RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		8.28	□□□□□ -1.08
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	8.28	□□□□□ -1.08
USP19-210	ENST00000465902	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	8.28	□□□□□ -1.08
USP19-210	ENST00000465902		H3BPC8	53 aa		8.26	□□□□□ -1.09
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		8.23	□□□□□ -1.09
USP19-210	ENST00000465902		A8MUN3	132 aa		8.22	□□□□□ -1.09
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		8.22	□□□□□ -1.09
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		8.2	□□□□□ -1.1
USP19-210	ENST00000465902	NDUFC1	O43677	76 aa		8.19	□□□□□ -1.1
USP19-210	ENST00000465902	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		8.18	□□□□□ -1.1
USP19-210	ENST00000465902	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		8.16	□□□□□ -1.1
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		8.08	□□□□□ -1.12
USP19-210	ENST00000465902	DMAC1	Q96GE9	116 aa		8.05	□□□□□ -1.12
USP19-210	ENST00000465902	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	8.02	□□□□□ -1.13
USP19-210	ENST00000465902	SNURF	Q9Y675	71 aa		8	□□□□□ -1.13
USP19-210	ENST00000465902	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		7.98	□□□□□ -1.13
USP19-210	ENST00000465902		H0YAA0	97 aa		7.97	□□□□□ -1.13
USP19-210	ENST00000465902	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		7.97	□□□□□ -1.13
USP19-210	ENST00000465902	SERP2	Q8N6R1	65 aa		7.96	□□□□□ -1.14
USP19-210	ENST00000465902	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	7.95	□□□□□ -1.14
USP19-210	ENST00000465902	ACYP2	P14621	99 aa		7.95	□□□□□ -1.14
USP19-210	ENST00000465902	CRIPT	Q9P021	101 aa		7.95	□□□□□ -1.14
USP19-210	ENST00000465902	C20orf197	Q8N268	126 aa		7.94	□□□□□ -1.14
USP19-210	ENST00000465902		Q5VV11	94 aa		7.93	□□□□□ -1.14
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		7.88	□□□□□ -1.15
USP19-210	ENST00000465902	MT1B	P07438	61 aa		7.86	□□□□□ -1.15
USP19-210	ENST00000465902	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		7.85	□□□□□ -1.15
USP19-210	ENST00000465902	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		7.83	□□□□□ -1.16
USP19-210	ENST00000465902	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		7.81	□□□□□ -1.16
USP19-210	ENST00000465902		P0C880	135 aa		7.8	□□□□□ -1.16
USP19-210	ENST00000465902	COX7C	P15954	63 aa		7.77	□□□□□ -1.17
USP19-210	ENST00000465902		A6NN06	94 aa		7.76	□□□□□ -1.17
USP19-210	ENST00000465902		R4GN34	69 aa		7.76	□□□□□ -1.17
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		7.74	□□□□□ -1.17
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		7.72	□□□□□ -1.17
USP19-210	ENST00000465902		M0QZ58	72 aa		7.71	□□□□□ -1.18
USP19-210	ENST00000465902	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		7.65	□□□□□ -1.18
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP10-5	P60370	271 aa		7.64	□□□□□ -1.19
USP19-210	ENST00000465902	LINC01554	Q52M75	96 aa		7.63	□□□□□ -1.19
USP19-210	ENST00000465902	PLAC4	Q8WY50	150 aa		7.63	□□□□□ -1.19
USP19-210	ENST00000465902	COA5	Q86WW8	74 aa		7.61	□□□□□ -1.19
USP19-210	ENST00000465902	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		7.6	□□□□□ -1.19
USP19-210	ENST00000465902		H7BZZ5	65 aa		7.59	□□□□□ -1.19
USP19-210	ENST00000465902	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		7.5	□□□□□ -1.21
USP19-210	ENST00000465902	NEB	P20929	6669 aa		7.49	□□□□□ -1.21
USP19-210	ENST00000465902	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		7.49	□□□□□ -1.21
USP19-210	ENST00000465902	CCDC179	H3BU77	68 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP19-210	ENST00000465902	SEC61G	P60059	68 aa		7.45	□□□□□ -1.22
USP19-210	ENST00000465902	MT1X	P80297	61 aa		7.43	□□□□□ -1.22
USP19-210	ENST00000465902	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		7.43	□□□□□ -1.22
