RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427644.1

LIMD1-AS1-201, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMD1-AS1, Length 1,536 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.27□□□□□ -1.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.27□□□□□ -1.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.26□□□□□ -1.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.26□□□□□ -1.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PCLOQ9Y6V0 5065 aa5.25□□□□□ -1.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LPAP08519 4548 aa5.24□□□□□ -1.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HRES1P13985 223 aa5.23□□□□□ -1.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LRP2P98164 4655 aa5.21□□□□□ -1.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.2□□□□□ -1.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SPINK7P58062 85 aa5.16□□□□□ -1.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 COA5Q86WW8 74 aa5.15□□□□□ -1.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MUC17Q685J3 4493 aa5.15□□□□□ -1.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DMAC1Q96GE9 116 aa5.14□□□□□ -1.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HERC1Q15751 4861 aa5.12□□□□□ -1.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.12□□□□□ -1.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C4orf26Q17RF5 130 aa5.12□□□□□ -1.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ACYP2P14621 99 aa5.1□□□□□ -1.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.09□□□□□ -1.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.06□□□□□ -1.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.04□□□□□ -1.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A8MUN3 132 aa5.03□□□□□ -1.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.03□□□□□ -1.6
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.02□□□□□ -1.61
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 Q1T7F1 81 aa5.01□□□□□ -1.61
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.98□□□□□ -1.61
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.96□□□□□ -1.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 V9GYY9 64 aa4.95□□□□□ -1.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PSPHP1O15172 72 aa4.94□□□□□ -1.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PRR15LQ9BU68 103 aa4.93□□□□□ -1.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SVIPQ8NHG7 77 aa4.92□□□□□ -1.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.91□□□□□ -1.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 Q5VV11 94 aa4.91□□□□□ -1.62
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SPTSSBQ8NFR3 76 aa4.89□□□□□ -1.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LCA10Q71F78 164 aa4.88□□□□□ -1.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 S4R3F8 94 aa4.87□□□□□ -1.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RNF213Q63HN8 5207 aa4.84□□□□□ -1.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa4.84□□□□□ -1.63
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A0A1B0GU69 56 aa4.83□□□□□ -1.64
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.81□□□□□ -1.64
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MUC2Q02817 5179 aa4.79□□□□□ -1.64
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CSAG1Q6PB30 78 aa4.77□□□□□ -1.65
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.77□□□□□ -1.65
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A6NED7 52 aa4.77□□□□□ -1.65
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BRK1Q8WUW1 75 aa4.77□□□□□ -1.65
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A8MU10 97 aa4.76□□□□□ -1.65
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SEC61GP60059 68 aa4.76□□□□□ -1.65
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 M0R2T5 61 aa4.74□□□□□ -1.65
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MT1HP80294 61 aa4.71□□□□□ -1.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.69□□□□□ -1.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 P0C880 135 aa4.69□□□□□ -1.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.69□□□□□ -1.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A0A1B0GU33 70 aa4.68□□□□□ -1.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 UQCR11O14957 56 aa4.68□□□□□ -1.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ADM2Q7Z4H4 148 aa4.68□□□□□ -1.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.67□□□□□ -1.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PRO0628Q9UI54 55 aa4.67□□□□□ -1.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.67□□□□□ -1.66
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 H0YAA0 97 aa4.65□□□□□ -1.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.63□□□□□ -1.67
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.54□□□□□ -1.68
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A0A0D9SG42 100 aa4.52□□□□□ -1.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CRIPTQ9P021 101 aa4.52□□□□□ -1.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 M0QZ58 72 aa4.51□□□□□ -1.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A6NN06 94 aa4.5□□□□□ -1.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRTAP10-10P60014 251 aa4.5□□□□□ -1.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PMAIP1Q13794 54 aa4.49□□□□□ -1.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MT2AP02795 61 aa4.48□□□□□ -1.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 R4GN34 69 aa4.48□□□□□ -1.69
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MT1FP04733 61 aa4.45□□□□□ -1.7
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LINC01554Q52M75 96 aa4.43□□□□□ -1.7
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRTAP12-1P59990 96 aa4.42□□□□□ -1.7
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRTAP12-2P59991 146 aa4.42□□□□□ -1.7
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.4□□□□□ -1.71
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 K7ERS5 55 aa4.39□□□□□ -1.71
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.37□□□□□ -1.71
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SPRR2GQ9BYE4 73 aa4.37□□□□□ -1.71
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.32□□□□□ -1.72
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.31□□□□□ -1.72
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ROMO1P60602 79 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PLAC4Q8WY50 150 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PRAC1Q96KF2 57 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.21□□□□□ -1.74
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.2□□□□□ -1.74
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MT1BP07438 61 aa4.19□□□□□ -1.74
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LCE1EQ5T753 118 aa4.14□□□□□ -1.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PRO2289Q9P1D8 64 aa4.13□□□□□ -1.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.11□□□□□ -1.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.11□□□□□ -1.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 USH2AO75445 5202 aa4.1□□□□□ -1.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MT1XP80297 61 aa4.06□□□□□ -1.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRTAP10-5P60370 271 aa4.05□□□□□ -1.76
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.05□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms