RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 TPRXLQ17RH7 258 aa3.96□□□□□ -1.78
HERC3-210ENST00000512194 UQCRQO14949 82 aa3.95□□□□□ -1.78
HERC3-210ENST00000512194 TRAV7A0A075B6U4 112 aa3.94□□□□□ -1.78
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.94□□□□□ -1.78
HERC3-210ENST00000512194 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.94□□□□□ -1.78
HERC3-210ENST00000512194 MP68P56378 58 aa3.93□□□□□ -1.78
HERC3-210ENST00000512194 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa3.93□□□□□ -1.78
HERC3-210ENST00000512194 ANAPC13Q9BS18 74 aa3.93□□□□□ -1.78
HERC3-210ENST00000512194 A8MUU9 505 aa3.92□□□□□ -1.78
HERC3-210ENST00000512194 C5orf47Q569G3 176 aa3.92□□□□□ -1.78
HERC3-210ENST00000512194 SERP2Q8N6R1 65 aa3.92□□□□□ -1.78
HERC3-210ENST00000512194 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.92□□□□□ -1.78
HERC3-210ENST00000512194 A0A0U1RQV1 116 aa3.9□□□□□ -1.79
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HERC3-210ENST00000512194 TRAV22A0A0B4J277 110 aa3.89□□□□□ -1.79
HERC3-210ENST00000512194 H3BPC8 53 aa3.89□□□□□ -1.79
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.89□□□□□ -1.79
HERC3-210ENST00000512194 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
HERC3-210ENST00000512194 H0Y9P7 68 aa3.88□□□□□ -1.79
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HERC3-210ENST00000512194 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.88□□□□□ -1.79
HERC3-210ENST00000512194 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa3.86□□□□□ -1.79
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HERC3-210ENST00000512194 LINC00208Q96KT6 92 aa3.85□□□□□ -1.79
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HERC3-210ENST00000512194 Q5W150 140 aa3.83□□□□□ -1.8
HERC3-210ENST00000512194 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3.83□□□□□ -1.8
HERC3-210ENST00000512194 C20orf197Q8N268 126 aa3.83□□□□□ -1.8
HERC3-210ENST00000512194 NDUFC1O43677 76 aa3.82□□□□□ -1.8
HERC3-210ENST00000512194 SPINK7P58062 85 aa3.8□□□□□ -1.8
HERC3-210ENST00000512194 KLKP1Q107X0 134 aa3.8□□□□□ -1.8
HERC3-210ENST00000512194 SNURFQ9Y675 71 aa3.8□□□□□ -1.8
HERC3-210ENST00000512194 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa3.79□□□□□ -1.8
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.78□□□□□ -1.8
HERC3-210ENST00000512194 CCDC179H3BU77 68 aa3.77□□□□□ -1.81
HERC3-210ENST00000512194 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.77□□□□□ -1.81
HERC3-210ENST00000512194 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa3.76□□□□□ -1.81
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.74□□□□□ -1.81
HERC3-210ENST00000512194 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa3.73□□□□□ -1.81
HERC3-210ENST00000512194 HRES1P13985 223 aa3.72□□□□□ -1.81
HERC3-210ENST00000512194 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP12-2P59991 146 aa3.72□□□□□ -1.81
HERC3-210ENST00000512194 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa3.71□□□□□ -1.82
HERC3-210ENST00000512194 A8MUN3 132 aa3.71□□□□□ -1.82
HERC3-210ENST00000512194 H7BZZ5 65 aa3.71□□□□□ -1.82
HERC3-210ENST00000512194 FAM236CP0DP71 79 aa3.71□□□□□ -1.82
HERC3-210ENST00000512194 TMEM258P61165 79 aa3.71□□□□□ -1.82
HERC3-210ENST00000512194 C4orf26Q17RF5 130 aa3.7□□□□□ -1.82
HERC3-210ENST00000512194 SSPOA2VEC9 5147 aa3.7□□□□□ -1.82
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HERC3-210ENST00000512194 COX6B2Q6YFQ2 88 aa3.69□□□□□ -1.82
HERC3-210ENST00000512194 USH2AO75445 5202 aa3.67□□□□□ -1.82
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.66□□□□□ -1.82
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HERC3-210ENST00000512194 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.65□□□□□ -1.83
HERC3-210ENST00000512194 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.65□□□□□ -1.83
HERC3-210ENST00000512194 DMAC1Q96GE9 116 aa3.65□□□□□ -1.83
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HERC3-210ENST00000512194 SERP1Q9Y6X1 66 aa3.6□□□□□ -1.83
HERC3-210ENST00000512194 S4R3F8 94 aa3.6□□□□□ -1.83
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HERC3-210ENST00000512194 CSAG1Q6PB30 78 aa3.56□□□□□ -1.84
HERC3-210ENST00000512194 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
HERC3-210ENST00000512194 M0R2T5 61 aa3.53□□□□□ -1.84
HERC3-210ENST00000512194 LCA10Q71F78 164 aa3.53□□□□□ -1.84
HERC3-210ENST00000512194 V9GYY9 64 aa3.51□□□□□ -1.85
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HERC3-210ENST00000512194 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.42□□□□□ -1.86
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HERC3-210ENST00000512194 A6NED7 52 aa3.3□□□□□ -1.88
HERC3-210ENST00000512194 Q5VV11 94 aa3.3□□□□□ -1.88
HERC3-210ENST00000512194 MT1FP04733 61 aa3.29□□□□□ -1.88
HERC3-210ENST00000512194 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.28□□□□□ -1.88
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.27□□□□□ -1.89
HERC3-210ENST00000512194 K7ERS5 55 aa3.24□□□□□ -1.89
HERC3-210ENST00000512194 LINC01554Q52M75 96 aa3.24□□□□□ -1.89
HERC3-210ENST00000512194 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.24□□□□□ -1.89
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