RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498346.1

C1orf61-225, Transcript of chromosome 1 open reading frame 61, humanhuman

TSL 2

Gene C1orf61, Length 588 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61-225ENST00000498346 PRR26Q8N8Z3 221 aa3.88□□□□□ -1.79
C1orf61-225ENST00000498346 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.88□□□□□ -1.79
C1orf61-225ENST00000498346 A8MUN3 132 aa3.87□□□□□ -1.79
C1orf61-225ENST00000498346 PSPHP1O15172 72 aa3.87□□□□□ -1.79
C1orf61-225ENST00000498346 Q5VV11 94 aa3.87□□□□□ -1.79
C1orf61-225ENST00000498346 Q75L30 129 aa3.86□□□□□ -1.79
C1orf61-225ENST00000498346 DMAC1Q96GE9 116 aa3.85□□□□□ -1.79
C1orf61-225ENST00000498346 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.84□□□□□ -1.79
C1orf61-225ENST00000498346 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.84□□□□□ -1.79
C1orf61-225ENST00000498346 PRR15LQ9BU68 103 aa3.83□□□□□ -1.8
C1orf61-225ENST00000498346 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa3.81□□□□□ -1.8
C1orf61-225ENST00000498346 NEBP20929 6669 aa3.79□□□□□ -1.8
C1orf61-225ENST00000498346 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa3.78□□□□□ -1.8
C1orf61-225ENST00000498346 A6NED7 52 aa3.78□□□□□ -1.8
C1orf61-225ENST00000498346 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.78□□□□□ -1.8
C1orf61-225ENST00000498346 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.78□□□□□ -1.8
C1orf61-225ENST00000498346 A8MUU9 505 aa3.77□□□□□ -1.81
C1orf61-225ENST00000498346 LCA10Q71F78 164 aa3.77□□□□□ -1.81
C1orf61-225ENST00000498346 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.77□□□□□ -1.81
C1orf61-225ENST00000498346 LORP23490 312 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
C1orf61-225ENST00000498346 LCE2CQ5TA81 110 aa3.76□□□□□ -1.81
C1orf61-225ENST00000498346 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3.76□□□□□ -1.81
C1orf61-225ENST00000498346 RETNLBQ9BQ08 111 aa3.75□□□□□ -1.81
C1orf61-225ENST00000498346 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
C1orf61-225ENST00000498346 MT1HP80294 61 aa3.74□□□□□ -1.81
C1orf61-225ENST00000498346 PMAIP1Q13794 54 aa3.74□□□□□ -1.81
C1orf61-225ENST00000498346 A0A1B0GU69 56 aa3.73□□□□□ -1.81
C1orf61-225ENST00000498346 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.73□□□□□ -1.81
C1orf61-225ENST00000498346 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.73□□□□□ -1.81
C1orf61-225ENST00000498346 SPINK7P58062 85 aa3.71□□□□□ -1.82
C1orf61-225ENST00000498346 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.71□□□□□ -1.82
C1orf61-225ENST00000498346 UQCR11O14957 56 aa3.68□□□□□ -1.82
C1orf61-225ENST00000498346 A6NN06 94 aa3.67□□□□□ -1.82
C1orf61-225ENST00000498346 A8MU10 97 aa3.67□□□□□ -1.82
C1orf61-225ENST00000498346 SEC61GP60059 68 aa3.67□□□□□ -1.82
C1orf61-225ENST00000498346 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.67□□□□□ -1.82
C1orf61-225ENST00000498346 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
C1orf61-225ENST00000498346 TPRXLQ17RH7 258 aa3.66□□□□□ -1.82
C1orf61-225ENST00000498346 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.66□□□□□ -1.82
C1orf61-225ENST00000498346 C9orf92A6NGG3 77 aa3.64□□□□□ -1.83
C1orf61-225ENST00000498346 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.64□□□□□ -1.83
C1orf61-225ENST00000498346 COX6B2Q6YFQ2 88 aa3.64□□□□□ -1.83
C1orf61-225ENST00000498346 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.64□□□□□ -1.83
C1orf61-225ENST00000498346 M0R2T5 61 aa3.63□□□□□ -1.83
C1orf61-225ENST00000498346 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa3.63□□□□□ -1.83
C1orf61-225ENST00000498346 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.62□□□□□ -1.83
C1orf61-225ENST00000498346 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
C1orf61-225ENST00000498346 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.59□□□□□ -1.83
C1orf61-225ENST00000498346 LCE2BO14633 110 aa3.57□□□□□ -1.84