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP5-9	P26371	169 aa		7.36	□□□□□ -1.23
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		7.35	□□□□□ -1.23
USP19-210	ENST00000465902	KMT2D	O14686	5537 aa		7.32	□□□□□ -1.24
USP19-210	ENST00000465902	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
USP19-210	ENST00000465902	MDN1	Q9NU22	5596 aa		7.27	□□□□□ -1.24
USP19-210	ENST00000465902		A0A1B0GU33	70 aa		7.27	□□□□□ -1.25
USP19-210	ENST00000465902		A0A1B0GU69	56 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP19-210	ENST00000465902		A0A0D9SG42	100 aa		7.23	□□□□□ -1.25
USP19-210	ENST00000465902	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		7.23	□□□□□ -1.25
USP19-210	ENST00000465902	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		7.2	□□□□□ -1.26
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP12-2	P59991	146 aa		7.19	□□□□□ -1.26
USP19-210	ENST00000465902	TMEM258	P61165	79 aa		7.18	□□□□□ -1.26
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		7.18	□□□□□ -1.26
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		7.13	□□□□□ -1.27
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
USP19-210	ENST00000465902	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		7.12	□□□□□ -1.27
USP19-210	ENST00000465902	PRR15L	Q9BU68	103 aa		7.1	□□□□□ -1.27
USP19-210	ENST00000465902	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		7.08	□□□□□ -1.28
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		7.07	□□□□□ -1.28
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		7.07	□□□□□ -1.28
USP19-210	ENST00000465902	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		7.06	□□□□□ -1.28
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP10-12	P60413	245 aa		7.05	□□□□□ -1.28
USP19-210	ENST00000465902	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		7.03	□□□□□ -1.28
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP12-1	P59990	96 aa		7.02	□□□□□ -1.29
USP19-210	ENST00000465902		A8MU10	97 aa		7	□□□□□ -1.29
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		6.99	□□□□□ -1.29
USP19-210	ENST00000465902	SPRR2E	P22531	72 aa		6.99	□□□□□ -1.29
USP19-210	ENST00000465902	SPRR2B	P35325	72 aa		6.99	□□□□□ -1.29
USP19-210	ENST00000465902	SPRR2A	P35326	72 aa		6.99	□□□□□ -1.29
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		6.99	□□□□□ -1.29
USP19-210	ENST00000465902	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		6.92	□□□□□ -1.3
USP19-210	ENST00000465902	UQCR11	O14957	56 aa		6.85	□□□□□ -1.31
USP19-210	ENST00000465902		V9GYY9	64 aa		6.78	□□□□□ -1.32
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		6.77	□□□□□ -1.33
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		6.77	□□□□□ -1.33
USP19-210	ENST00000465902	SPRR2D	P22532	72 aa		6.76	□□□□□ -1.33
USP19-210	ENST00000465902	PSPHP1	O15172	72 aa		6.74	□□□□□ -1.33
USP19-210	ENST00000465902	PCP4	P48539	62 aa		6.72	□□□□□ -1.33
USP19-210	ENST00000465902	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		6.72	□□□□□ -1.33
USP19-210	ENST00000465902		Q1T7F1	81 aa		6.71	□□□□□ -1.34
USP19-210	ENST00000465902	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		6.7	□□□□□ -1.34
USP19-210	ENST00000465902	TNP1	P09430	55 aa		6.67	□□□□□ -1.34
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		6.62	□□□□□ -1.35
USP19-210	ENST00000465902		K7ERS5	55 aa		6.59	□□□□□ -1.35
USP19-210	ENST00000465902	LCE3B	Q5TA77	95 aa		6.59	□□□□□ -1.35
USP19-210	ENST00000465902	MT1E	P04732	61 aa		6.57	□□□□□ -1.36
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		6.57	□□□□□ -1.36
USP19-210	ENST00000465902	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
USP19-210	ENST00000465902		A6NED7	52 aa		6.54	□□□□□ -1.36
USP19-210	ENST00000465902	LCE3A	Q5TA76	89 aa		6.53	□□□□□ -1.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.6 ms