RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000108593.7

Ctdnep1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdnep1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm10112D3YWP5 117 aa22.2■■□□□ 1.15
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Higd1bQ99JY6 98 aa22.2■■□□□ 1.15
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Uqcc1Q9CWU6 295 aa22.2■■□□□ 1.15
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr403Q7TRX2 313 aa22.2■■□□□ 1.14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr365Q8VFT2 312 aa22.2■■□□□ 1.14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Chchd5Q9CQP3 110 aa22.2■■□□□ 1.14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rsg1A2A825 258 aa22.19■■□□□ 1.14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm7489Q3UT34 171 aa22.19■■□□□ 1.14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fam173aQ501J2 229 aa22.19■■□□□ 1.14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr745Q7TRL9 328 aa22.19■■□□□ 1.14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Spink11Q09TK7 88 aa22.18■■□□□ 1.14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Prr3Q811B5 190 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Shisa2Q8QZV2 295 aa22.18■■□□□ 1.14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 V1ra8Q9EQ48 279 aa22.18■■□□□ 1.14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ighv9-1A0A0B4J1P3 117 aa22.17■■□□□ 1.14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ndufb4Q9CQC7 129 aa22.17■■□□□ 1.14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm17349F7BGH6 99 aa22.17■■□□□ 1.14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm6970F7DCP6 221 aa22.17■■□□□ 1.14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tcf21O35437 179 aa22.17■■□□□ 1.14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fam103a1Q9CQY2 119 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Hsbp1Q9CQZ1 76 aa22.17■■□□□ 1.14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm33815A0A087WNV3 176 aa22.16■■□□□ 1.14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm29644A0A087WPG2 191 aa22.16■■□□□ 1.14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Saa3P04918 122 aa22.16■■□□□ 1.14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Defa11P50709 85 aa22.16■■□□□ 1.14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 BC048562Q80ZQ7 204 aa22.16■■□□□ 1.14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Obox1Q9D350 204 aa22.16■■□□□ 1.14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pkd1l1Q8R526 2615 aa22.16■■□□□ 1.14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fa2hQ5MPP0 372 aa22.15■■□□□ 1.14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm28372A0A087WNV0 220 aa22.14■■□□□ 1.14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zcwpw2Q08EN7 125 aa22.14■■□□□ 1.14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Crip2Q9DCT8 208 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Trdv2-2Q5R1A4 116 aa22.13■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 C730034F03RikQ8BGL5 111 aa22.13■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slc16a4Q8R0M8 500 aa22.13■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ifi27Q8C6G0 260 aa22.13■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ighv1-63A0A075B5X2 117 aa22.12■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Acrv1P50289 261 aa22.12■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Crebl2Q32M00 123 aa22.12■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zfp825A0A1Y7VK00 292 aa22.11■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr311Q5NC59 308 aa22.11■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Q9D8L0 127 aa22.11■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nit2Q9JHW2 276 aa22.11■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rabac1Q9Z0S9 185 aa22.11■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 TymsP07607 307 aa22.1■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm21748Q3UE70 102 aa22.1■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1700015F17RikD3YUK8 150 aa22.09■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr779E9PUS9 130 aa22.09■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 CryzP47199 331 aa22.09■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Q8R092 253 aa22.09■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Golt1bQ9CR60 138 aa22.09■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Spry2Q9QXV8 315 aa22.09■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dnah14A0A140LIJ4 4489 aa22.09■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1520401A03RikA0A0J9YVH6 598 aa22.09■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm45800A0A1B0GT24 152 aa22.09■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ctf1Q60753 203 aa22.09■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 MycbQ6P8Z1 170 aa22.09■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tmed3Q78IS1 221 aa22.09■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 QrfpQ8CE23 124 aa22.09■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vmn1r70Q8R254 298 aa22.09■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Derl1Q99J56 251 aa22.09■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Atoh7Q9Z2E5 149 aa22.09■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vamp5Q9Z2P8 102 aa22.09■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ighv8-4A0A0A6YW26 117 aa22.08■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rhox7bA6PW38 321 aa22.08■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Defa34D3Z0J0 93 aa22.08■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Defa37K9J724 93 aa22.08■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Defa5P28312 93 aa22.08■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Psmb11Q8BG41 302 aa22.08■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ube2tQ9CQ37 204 aa22.08■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Q9D8Q6 235 aa22.08■■□□□ 1.13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ccl1P10146 92 aa22.07■■□□□ 1.12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr1380Q7TQT5 311 aa22.07■■□□□ 1.12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr963Q7TRA9 311 aa22.07■■□□□ 1.12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Carhsp1Q9CR86 148 aa22.07■■□□□ 1.12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zfp931A2AHM2 298 aa22.06■■□□□ 1.12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cdx1P18111 268 aa22.06■■□□□ 1.12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fxyd4Q9D2W0 88 aa22.06■■□□□ 1.12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 C130073F10RikQ8C4L8 201 aa22.06■■□□□ 1.12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rasl10aQ8K5A4 203 aa22.06■■□□□ 1.12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tmem128Q9CZB9 163 aa22.06■■□□□ 1.12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ighv1-15A0A0A6YXA5 117 aa22.05■■□□□ 1.12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm5741B2RVA4 72 aa22.05■■□□□ 1.12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm5468Q8C3D3 155 aa22.05■■□□□ 1.12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 MrapQ9D159 127 aa22.05■■□□□ 1.12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 AI854703Q8BIN3 203 aa22.04■■□□□ 1.12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fam241aQ9CZL2 131 aa22.04■■□□□ 1.12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 GlmpQ9JHJ3 404 aa22.04■■□□□ 1.12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Muc6Q80T03 2850 aa22.03■■□□□ 1.12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 4933415F23RikQ14BX6 153 aa22.03■■□□□ 1.12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Spink2Q8BMY7 86 aa22.03■■□□□ 1.12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Shisal2bQ9D1Y9 158 aa22.03■■□□□ 1.12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ms4a4bQ9ES61 226 aa22.03■■□□□ 1.12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kcnip3Q9QXT8 256 aa22.03■■□□□ 1.12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tenm2Q9WTS5 2764 aa22.03■■□□□ 1.12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sox15P43267 231 aa22.02■■□□□ 1.12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gstp2P46425 210 aa22.02■■□□□ 1.12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mbd3l2Q3UXB0 228 aa22.02■■□□□ 1.12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 ErasQ7TN89 227 aa22.02■■□□□ 1.12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tmem208Q9CR96 173 aa22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 48.9 ms