RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498160.5

CTDSP1-215, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 877 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-215ENST00000498160 H7BZZ5 65 aa8.48□□□□□ -1.05
CTDSP1-215ENST00000498160 CCDC179H3BU77 68 aa8.47□□□□□ -1.05
CTDSP1-215ENST00000498160 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CTDSP1-215ENST00000498160 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.41□□□□□ -1.06
CTDSP1-215ENST00000498160 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CTDSP1-215ENST00000498160 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.39□□□□□ -1.07
CTDSP1-215ENST00000498160 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa8.38□□□□□ -1.07
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.38□□□□□ -1.07
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa8.32□□□□□ -1.08
CTDSP1-215ENST00000498160 TMEM258P61165 79 aa8.31□□□□□ -1.08
CTDSP1-215ENST00000498160 H0YAA0 97 aa8.28□□□□□ -1.08
CTDSP1-215ENST00000498160 MT2AP02795 61 aa8.27□□□□□ -1.09
CTDSP1-215ENST00000498160 COA5Q86WW8 74 aa8.27□□□□□ -1.09
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP10-10P60014 251 aa8.23□□□□□ -1.09
CTDSP1-215ENST00000498160 PCP4P48539 62 aa8.22□□□□□ -1.09
CTDSP1-215ENST00000498160 MT1FP04733 61 aa8.18□□□□□ -1.1
CTDSP1-215ENST00000498160 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
CTDSP1-215ENST00000498160 CRIPTQ9P021 101 aa8.13□□□□□ -1.11
CTDSP1-215ENST00000498160 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.12□□□□□ -1.11
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa8.05□□□□□ -1.12
CTDSP1-215ENST00000498160 SEC61GP60059 68 aa8.04□□□□□ -1.12
CTDSP1-215ENST00000498160 SERP1Q9Y6X1 66 aa8.04□□□□□ -1.12
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8□□□□□ -1.13
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.97□□□□□ -1.13
CTDSP1-215ENST00000498160 P0C880 135 aa7.95□□□□□ -1.14
CTDSP1-215ENST00000498160 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.95□□□□□ -1.14
CTDSP1-215ENST00000498160 R4GN34 69 aa7.93□□□□□ -1.14
CTDSP1-215ENST00000498160 A0A1B0GU69 56 aa7.89□□□□□ -1.15
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.89□□□□□ -1.15
CTDSP1-215ENST00000498160 M0QZ58 72 aa7.88□□□□□ -1.15
CTDSP1-215ENST00000498160 PRR15LQ9BU68 103 aa7.88□□□□□ -1.15
CTDSP1-215ENST00000498160 LCE2BO14633 110 aa7.86□□□□□ -1.15
CTDSP1-215ENST00000498160 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.85□□□□□ -1.15
CTDSP1-215ENST00000498160 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
CTDSP1-215ENST00000498160 V9GYY9 64 aa7.83□□□□□ -1.16
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.81□□□□□ -1.16
CTDSP1-215ENST00000498160 Q5VV11 94 aa7.8□□□□□ -1.16
CTDSP1-215ENST00000498160 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.77□□□□□ -1.17
CTDSP1-215ENST00000498160 A0A1B0GU33 70 aa7.76□□□□□ -1.17
CTDSP1-215ENST00000498160 USH2AO75445 5202 aa7.72□□□□□ -1.17
CTDSP1-215ENST00000498160 Q1T7F1 81 aa7.71□□□□□ -1.18
CTDSP1-215ENST00000498160 LINC01554Q52M75 96 aa7.67□□□□□ -1.18
CTDSP1-215ENST00000498160 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.67□□□□□ -1.18
CTDSP1-215ENST00000498160 A6NN06 94 aa7.66□□□□□ -1.18
CTDSP1-215ENST00000498160 MT1BP07438 61 aa7.66□□□□□ -1.18
CTDSP1-215ENST00000498160 PLAC4Q8WY50 150 aa7.65□□□□□ -1.18
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.61□□□□□ -1.19
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.59□□□□□ -1.19
CTDSP1-215ENST00000498160 UQCR11O14957 56 aa7.59□□□□□ -1.19
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP1-215ENST00000498160 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP1-215ENST00000498160 SSPOA2VEC9 5147 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDSP1-215ENST00000498160 FSIP2Q5CZC0 6907 aa7.53□□□□□ -1.2
CTDSP1-215ENST00000498160 PSPHP1O15172 72 aa7.52□□□□□ -1.21
CTDSP1-215ENST00000498160 A0A0D9SG42 100 aa7.49□□□□□ -1.21
CTDSP1-215ENST00000498160 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.48□□□□□ -1.21
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP10-5P60370 271 aa7.44□□□□□ -1.22
CTDSP1-215ENST00000498160 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP1-215ENST00000498160 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.39□□□□□ -1.23
CTDSP1-215ENST00000498160 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.38□□□□□ -1.23
CTDSP1-215ENST00000498160 A6NED7 52 aa7.37□□□□□ -1.23
CTDSP1-215ENST00000498160 A8MU10 97 aa7.37□□□□□ -1.23
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP12-1P59990 96 aa7.36□□□□□ -1.23
CTDSP1-215ENST00000498160 MT1XP80297 61 aa7.32□□□□□ -1.24
CTDSP1-215ENST00000498160 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CTDSP1-215ENST00000498160 K7ERS5 55 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP12-2P59991 146 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDSP1-215ENST00000498160 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.19□□□□□ -1.26
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP10-12P60413 245 aa7□□□□□ -1.29
CTDSP1-215ENST00000498160 TNP1P09430 55 aa6.97□□□□□ -1.29
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CTDSP1-215ENST00000498160 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.97□□□□□ -1.29
CTDSP1-215ENST00000498160 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CTDSP1-215ENST00000498160 BRK1Q8WUW1 75 aa6.93□□□□□ -1.3
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.87□□□□□ -1.31
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.87□□□□□ -1.31
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.86□□□□□ -1.31
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSP1-215ENST00000498160 ROMO1P60602 79 aa6.81□□□□□ -1.32
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.77□□□□□ -1.33
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP5-9P26371 169 aa6.77□□□□□ -1.33
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.77□□□□□ -1.33
CTDSP1-215ENST00000498160 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CTDSP1-215ENST00000498160 KMT2DO14686 5537 aa6.72□□□□□ -1.33
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSP1-215ENST00000498160 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.67□□□□□ -1.34
CTDSP1-215ENST00000498160 LCE3AQ5TA76 89 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDSP1-215ENST00000498160 PRO0628Q9UI54 55 aa6.59□□□□□ -1.35
CTDSP1-215ENST00000498160 PP632Q6XCG6 107 aa6.58□□□□□ -1.36
CTDSP1-215ENST00000498160 PMAIP1Q13794 54 aa6.57□□□□□ -1.36
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.53□□□□□ -1.36
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSP1-215ENST00000498160 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSP1-215ENST00000498160 MT1EP04732 61 aa6.47□□□□□ -1.37
CTDSP1-215ENST00000498160 SPRR2EP22531 72 aa6.45□□□□□ -1.38
CTDSP1-215ENST00000498160 SPRR2BP35325 72 aa6.45□□□□□ -1.38
CTDSP1-215ENST00000498160 SPRR2AP35326 72 aa6.45□□□□□ -1.38
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP12-3P60328 96 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSP1-215ENST00000498160 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms