RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 LCA10Q71F78 164 aa10.21□□□□□ -0.77
PACSIN3-201ENST00000298838 RPS28P62857 69 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
PACSIN3-201ENST00000298838 LCE2CQ5TA81 110 aa10.18□□□□□ -0.78
PACSIN3-201ENST00000298838 SPTSSBQ8NFR3 76 aa10.14□□□□□ -0.79
PACSIN3-201ENST00000298838 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa10.13□□□□□ -0.79
PACSIN3-201ENST00000298838 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
PACSIN3-201ENST00000298838 FAT4Q6V0I7 4981 aa10.08□□□□□ -0.8
PACSIN3-201ENST00000298838 CSAG1Q6PB30 78 aa10.05□□□□□ -0.8
PACSIN3-201ENST00000298838 SMIM26A0A096LP01 95 aa10.03□□□□□ -0.8
PACSIN3-201ENST00000298838 MT1HP80294 61 aa10.01□□□□□ -0.81
PACSIN3-201ENST00000298838 M0R2T5 61 aa9.93□□□□□ -0.82
PACSIN3-201ENST00000298838 V9GYY9 64 aa9.89□□□□□ -0.83
PACSIN3-201ENST00000298838 Q1T7F1 81 aa9.88□□□□□ -0.83
PACSIN3-201ENST00000298838 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa9.87□□□□□ -0.83
PACSIN3-201ENST00000298838 SEC61GP60059 68 aa9.82□□□□□ -0.84
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A1B0GU69 56 aa9.82□□□□□ -0.84
PACSIN3-201ENST00000298838 H0YAA0 97 aa9.8□□□□□ -0.84
PACSIN3-201ENST00000298838 PRR15LQ9BU68 103 aa9.78□□□□□ -0.84
PACSIN3-201ENST00000298838 ADM2Q7Z4H4 148 aa9.77□□□□□ -0.85
PACSIN3-201ENST00000298838 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PACSIN3-201ENST00000298838 PSPHP1O15172 72 aa9.72□□□□□ -0.85
PACSIN3-201ENST00000298838 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.72□□□□□ -0.85
PACSIN3-201ENST00000298838 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PACSIN3-201ENST00000298838 P0C880 135 aa9.67□□□□□ -0.86
PACSIN3-201ENST00000298838 LORP23490 312 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PACSIN3-201ENST00000298838 Q5VV11 94 aa9.62□□□□□ -0.87
PACSIN3-201ENST00000298838 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa9.6□□□□□ -0.87
PACSIN3-201ENST00000298838 MT2AP02795 61 aa9.56□□□□□ -0.88
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A1B0GU33 70 aa9.56□□□□□ -0.88
PACSIN3-201ENST00000298838 MT1FP04733 61 aa9.5□□□□□ -0.89
PACSIN3-201ENST00000298838 PRO0628Q9UI54 55 aa9.5□□□□□ -0.89
PACSIN3-201ENST00000298838 KRTAP10-10P60014 251 aa9.49□□□□□ -0.89
PACSIN3-201ENST00000298838 UQCR11O14957 56 aa9.48□□□□□ -0.89
PACSIN3-201ENST00000298838 CRIPTQ9P021 101 aa9.47□□□□□ -0.89
PACSIN3-201ENST00000298838 R4GN34 69 aa9.46□□□□□ -0.9
PACSIN3-201ENST00000298838 A6NED7 52 aa9.44□□□□□ -0.9
PACSIN3-201ENST00000298838 M0QZ58 72 aa9.44□□□□□ -0.9
PACSIN3-201ENST00000298838 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa9.4□□□□□ -0.9
PACSIN3-201ENST00000298838 SPATA8Q6RVD6 105 aa9.4□□□□□ -0.9
PACSIN3-201ENST00000298838 MIR22HGQ0VDD5 57 aa9.35□□□□□ -0.91
PACSIN3-201ENST00000298838 SPRR2GQ9BYE4 73 aa9.29□□□□□ -0.92
PACSIN3-201ENST00000298838 BRK1Q8WUW1 75 aa9.27□□□□□ -0.93
PACSIN3-201ENST00000298838 LINC01554Q52M75 96 aa9.26□□□□□ -0.93
PACSIN3-201ENST00000298838 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa9.26□□□□□ -0.93
PACSIN3-201ENST00000298838 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa9.26□□□□□ -0.93
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A0D9SG42 100 aa9.24□□□□□ -0.93
PACSIN3-201ENST00000298838 A8MU10 97 aa9.24□□□□□ -0.93
PACSIN3-201ENST00000298838 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa9.24□□□□□ -0.93
PACSIN3-201ENST00000298838 A6NN06 94 aa9.09□□□□□ -0.95
PACSIN3-201ENST00000298838 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa9.06□□□□□ -0.96
PACSIN3-201ENST00000298838 KRTAP12-1P59990 96 aa9.04□□□□□ -0.96
PACSIN3-201ENST00000298838 SPINT4Q6UDR6 99 aa9.04□□□□□ -0.96
PACSIN3-201ENST00000298838 LCE2BO14633 110 aa9.03□□□□□ -0.96
PACSIN3-201ENST00000298838 KRTAP12-2P59991 146 aa9.01□□□□□ -0.97
PACSIN3-201ENST00000298838 K7ERS5 55 aa8.99□□□□□ -0.97
PACSIN3-201ENST00000298838 PLAC4Q8WY50 150 aa8.96□□□□□ -0.97
PACSIN3-201ENST00000298838 MT1BP07438 61 aa8.95□□□□□ -0.98
PACSIN3-201ENST00000298838 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PACSIN3-201ENST00000298838 PMAIP1Q13794 54 aa8.91□□□□□ -0.98
PACSIN3-201ENST00000298838 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa8.84□□□□□ -0.99
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PACSIN3-201ENST00000298838 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa8.69□□□□□ -1.02
PACSIN3-201ENST00000298838 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.69□□□□□ -1.02
PACSIN3-201ENST00000298838 MT1XP80297 61 aa8.62□□□□□ -1.03
PACSIN3-201ENST00000298838 FSIP2Q5CZC0 6907 aa8.61□□□□□ -1.03
PACSIN3-201ENST00000298838 PRO2289Q9P1D8 64 aa8.61□□□□□ -1.03
PACSIN3-201ENST00000298838 KRTAP10-5P60370 271 aa8.6□□□□□ -1.03
PACSIN3-201ENST00000298838 ROMO1P60602 79 aa8.56□□□□□ -1.04
PACSIN3-201ENST00000298838 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.56□□□□□ -1.04
PACSIN3-201ENST00000298838 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa8.54□□□□□ -1.04
PACSIN3-201ENST00000298838 SSPOA2VEC9 5147 aa8.54□□□□□ -1.04
PACSIN3-201ENST00000298838 TNP1P09430 55 aa8.37□□□□□ -1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 CRCT1Q9UGL9 99 aa8.36□□□□□ -1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.33□□□□□ -1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PACSIN3-201ENST00000298838 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 KRTAP10-12P60413 245 aa8.19□□□□□ -1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 PRAC1Q96KF2 57 aa8.15□□□□□ -1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.08□□□□□ -1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 KRTAP23-1A1A580 65 aa8.04□□□□□ -1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 LCE3AQ5TA76 89 aa8.03□□□□□ -1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 PP632Q6XCG6 107 aa8.02□□□□□ -1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.98□□□□□ -1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.98□□□□□ -1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 KMT2DO14686 5537 aa7.92□□□□□ -1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.85□□□□□ -1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa7.75□□□□□ -1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 KRTAP12-3P60328 96 aa7.73□□□□□ -1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa7.69□□□□□ -1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.59□□□□□ -1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 MT1EP04732 61 aa7.57□□□□□ -1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 KRTAP5-9P26371 169 aa7.55□□□□□ -1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.52□□□□□ -1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa7.5□□□□□ -1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 H3BS24 57 aa7.43□□□□□ -1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 MT1LQ93083 61 aa7.39□□□□□ -1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.39□□□□□ -1.23
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