RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	MP68	P56378	58 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	LCA10	Q71F78	164 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SH3BP2-222	ENST00000512014		S4R3F8	94 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	SERP2	Q8N6R1	65 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	LOC101927531	A0A1B0GV80	90 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	LINC00208	Q96KT6	92 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SH3BP2-222	ENST00000512014		H3BPC8	53 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SH3BP2-222	ENST00000512014	CSAG1	Q6PB30	78 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BP2-222	ENST00000512014	MT1B	P07438	61 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SH3BP2-222	ENST00000512014	COX7C	P15954	63 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SH3BP2-222	ENST00000512014	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SH3BP2-222	ENST00000512014	C20orf197	Q8N268	126 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SH3BP2-222	ENST00000512014	SNURF	Q9Y675	71 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLKP1	Q107X0	134 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SH3BP2-222	ENST00000512014		Q5VV11	94 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC179	H3BU77	68 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SH3BP2-222	ENST00000512014	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SH3BP2-222	ENST00000512014	NDUFC1	O43677	76 aa		5.59	□□□□□ -1.51
SH3BP2-222	ENST00000512014		A6NN06	94 aa		5.58	□□□□□ -1.52
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRTAP10-5	P60370	271 aa		5.58	□□□□□ -1.52
SH3BP2-222	ENST00000512014		H0YAA0	97 aa		5.56	□□□□□ -1.52
SH3BP2-222	ENST00000512014	CRIPT	Q9P021	101 aa		5.56	□□□□□ -1.52
SH3BP2-222	ENST00000512014		A8MUN3	132 aa		5.55	□□□□□ -1.52
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCP4	P48539	62 aa		5.55	□□□□□ -1.52
SH3BP2-222	ENST00000512014	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		5.54	□□□□□ -1.52
SH3BP2-222	ENST00000512014		H7BZZ5	65 aa		5.53	□□□□□ -1.52
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		5.53	□□□□□ -1.52
SH3BP2-222	ENST00000512014	DMAC1	Q96GE9	116 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACYP2	P14621	99 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SH3BP2-222	ENST00000512014	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM258	P61165	79 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SH3BP2-222	ENST00000512014	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SH3BP2-222	ENST00000512014		P0C880	135 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		5.39	□□□□□ -1.55
SH3BP2-222	ENST00000512014	NEB	P20929	6669 aa		5.39	□□□□□ -1.55
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRTAP5-9	P26371	169 aa		5.38	□□□□□ -1.55
SH3BP2-222	ENST00000512014	MT1X	P80297	61 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SH3BP2-222	ENST00000512014	COA5	Q86WW8	74 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SH3BP2-222	ENST00000512014	KMT2D	O14686	5537 aa		5.33	□□□□□ -1.56
SH3BP2-222	ENST00000512014		R4GN34	69 aa		5.31	□□□□□ -1.56
SH3BP2-222	ENST00000512014	MDN1	Q9NU22	5596 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SH3BP2-222	ENST00000512014		M0QZ58	72 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLAC4	Q8WY50	150 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SH3BP2-222	ENST00000512014	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRTAP12-2	P59991	146 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SH3BP2-222	ENST00000512014	LINC01554	Q52M75	96 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SH3BP2-222	ENST00000512014	SEC61G	P60059	68 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A1B0GU69	56 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SH3BP2-222	ENST00000512014	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPRR2E	P22531	72 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPRR2B	P35325	72 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPRR2A	P35326	72 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRTAP10-12	P60413	245 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SH3BP2-222	ENST00000512014	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRR15L	Q9BU68	103 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SH3BP2-222	ENST00000512014		V9GYY9	64 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SH3BP2-222	ENST00000512014		Q1T7F1	81 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A1B0GU33	70 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	PSPHP1	O15172	72 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPRR2D	P22532	72 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	UQCR11	O14957	56 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A0D9SG42	100 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SH3BP2-222	ENST00000512014		A6NED7	52 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SH3BP2-222	ENST00000512014		A8MU10	97 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRTAP12-1	P59990	96 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SH3BP2-222	ENST00000512014	MT1E	P04732	61 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SH3BP2-222	ENST00000512014	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SH3BP2-222	ENST00000512014		K7ERS5	55 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		4.69	□□□□□ -1.66

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