RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.8□□□□□ -1.48
PRAME-210ENST00000442481 COX7CP15954 63 aa5.79□□□□□ -1.48
PRAME-210ENST00000442481 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.79□□□□□ -1.48
PRAME-210ENST00000442481 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.79□□□□□ -1.48
PRAME-210ENST00000442481 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa5.78□□□□□ -1.48
PRAME-210ENST00000442481 H3BPC8 53 aa5.77□□□□□ -1.49
PRAME-210ENST00000442481 C20orf197Q8N268 126 aa5.77□□□□□ -1.49
PRAME-210ENST00000442481 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.77□□□□□ -1.49
PRAME-210ENST00000442481 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.75□□□□□ -1.49
PRAME-210ENST00000442481 SNURFQ9Y675 71 aa5.75□□□□□ -1.49
PRAME-210ENST00000442481 CCDC179H3BU77 68 aa5.71□□□□□ -1.5
PRAME-210ENST00000442481 KLKP1Q107X0 134 aa5.71□□□□□ -1.5
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.71□□□□□ -1.5
PRAME-210ENST00000442481 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.66□□□□□ -1.5
PRAME-210ENST00000442481 C4orf26Q17RF5 130 aa5.66□□□□□ -1.5
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.66□□□□□ -1.5
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.66□□□□□ -1.5
PRAME-210ENST00000442481 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.66□□□□□ -1.5
PRAME-210ENST00000442481 PCP4P48539 62 aa5.64□□□□□ -1.51
PRAME-210ENST00000442481 NDUFC1O43677 76 aa5.62□□□□□ -1.51
PRAME-210ENST00000442481 H7BZZ5 65 aa5.6□□□□□ -1.51
PRAME-210ENST00000442481 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.6□□□□□ -1.51
PRAME-210ENST00000442481 NEBP20929 6669 aa5.59□□□□□ -1.52
PRAME-210ENST00000442481 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.56□□□□□ -1.52
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.55□□□□□ -1.52
PRAME-210ENST00000442481 DMAC1Q96GE9 116 aa5.53□□□□□ -1.52
PRAME-210ENST00000442481 A8MUN3 132 aa5.52□□□□□ -1.53
PRAME-210ENST00000442481 TMEM258P61165 79 aa5.49□□□□□ -1.53
PRAME-210ENST00000442481 ACYP2P14621 99 aa5.48□□□□□ -1.53
PRAME-210ENST00000442481 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PRAME-210ENST00000442481 S4R3F8 94 aa5.47□□□□□ -1.53
PRAME-210ENST00000442481 LCA10Q71F78 164 aa5.43□□□□□ -1.54
PRAME-210ENST00000442481 H3BS24 57 aa5.42□□□□□ -1.54
PRAME-210ENST00000442481 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.42□□□□□ -1.54
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.42□□□□□ -1.54
PRAME-210ENST00000442481 COA5Q86WW8 74 aa5.42□□□□□ -1.54
PRAME-210ENST00000442481 A6NN06 94 aa5.39□□□□□ -1.55
PRAME-210ENST00000442481 CSAG1Q6PB30 78 aa5.39□□□□□ -1.55
PRAME-210ENST00000442481 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.38□□□□□ -1.55
PRAME-210ENST00000442481 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.33□□□□□ -1.56
PRAME-210ENST00000442481 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.33□□□□□ -1.56
PRAME-210ENST00000442481 Q5VV11 94 aa5.32□□□□□ -1.56
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP5-9P26371 169 aa5.25□□□□□ -1.57
PRAME-210ENST00000442481 MT1BP07438 61 aa5.24□□□□□ -1.57
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP10-5P60370 271 aa5.22□□□□□ -1.57
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.22□□□□□ -1.57
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.21□□□□□ -1.58
PRAME-210ENST00000442481 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.21□□□□□ -1.58
