RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
HERC3-210ENST00000512194 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.16■■□□□ 1.78
HERC3-210ENST00000512194 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
HERC3-210ENST00000512194 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
HERC3-210ENST00000512194 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.49■■□□□ 1.03
HERC3-210ENST00000512194 FOXD1Q16676 465 aa20.55■□□□□ 0.88
HERC3-210ENST00000512194 ADRA2BP18089 450 aa20.14■□□□□ 0.81
HERC3-210ENST00000512194 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.13■□□□□ 0.81
HERC3-210ENST00000512194 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
HERC3-210ENST00000512194 KCNA4P22459 653 aa19.05■□□□□ 0.64
HERC3-210ENST00000512194 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-210ENST00000512194 MSH5O43196 834 aa18.82■□□□□ 0.6
HERC3-210ENST00000512194 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
HERC3-210ENST00000512194 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
HERC3-210ENST00000512194 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa18.36■□□□□ 0.53
HERC3-210ENST00000512194 NPM3O75607 178 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
HERC3-210ENST00000512194 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
HERC3-210ENST00000512194 EHMT2Q96KQ7 1210 aa18.25■□□□□ 0.51
HERC3-210ENST00000512194 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
HERC3-210ENST00000512194 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
HERC3-210ENST00000512194 CSRNP3Q8WYN3 585 aa17.86■□□□□ 0.45
HERC3-210ENST00000512194 DNAJC5BQ9UF47 199 aa17.84■□□□□ 0.45
HERC3-210ENST00000512194 DMRT2Q9Y5R5 561 aa17.84■□□□□ 0.45
HERC3-210ENST00000512194 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
HERC3-210ENST00000512194 ZBTB22O15209 634 aa17.52■□□□□ 0.4
HERC3-210ENST00000512194 FOXD4L1Q9NU39 408 aa17.44■□□□□ 0.38
HERC3-210ENST00000512194 SLC4A2P04920 1241 aa17.18■□□□□ 0.34
HERC3-210ENST00000512194 DCAF8L1A6NGE4 600 aa16.97■□□□□ 0.31
HERC3-210ENST00000512194 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
HERC3-210ENST00000512194 ATXN8OSP0DMR3 200 aa16.85■□□□□ 0.29
HERC3-210ENST00000512194 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP16.81■□□□□ 0.28
HERC3-210ENST00000512194 NISCHQ9Y2I1 1504 aa16.65■□□□□ 0.26
HERC3-210ENST00000512194 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
HERC3-210ENST00000512194 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
HERC3-210ENST00000512194 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
HERC3-210ENST00000512194 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
HERC3-210ENST00000512194 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
HERC3-210ENST00000512194 APLP2Q06481 763 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-210ENST00000512194 POTEDQ86YR6 584 aa16.2■□□□□ 0.18
HERC3-210ENST00000512194 RNF39Q9H2S5 420 aa16.14■□□□□ 0.17
HERC3-210ENST00000512194 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
HERC3-210ENST00000512194 FKBP8Q14318 412 aa16.11■□□□□ 0.17
HERC3-210ENST00000512194 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HERC3-210ENST00000512194 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HERC3-210ENST00000512194 TRHP20396 242 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
HERC3-210ENST00000512194 CAPN15O75808 1086 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-210ENST00000512194 POLA2Q14181 598 aa15.8■□□□□ 0.12
HERC3-210ENST00000512194 FBLN2P98095 1184 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-210ENST00000512194 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
HERC3-210ENST00000512194 SPDYE4A6NLX3 237 aa15.65■□□□□ 0.1
HERC3-210ENST00000512194 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
HERC3-210ENST00000512194 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
HERC3-210ENST00000512194 ABCB7O75027 752 aa15.59■□□□□ 0.09
HERC3-210ENST00000512194 DSG3P32926 999 aa15.52■□□□□ 0.08
HERC3-210ENST00000512194 ABCC9O60706 1549 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-210ENST00000512194 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
HERC3-210ENST00000512194 PROM2Q8N271 834 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-210ENST00000512194 FBXO3Q9UK99 471 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-210ENST00000512194 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
HERC3-210ENST00000512194 SPDYE2BA6NHP3 402 aa15.24■□□□□ 0.03
HERC3-210ENST00000512194 SPDYE6P0CI01 402 aa15.24■□□□□ 0.03
HERC3-210ENST00000512194 SPDYE2Q495Y8 402 aa15.24■□□□□ 0.03
HERC3-210ENST00000512194 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
HERC3-210ENST00000512194 OSCARQ8IYS5 282 aa15.21■□□□□ 0.03
HERC3-210ENST00000512194 VASPP50552 380 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
HERC3-210ENST00000512194 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa15.17■□□□□ 0.02
HERC3-210ENST00000512194 SSUH2Q9Y2M2 353 aa15.15■□□□□ 0.02
HERC3-210ENST00000512194 STAG3Q9UJ98 1225 aa15.03■□□□□ -0
HERC3-210ENST00000512194 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP15.02■□□□□ -0
HERC3-210ENST00000512194 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
HERC3-210ENST00000512194 SLC24A1O60721 1099 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-210ENST00000512194 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
HERC3-210ENST00000512194 KLHL34Q8N239 644 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-210ENST00000512194 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-210ENST00000512194 MIER1Q8N108 512 aa14.79□□□□□ -0.04
HERC3-210ENST00000512194 SPOCK2Q92563 424 aa14.79□□□□□ -0.04
HERC3-210ENST00000512194 AKT1S1Q96B36 256 aa14.74□□□□□ -0.05
HERC3-210ENST00000512194 PLEKHG5O94827 1062 aa14.72□□□□□ -0.05
HERC3-210ENST00000512194 PKD2Q13563 968 aa14.71□□□□□ -0.05
HERC3-210ENST00000512194 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HERC3-210ENST00000512194 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HERC3-210ENST00000512194 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa14.56□□□□□ -0.08
HERC3-210ENST00000512194 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
HERC3-210ENST00000512194 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
HERC3-210ENST00000512194 DCAF8L2P0C7V8 631 aa14.52□□□□□ -0.09
HERC3-210ENST00000512194 CLEC11AQ9Y240 323 aa14.51□□□□□ -0.09
HERC3-210ENST00000512194 PRR29P0C7W0 189 aa14.49□□□□□ -0.09
HERC3-210ENST00000512194 UNC13AQ9UPW8 1703 aa14.47□□□□□ -0.09
HERC3-210ENST00000512194 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
HERC3-210ENST00000512194 TRIM41Q8WV44 630 aa14.41□□□□□ -0.1
HERC3-210ENST00000512194 PLCB2Q00722 1185 aa14.4□□□□□ -0.1
HERC3-210ENST00000512194 CREBZFQ9NS37 354 aa14.4□□□□□ -0.1
HERC3-210ENST00000512194 GSE1Q14687 1217 aa14.38□□□□□ -0.11
HERC3-210ENST00000512194 PITPNM1O00562 1244 aa14.37□□□□□ -0.11
HERC3-210ENST00000512194 NUBP1P53384 320 aa14.36□□□□□ -0.11
HERC3-210ENST00000512194 NACADO15069 1562 aa14.35□□□□□ -0.11
HERC3-210ENST00000512194 RGL2O15211 777 aa14.35□□□□□ -0.11
HERC3-210ENST00000512194 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
HERC3-210ENST00000512194 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
HERC3-210ENST00000512194 BICRAQ9NZM4 1560 aa14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms