -1.53
LMO3-218ENST00000538020 PRR15LQ9BU68 103 aa5.51□□□□□ -1.53
LMO3-218ENST00000538020 P0C880 135 aa5.5□□□□□ -1.53
LMO3-218ENST00000538020 CRIPTQ9P021 101 aa5.5□□□□□ -1.53
LMO3-218ENST00000538020 Q1T7F1 81 aa5.48□□□□□ -1.53
LMO3-218ENST00000538020 R4GN34 69 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-218ENST00000538020 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.42□□□□□ -1.54
LMO3-218ENST00000538020 A0A1B0GU33 70 aa5.41□□□□□ -1.54
LMO3-218ENST00000538020 M0QZ58 72 aa5.41□□□□□ -1.54
LMO3-218ENST00000538020 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.39□□□□□ -1.55
LMO3-218ENST00000538020 PSPHP1O15172 72 aa5.37□□□□□ -1.55
LMO3-218ENST00000538020 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.36□□□□□ -1.55
LMO3-218ENST00000538020 Q5VV11 94 aa5.34□□□□□ -1.55
LMO3-218ENST00000538020 UQCR11O14957 56 aa5.32□□□□□ -1.56
LMO3-218ENST00000538020 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.31□□□□□ -1.56
LMO3-218ENST00000538020 LINC01554Q52M75 96 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-218ENST00000538020 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-218ENST00000538020 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.28□□□□□ -1.56
LMO3-218ENST00000538020 A6NED7 52 aa5.24□□□□□ -1.57
LMO3-218ENST00000538020 A6NN06 94 aa5.24□□□□□ -1.57
LMO3-218ENST00000538020 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.24□□□□□ -1.57
LMO3-218ENST00000538020 A0A0D9SG42 100 aa5.23□□□□□ -1.57
LMO3-218ENST00000538020 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.23□□□□□ -1.57
LMO3-218ENST00000538020 MT1BP07438 61 aa5.2□□□□□ -1.58
LMO3-218ENST00000538020 PLAC4Q8WY50 150 aa5.2□□□□□ -1.58
LMO3-218ENST00000538020 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-218ENST00000538020 A8MU10 97 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-218ENST00000538020 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-218ENST00000538020 USH2AO75445 5202 aa5.15□□□□□ -1.59
LMO3-218ENST00000538020 KRTAP12-1P59990 96 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-218ENST00000538020 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-218ENST00000538020 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-218ENST00000538020 K7ERS5 55 aa5.09□□□□□ -1.59
LMO3-218ENST00000538020 KRTAP12-2P59991 146 aa5.09□□□□□ -1.59
LMO3-218ENST00000538020 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-218ENST00000538020 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-218ENST00000538020 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-218ENST00000538020 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.03□□□□□ -1.6
LMO3-218ENST00000538020 BRK1Q8WUW1 75 aa5.02□□□□□ -1.61
LMO3-218ENST00000538020 KRTAP10-5P60370 271 aa5.01□□□□□ -1.61
LMO3-218ENST00000538020 MT1XP80297 61 aa4.99□□□□□ -1.61
LMO3-218ENST00000538020 SSPOA2VEC9 5147 aa4.98□□□□□ -1.61
LMO3-218ENST00000538020 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.98□□□□□ -1.61
LMO3-218ENST00000538020 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.93□□□□□ -1.62
LMO3-218ENST00000538020 SVIPQ8NHG7 77 aa4.93□□□□□ -1.62
LMO3-218ENST00000538020 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
LMO3-218ENST00000538020 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.84□□□□□ -1.63
LMO3-218ENST00000538020 TNP1P09430 55 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-218ENST00000538020 PRO0628Q9UI54 55 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-218ENST00000538020 ROMO1P60602 79 aa4.79□□□□□ -1.64
LMO3-218ENST00000538020 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
LMO3-218ENST00000538020 KRTAP10-12P60413 245 aa4.75□□□□□ -1.65
LMO3-218ENST00000538020 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.75□□□□□ -1.65
LMO3-218ENST00000538020 PMAIP1Q13794 54 aa4.74□□□□□ -1.65
LMO3-218ENST00000538020 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
LMO3-218ENST00000538020 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
LMO3-218ENST00000538020 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.61□□□□□ -1.67
LMO3-218ENST00000538020 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.61□□□□□ -1.67
LMO3-218ENST00000538020 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa4.6□□□□□ -1.67
LMO3-218ENST00000538020 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.59□□□□□ -1.67
LMO3-218ENST00000538020 LCE3AQ5TA76 89 aa4.59□□□□□ -1.67
LMO3-218ENST00000538020 KMT2DO14686 5537 aa4.58□□□□□ -1.68
LMO3-218ENST00000538020 PP632Q6XCG6 107 aa4.56□□□□□ -1.68
LMO3-218ENST00000538020 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.51□□□□□ -1.69
LMO3-218ENST00000538020 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.49□□□□□ -1.69
LMO3-218ENST00000538020 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.48□□□□□ -1.69
LMO3-218ENST00000538020 KRTAP5-9P26371 169 aa4.48□□□□□ -1.69
LMO3-218ENST00000538020 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.47□□□□□ -1.69
LMO3-218ENST00000538020 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
LMO3-218ENST00000538020 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.46□□□□□ -1.7
LMO3-218ENST00000538020 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.44□□□□□ -1.7
LMO3-218ENST00000538020 KRTAP12-3P60328 96 aa4.43□□□□□ -1.7
LMO3-218ENST00000538020 PRAC1Q96KF2 57 aa4.42□□□□□ -1.7
LMO3-218ENST00000538020 MT1EP04732 61 aa4.4□□□□□ -1.71
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