RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524481.5

PTPRK-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 3,157 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-216ENST00000524481 A0A1B0GU69 56 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRK-216ENST00000524481 TNXBP22105 4242 aa6.21□□□□□ -1.41
PTPRK-216ENST00000524481 LRP2P98164 4655 aa6.21□□□□□ -1.41
PTPRK-216ENST00000524481 LPAP08519 4548 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-216ENST00000524481 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-216ENST00000524481 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRK-216ENST00000524481 HERC2O95714 4834 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRK-216ENST00000524481 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRK-216ENST00000524481 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.11□□□□□ -1.43
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PTPRK-216ENST00000524481 LINC01554Q52M75 96 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-216ENST00000524481 UQCR11O14957 56 aa6.04□□□□□ -1.44
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PTPRK-216ENST00000524481 H3BS24 57 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-216ENST00000524481 CSAG1Q6PB30 78 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-216ENST00000524481 TPRXLQ17RH7 258 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-216ENST00000524481 HERC1Q15751 4861 aa6□□□□□ -1.45
PTPRK-216ENST00000524481 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRK-216ENST00000524481 S4R3F8 94 aa5.98□□□□□ -1.45
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PTPRK-216ENST00000524481 A0A0D9SG42 100 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRK-216ENST00000524481 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRK-216ENST00000524481 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-216ENST00000524481 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRK-216ENST00000524481 CRIPTQ9P021 101 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRK-216ENST00000524481 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRK-216ENST00000524481 P0C880 135 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRK-216ENST00000524481 H0YAA0 97 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-216ENST00000524481 RNF213Q63HN8 5207 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-216ENST00000524481 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-216ENST00000524481 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-216ENST00000524481 K7ERS5 55 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-216ENST00000524481 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-216ENST00000524481 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-216ENST00000524481 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-216ENST00000524481 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-216ENST00000524481 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRK-216ENST00000524481 M0QZ58 72 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-216ENST00000524481 R4GN34 69 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-216ENST00000524481 ROMO1P60602 79 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-216ENST00000524481 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRK-216ENST00000524481 MUC17Q685J3 4493 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRK-216ENST00000524481 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
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PTPRK-216ENST00000524481 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-216ENST00000524481 KRTAP12-1P59990 96 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-216ENST00000524481 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-216ENST00000524481 NDUFAF8A1L188 74 aa5.43□□□□□ -1.54
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PTPRK-216ENST00000524481 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.09□□□□□ -1.59
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PTPRK-216ENST00000524481 TNP1P09430 55 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-216ENST00000524481 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-216ENST00000524481 A0A0A0MQY5 61 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRK-216ENST00000524481 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa4.78□□□□□ -1.64
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PTPRK-216ENST00000524481 PP632Q6XCG6 107 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-216ENST00000524481 MT1XP80297 61 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-216ENST00000524481 KRTAP10-5P60370 271 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRK-216ENST00000524481 SSPOA2VEC9 5147 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRK-216ENST00000524481 KRTAP12-3P60328 96 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRK-216ENST00000524481 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRK-216ENST00000524481 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRK-216ENST00000524481 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRK-216ENST00000524481 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
PTPRK-216ENST00000524481 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRK-216ENST00000524481 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
PTPRK-216ENST00000524481 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRK-216ENST00000524481 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRK-216ENST00000524481 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRK-216ENST00000524481 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRK-216ENST00000524481 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRK-216ENST00000524481 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRK-216ENST00000524481 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.2□□□□□ -1.74
PTPRK-216ENST00000524481 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRK-216ENST00000524481 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.18□□□□□ -1.74
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