RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494664.5

TIMMDC1-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TIMMDC1, Length 2,394 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-208ENST00000494664 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.72□□□□□ -1.33
TIMMDC1-208ENST00000494664 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.71□□□□□ -1.34
TIMMDC1-208ENST00000494664 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.67□□□□□ -1.34
TIMMDC1-208ENST00000494664 SPINK1P00995 79 aa6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1-208ENST00000494664 LPAP08519 4548 aa6.64□□□□□ -1.35
TIMMDC1-208ENST00000494664 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TIMMDC1-208ENST00000494664 LRP2P98164 4655 aa6.62□□□□□ -1.35
TIMMDC1-208ENST00000494664 IGKV2-30P06310 120 aa6.61□□□□□ -1.35
TIMMDC1-208ENST00000494664 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
TIMMDC1-208ENST00000494664 CSAG1Q6PB30 78 aa6.59□□□□□ -1.35
TIMMDC1-208ENST00000494664 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1-208ENST00000494664 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.44□□□□□ -1.38
TIMMDC1-208ENST00000494664 C9orf92A6NGG3 77 aa6.42□□□□□ -1.38
TIMMDC1-208ENST00000494664 TPRXLQ17RH7 258 aa6.42□□□□□ -1.38
TIMMDC1-208ENST00000494664 A8MUU9 505 aa6.4□□□□□ -1.39
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.4□□□□□ -1.39
TIMMDC1-208ENST00000494664 A0A0A0MQY5 61 aa6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1-208ENST00000494664 MUC2Q02817 5179 aa6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1-208ENST00000494664 RNF213Q63HN8 5207 aa6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1-208ENST00000494664 XP32Q5T750 250 aa6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1-208ENST00000494664 ROMO1P60602 79 aa6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1-208ENST00000494664 H0YAA0 97 aa6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1-208ENST00000494664 MUC17Q685J3 4493 aa6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1-208ENST00000494664 A0A1B0GU33 70 aa6.31□□□□□ -1.4
TIMMDC1-208ENST00000494664 K7ERS5 55 aa6.27□□□□□ -1.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.26□□□□□ -1.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.21□□□□□ -1.42
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.21□□□□□ -1.42
TIMMDC1-208ENST00000494664 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.17□□□□□ -1.42
TIMMDC1-208ENST00000494664 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.13□□□□□ -1.43
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1-208ENST00000494664 CRIPTQ9P021 101 aa6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1-208ENST00000494664 P0C880 135 aa6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1-208ENST00000494664 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.1□□□□□ -1.43
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1-208ENST00000494664 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.04□□□□□ -1.44
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1-208ENST00000494664 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1-208ENST00000494664 LCE2CQ5TA81 110 aa5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
TIMMDC1-208ENST00000494664 A0A0D9SG42 100 aa5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1-208ENST00000494664 NDUFAF8A1L188 74 aa5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 S4R3F8 94 aa5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1-208ENST00000494664 MT1HP80294 61 aa5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1-208ENST00000494664 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP12-2P59991 146 aa5.74□□□□□ -1.49
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP12-1P59990 96 aa5.7□□□□□ -1.5
TIMMDC1-208ENST00000494664 M0R2T5 61 aa5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1-208ENST00000494664 M0QZ58 72 aa5.65□□□□□ -1.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.56□□□□□ -1.52
TIMMDC1-208ENST00000494664 MT2AP02795 61 aa5.51□□□□□ -1.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 PLAC4Q8WY50 150 aa5.51□□□□□ -1.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 LUZP6Q538Z0 58 aa5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 MT1FP04733 61 aa5.49□□□□□ -1.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP10-10P60014 251 aa5.43□□□□□ -1.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.41□□□□□ -1.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 R4GN34 69 aa5.4□□□□□ -1.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.36□□□□□ -1.55
TIMMDC1-208ENST00000494664 PP632Q6XCG6 107 aa5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1-208ENST00000494664 USH2AO75445 5202 aa5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.32□□□□□ -1.56
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.31□□□□□ -1.56
TIMMDC1-208ENST00000494664 LCE2BO14633 110 aa5.28□□□□□ -1.56
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.27□□□□□ -1.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 SSPOA2VEC9 5147 aa5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.23□□□□□ -1.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
TIMMDC1-208ENST00000494664 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.18□□□□□ -1.58
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.15□□□□□ -1.59
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1-208ENST00000494664 MT1BP07438 61 aa5.12□□□□□ -1.59
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.09□□□□□ -1.59
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.08□□□□□ -1.6
TIMMDC1-208ENST00000494664 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.07□□□□□ -1.6
TIMMDC1-208ENST00000494664 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1-208ENST00000494664 TNP1P09430 55 aa5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1-208ENST00000494664 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.98□□□□□ -1.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.98□□□□□ -1.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 LCE3BQ5TA77 95 aa4.97□□□□□ -1.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.94□□□□□ -1.62
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP10-5P60370 271 aa4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1-208ENST00000494664 MT1XP80297 61 aa4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1-208ENST00000494664 PRO2289Q9P1D8 64 aa4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1-208ENST00000494664 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
TIMMDC1-208ENST00000494664 INE1O15225 51 aa4.8□□□□□ -1.64
TIMMDC1-208ENST00000494664 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
TIMMDC1-208ENST00000494664 KMT2DO14686 5537 aa4.79□□□□□ -1.64
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.74□□□□□ -1.65
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