RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.61□□□□□ -1.51
SH3BP2-209ENST00000504450 PRO0628Q9UI54 55 aa5.58□□□□□ -1.52
SH3BP2-209ENST00000504450 BRK1Q8WUW1 75 aa5.57□□□□□ -1.52
SH3BP2-209ENST00000504450 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.52□□□□□ -1.53
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.52□□□□□ -1.53
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1B0GU69 56 aa5.51□□□□□ -1.53
SH3BP2-209ENST00000504450 LCA10Q71F78 164 aa5.51□□□□□ -1.53
SH3BP2-209ENST00000504450 A6NED7 52 aa5.49□□□□□ -1.53
SH3BP2-209ENST00000504450 A8MU10 97 aa5.49□□□□□ -1.53
SH3BP2-209ENST00000504450 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.47□□□□□ -1.53
SH3BP2-209ENST00000504450 MUC2Q02817 5179 aa5.47□□□□□ -1.53
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.45□□□□□ -1.54
SH3BP2-209ENST00000504450 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.42□□□□□ -1.54
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.41□□□□□ -1.54
SH3BP2-209ENST00000504450 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.41□□□□□ -1.54
SH3BP2-209ENST00000504450 SEC61GP60059 68 aa5.4□□□□□ -1.54
SH3BP2-209ENST00000504450 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
SH3BP2-209ENST00000504450 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
SH3BP2-209ENST00000504450 S4R3F8 94 aa5.39□□□□□ -1.55
SH3BP2-209ENST00000504450 UQCR11O14957 56 aa5.38□□□□□ -1.55
SH3BP2-209ENST00000504450 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.37□□□□□ -1.55
SH3BP2-209ENST00000504450 MUC17Q685J3 4493 aa5.36□□□□□ -1.55
SH3BP2-209ENST00000504450 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.36□□□□□ -1.55
SH3BP2-209ENST00000504450 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.35□□□□□ -1.55
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa5.35□□□□□ -1.55
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.32□□□□□ -1.56
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1B0GU33 70 aa5.31□□□□□ -1.56
SH3BP2-209ENST00000504450 A6NN06 94 aa5.29□□□□□ -1.56
SH3BP2-209ENST00000504450 PMAIP1Q13794 54 aa5.29□□□□□ -1.56
SH3BP2-209ENST00000504450 H0YAA0 97 aa5.28□□□□□ -1.56
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa5.28□□□□□ -1.56
SH3BP2-209ENST00000504450 CSAG1Q6PB30 78 aa5.25□□□□□ -1.57
SH3BP2-209ENST00000504450 P0C880 135 aa5.21□□□□□ -1.58
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.18□□□□□ -1.58
SH3BP2-209ENST00000504450 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
SH3BP2-209ENST00000504450 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.18□□□□□ -1.58
SH3BP2-209ENST00000504450 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.18□□□□□ -1.58
SH3BP2-209ENST00000504450 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.13□□□□□ -1.59
SH3BP2-209ENST00000504450 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.13□□□□□ -1.59
SH3BP2-209ENST00000504450 LCE2CQ5TA81 110 aa5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2-209ENST00000504450 M0QZ58 72 aa5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2-209ENST00000504450 MT1HP80294 61 aa5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2-209ENST00000504450 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2-209ENST00000504450 M0R2T5 61 aa5.05□□□□□ -1.6
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A0D9SG42 100 aa5.03□□□□□ -1.6
SH3BP2-209ENST00000504450 K7ERS5 55 aa5.02□□□□□ -1.61
SH3BP2-209ENST00000504450 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP12-1P59990 96 aa4.99□□□□□ -1.61
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP12-2P59991 146 aa4.97□□□□□ -1.61
SH3BP2-209ENST00000504450 PRAC1Q96KF2 57 aa4.97□□□□□ -1.61
SH3BP2-209ENST00000504450 R4GN34 69 aa4.94□□□□□ -1.62
SH3BP2-209ENST00000504450 ROMO1P60602 79 aa4.91□□□□□ -1.62
SH3BP2-209ENST00000504450 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.9□□□□□ -1.63
SH3BP2-209ENST00000504450 CRIPTQ9P021 101 aa4.88□□□□□ -1.63
SH3BP2-209ENST00000504450 LINC01554Q52M75 96 aa4.85□□□□□ -1.63
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.84□□□□□ -1.63
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.81□□□□□ -1.64
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.78□□□□□ -1.64
SH3BP2-209ENST00000504450 MT2AP02795 61 aa4.76□□□□□ -1.65
SH3BP2-209ENST00000504450 SPRR2GQ9BYE4 73 aa4.76□□□□□ -1.65
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.75□□□□□ -1.65
SH3BP2-209ENST00000504450 MT1FP04733 61 aa4.74□□□□□ -1.65
SH3BP2-209ENST00000504450 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.73□□□□□ -1.65
SH3BP2-209ENST00000504450 USH2AO75445 5202 aa4.71□□□□□ -1.66
SH3BP2-209ENST00000504450 SSPOA2VEC9 5147 aa4.7□□□□□ -1.66
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP10-10P60014 251 aa4.68□□□□□ -1.66
SH3BP2-209ENST00000504450 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.65□□□□□ -1.67
SH3BP2-209ENST00000504450 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
SH3BP2-209ENST00000504450 LCE2BO14633 110 aa4.64□□□□□ -1.67
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa4.63□□□□□ -1.67
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.6□□□□□ -1.67
SH3BP2-209ENST00000504450 PLAC4Q8WY50 150 aa4.59□□□□□ -1.67
SH3BP2-209ENST00000504450 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
SH3BP2-209ENST00000504450 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
SH3BP2-209ENST00000504450 MT1BP07438 61 aa4.55□□□□□ -1.68
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.49□□□□□ -1.69
SH3BP2-209ENST00000504450 TNP1P09430 55 aa4.48□□□□□ -1.69
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.47□□□□□ -1.69
SH3BP2-209ENST00000504450 PP632Q6XCG6 107 aa4.47□□□□□ -1.69
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP10-5P60370 271 aa4.43□□□□□ -1.7
SH3BP2-209ENST00000504450 MT1XP80297 61 aa4.43□□□□□ -1.7
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.42□□□□□ -1.7
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.34□□□□□ -1.71
SH3BP2-209ENST00000504450 NEBP20929 6669 aa4.31□□□□□ -1.72
SH3BP2-209ENST00000504450 LCE3AQ5TA76 89 aa4.29□□□□□ -1.72
SH3BP2-209ENST00000504450 PRO2289Q9P1D8 64 aa4.28□□□□□ -1.72
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.24□□□□□ -1.73
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa4.24□□□□□ -1.73
SH3BP2-209ENST00000504450 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.22□□□□□ -1.73
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP10-12P60413 245 aa4.21□□□□□ -1.74
SH3BP2-209ENST00000504450 H3BS24 57 aa4.17□□□□□ -1.74
SH3BP2-209ENST00000504450 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.11□□□□□ -1.75
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP12-3P60328 96 aa4.11□□□□□ -1.75
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP5-9P26371 169 aa4.09□□□□□ -1.75
SH3BP2-209ENST00000504450 MDN1Q9NU22 5596 aa4.06□□□□□ -1.76
SH3BP2-209ENST00000504450 KMT2DO14686 5537 aa4.04□□□□□ -1.76
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.3 ms