PRAME-210ENST00000442481 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PRAME-210ENST00000442481 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.2□□□□□ -1.58
PRAME-210ENST00000442481 KMT2DO14686 5537 aa5.18□□□□□ -1.58
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PRAME-210ENST00000442481 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.17□□□□□ -1.58
PRAME-210ENST00000442481 MDN1Q9NU22 5596 aa5.17□□□□□ -1.58
PRAME-210ENST00000442481 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.16□□□□□ -1.58
PRAME-210ENST00000442481 A0A1B0GU69 56 aa5.14□□□□□ -1.59
PRAME-210ENST00000442481 SEC61GP60059 68 aa5.14□□□□□ -1.59
PRAME-210ENST00000442481 P0C880 135 aa5.13□□□□□ -1.59
PRAME-210ENST00000442481 CRIPTQ9P021 101 aa5.13□□□□□ -1.59
PRAME-210ENST00000442481 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.13□□□□□ -1.59
PRAME-210ENST00000442481 V9GYY9 64 aa5.1□□□□□ -1.59
PRAME-210ENST00000442481 PRR15LQ9BU68 103 aa5.09□□□□□ -1.59
PRAME-210ENST00000442481 Q1T7F1 81 aa5.08□□□□□ -1.6
PRAME-210ENST00000442481 PSPHP1O15172 72 aa5.04□□□□□ -1.6
PRAME-210ENST00000442481 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.04□□□□□ -1.6
PRAME-210ENST00000442481 SPRR2EP22531 72 aa5.03□□□□□ -1.6
PRAME-210ENST00000442481 SPRR2BP35325 72 aa5.03□□□□□ -1.6
PRAME-210ENST00000442481 SPRR2AP35326 72 aa5.03□□□□□ -1.6
PRAME-210ENST00000442481 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.03□□□□□ -1.6
PRAME-210ENST00000442481 A0A1B0GU33 70 aa5.02□□□□□ -1.61
PRAME-210ENST00000442481 M0QZ58 72 aa5.02□□□□□ -1.61
PRAME-210ENST00000442481 R4GN34 69 aa5.02□□□□□ -1.61
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5□□□□□ -1.61
PRAME-210ENST00000442481 LCE3BQ5TA77 95 aa4.99□□□□□ -1.61
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.99□□□□□ -1.61
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.99□□□□□ -1.61
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.97□□□□□ -1.61
PRAME-210ENST00000442481 LINC01554Q52M75 96 aa4.96□□□□□ -1.62
PRAME-210ENST00000442481 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.96□□□□□ -1.62
PRAME-210ENST00000442481 PLAC4Q8WY50 150 aa4.95□□□□□ -1.62
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa4.94□□□□□ -1.62
PRAME-210ENST00000442481 UQCR11O14957 56 aa4.92□□□□□ -1.62
PRAME-210ENST00000442481 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.92□□□□□ -1.62
PRAME-210ENST00000442481 A6NED7 52 aa4.9□□□□□ -1.63
PRAME-210ENST00000442481 A0A0D9SG42 100 aa4.89□□□□□ -1.63
PRAME-210ENST00000442481 SPRR2DP22532 72 aa4.88□□□□□ -1.63
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.88□□□□□ -1.63
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.88□□□□□ -1.63
PRAME-210ENST00000442481 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.87□□□□□ -1.63
PRAME-210ENST00000442481 A8MU10 97 aa4.86□□□□□ -1.63
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP12-2P59991 146 aa4.85□□□□□ -1.63
PRAME-210ENST00000442481 MT1XP80297 61 aa4.84□□□□□ -1.63
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.79□□□□□ -1.64
PRAME-210ENST00000442481 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.79□□□□□ -1.64
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.77□□□□□ -1.65
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP12-1P59990 96 aa4.77□□□□□ -1.65
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PRAME-210ENST00000442481 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.73□□□□□ -1.65
PRAME-210ENST00000442481 BRK1Q8WUW1 75 aa4.71□□□□□ -1.66
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