C1orf61-225ENST00000498346 KMT2DO14686 5537 aa3.57□□□□□ -1.84
C1orf61-225ENST00000498346 A0A1B0GU33 70 aa3.56□□□□□ -1.84
C1orf61-225ENST00000498346 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
C1orf61-225ENST00000498346 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.55□□□□□ -1.84
C1orf61-225ENST00000498346 MDN1Q9NU22 5596 aa3.54□□□□□ -1.84
C1orf61-225ENST00000498346 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.54□□□□□ -1.84
C1orf61-225ENST00000498346 XP32Q5T750 250 aa3.54□□□□□ -1.84
C1orf61-225ENST00000498346 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.52□□□□□ -1.85
C1orf61-225ENST00000498346 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa3.5□□□□□ -1.85
C1orf61-225ENST00000498346 H0YAA0 97 aa3.48□□□□□ -1.85
C1orf61-225ENST00000498346 K7ERS5 55 aa3.47□□□□□ -1.85
C1orf61-225ENST00000498346 S4R3F8 94 aa3.45□□□□□ -1.86
C1orf61-225ENST00000498346 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.44□□□□□ -1.86
C1orf61-225ENST00000498346 CSAG1Q6PB30 78 aa3.41□□□□□ -1.86
C1orf61-225ENST00000498346 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.4□□□□□ -1.87
C1orf61-225ENST00000498346 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.39□□□□□ -1.87
C1orf61-225ENST00000498346 PRAC1Q96KF2 57 aa3.39□□□□□ -1.87
C1orf61-225ENST00000498346 M0QZ58 72 aa3.37□□□□□ -1.87
C1orf61-225ENST00000498346 LINC01554Q52M75 96 aa3.37□□□□□ -1.87
C1orf61-225ENST00000498346 MT2AP02795 61 aa3.35□□□□□ -1.87
C1orf61-225ENST00000498346 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.35□□□□□ -1.87
C1orf61-225ENST00000498346 ROMO1P60602 79 aa3.35□□□□□ -1.87
C1orf61-225ENST00000498346 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.35□□□□□ -1.87
C1orf61-225ENST00000498346 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.35□□□□□ -1.87
C1orf61-225ENST00000498346 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.34□□□□□ -1.87
C1orf61-225ENST00000498346 MT1FP04733 61 aa3.34□□□□□ -1.87
C1orf61-225ENST00000498346 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.34□□□□□ -1.87
C1orf61-225ENST00000498346 P0C880 135 aa3.33□□□□□ -1.88
C1orf61-225ENST00000498346 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.33□□□□□ -1.88
C1orf61-225ENST00000498346 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.29□□□□□ -1.88
C1orf61-225ENST00000498346 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.29□□□□□ -1.88
C1orf61-225ENST00000498346 A0A0D9SG42 100 aa3.27□□□□□ -1.89
C1orf61-225ENST00000498346 KRTAP10-10P60014 251 aa3.27□□□□□ -1.89
C1orf61-225ENST00000498346 KRTAP12-1P59990 96 aa3.26□□□□□ -1.89
C1orf61-225ENST00000498346 LCE3BQ5TA77 95 aa3.26□□□□□ -1.89
C1orf61-225ENST00000498346 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.26□□□□□ -1.89
C1orf61-225ENST00000498346 KRTAP12-2P59991 146 aa3.23□□□□□ -1.89
C1orf61-225ENST00000498346 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.22□□□□□ -1.89
C1orf61-225ENST00000498346 CRIPTQ9P021 101 aa3.22□□□□□ -1.89
C1orf61-225ENST00000498346 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.2□□□□□ -1.9
C1orf61-225ENST00000498346 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.2□□□□□ -1.9
C1orf61-225ENST00000498346 R4GN34 69 aa3.2□□□□□ -1.9
C1orf61-225ENST00000498346 KRTAP5-9P26371 169 aa3.19□□□□□ -1.9
C1orf61-225ENST00000498346 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.17□□□□□ -1.9
C1orf61-225ENST00000498346 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.16□□□□□ -1.9
C1orf61-225ENST00000498346 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.14□□□□□ -1.91
C1orf61-225ENST00000498346 SPRR2EP22531 72 aa3.11□□□□□ -1.91
C1orf61-225ENST00000498346 SPRR2BP35325 72 aa3.11□□□□□ -1.91
C1orf61-225ENST00000498346 SPRR2AP35326 72 aa3.11□□□□□ -1.91
C1orf61-225ENST00000498346 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
C1orf61-225ENST00000498346 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms