Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Trdv2-2Q5R1A4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25,94■■□□□ 1,74
Trdv2-2Q5R1A4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Trdv2-2Q5R1A4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,04■■□□□ 1,6
Trdv2-2Q5R1A4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Trdv2-2Q5R1A4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24,25■■□□□ 1,47
Trdv2-2Q5R1A4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Trdv2-2Q5R1A4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Trdv2-2Q5R1A4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Trdv2-2Q5R1A4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Trdv2-2Q5R1A4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23,36■■□□□ 1,33
Trdv2-2Q5R1A4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Trdv2-2Q5R1A4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Trdv2-2Q5R1A4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Trdv2-2Q5R1A4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23,13■■□□□ 1,29
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22,92■■□□□ 1,26
Trdv2-2Q5R1A4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Trdv2-2Q5R1A4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Trdv2-2Q5R1A4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Trdv2-2Q5R1A4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Trdv2-2Q5R1A4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Trdv2-2Q5R1A4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Trdv2-2Q5R1A4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Trdv2-2Q5R1A4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Trdv2-2Q5R1A4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Trdv2-2Q5R1A4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22,39■■□□□ 1,18
Trdv2-2Q5R1A4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22,37■■□□□ 1,17
Trdv2-2Q5R1A4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
Trdv2-2Q5R1A4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22,32■■□□□ 1,16
Trdv2-2Q5R1A4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22,17■■□□□ 1,14
Trdv2-2Q5R1A4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Trdv2-2Q5R1A4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Trdv2-2Q5R1A4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22,13■■□□□ 1,13
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22,04■■□□□ 1,12
Trdv2-2Q5R1A4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Trdv2-2Q5R1A4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Trdv2-2Q5R1A4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Trdv2-2Q5R1A4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21,95■■□□□ 1,1
Trdv2-2Q5R1A4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21,89■■□□□ 1,1
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Trdv2-2Q5R1A4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21,81■■□□□ 1,08
Trdv2-2Q5R1A4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Trdv2-2Q5R1A4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21,79■■□□□ 1,08
Trdv2-2Q5R1A4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Trdv2-2Q5R1A4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,76■■□□□ 1,07
Trdv2-2Q5R1A4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Trdv2-2Q5R1A4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Trdv2-2Q5R1A4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Trdv2-2Q5R1A4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Trdv2-2Q5R1A4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21,62■■□□□ 1,05
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Trdv2-2Q5R1A4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Trdv2-2Q5R1A4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Trdv2-2Q5R1A4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21,48■■□□□ 1,03
Trdv2-2Q5R1A4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Trdv2-2Q5R1A4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Trdv2-2Q5R1A4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,46■■□□□ 1,03
Trdv2-2Q5R1A4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Trdv2-2Q5R1A4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Trdv2-2Q5R1A4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21,42■■□□□ 1,02
Trdv2-2Q5R1A4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21,41■■□□□ 1,02
Trdv2-2Q5R1A4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,02
Trdv2-2Q5R1A4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Trdv2-2Q5R1A4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,27■■□□□ 1
Trdv2-2Q5R1A4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Trdv2-2Q5R1A4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Trdv2-2Q5R1A4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Trdv2-2Q5R1A4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Trdv2-2Q5R1A4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Trdv2-2Q5R1A4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21,11■□□□□ 0,97
Trdv2-2Q5R1A4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Trdv2-2Q5R1A4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0,95
Trdv2-2Q5R1A4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Trdv2-2Q5R1A4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Trdv2-2Q5R1A4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Trdv2-2Q5R1A4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Trdv2-2Q5R1A4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Trdv2-2Q5R1A4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,84■□□□□ 0,93
Trdv2-2Q5R1A4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20,78■□□□□ 0,92
Trdv2-2Q5R1A4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Trdv2-2Q5R1A4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,78■□□□□ 0,92
Trdv2-2Q5R1A4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Trdv2-2Q5R1A4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Trdv2-2Q5R1A4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Trdv2-2Q5R1A4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,7■□□□□ 0,9
Trdv2-2Q5R1A4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Trdv2-2Q5R1A4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Trdv2-2Q5R1A4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Trdv2-2Q5R1A4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Trdv2-2Q5R1A4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20,65■□□□□ 0,9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8,2 ms