RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000059272.9

Hoxd9-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd9, Length 2,136 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ccl24Q9JKC0 119 aa17.73■□□□□ 0.43
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Usp9yF8VPU6 2556 aa17.72■□□□□ 0.43
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 IcosQ9WVS0 200 aa17.72■□□□□ 0.43
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 MtorQ9JLN9 2549 aa17.72■□□□□ 0.43
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fbxl7Q5BJ29 491 aa17.72■□□□□ 0.43
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Srsf2Q62093 221 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Muc15Q8C6Z1 331 aa17.72■□□□□ 0.43
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr1402Q8VET1 320 aa17.72■□□□□ 0.43
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fam241bQ9D882 120 aa17.72■□□□□ 0.43
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nat6Q9R123 314 aa17.72■□□□□ 0.43
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Akap13E9Q394 2776 aa17.71■□□□□ 0.43
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tcte2E9PY37 120 aa17.71■□□□□ 0.43
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm26661M0QWV4 156 aa17.71■□□□□ 0.43
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm10226O88253 85 aa17.71■□□□□ 0.43
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm10130F6ZHM5 101 aa17.71■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rps20P60867 119 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 QrfpQ8CE23 124 aa17.71■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 GlmpQ9JHJ3 404 aa17.71■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 9530053A07RikE9PVG8 2581 aa17.7■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 1500009C09RikD3YYW9 81 aa17.7■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr975Q8VG91 310 aa17.7■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Arl3Q9WUL7 182 aa17.7■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Trav16nA0A075B634 117 aa17.69■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Usmg5Q78IK2 58 aa17.69■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Odf3l1Q810P2 275 aa17.69■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rasl10aQ8K5A4 203 aa17.69■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ighv1-22A0A075B5U7 117 aa17.69■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm10036E9PYL9 178 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mbd3l2Q3UXB0 228 aa17.69■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Trpt1Q8K3A2 249 aa17.69■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hyls1Q9CXX0 307 aa17.69■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fam19a2Q7TPG7 131 aa17.68■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm5868Q8BJG1 145 aa17.68■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr477Q8VGI6 310 aa17.68■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Wfdc15bQ9JHY4 80 aa17.68■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Bex1Q9R224 128 aa17.68■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm3250E9Q1M3 230 aa17.67■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Shisal1Q0VBP7 198 aa17.67■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Crip3Q6Q6R3 243 aa17.67■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tnfsf18Q7TS55 173 aa17.67■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tmem177Q8BPE4 311 aa17.67■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Trav21-dv12A0A075B6C4 109 aa17.66■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tcf21O35437 179 aa17.66■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Leprotl1Q9CQ74 131 aa17.66■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rbm7Q9CQT2 265 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Muc4Q8JZM8 3443 aa17.66■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fgf5P15656 264 aa17.65■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 RnasekQ8K3C0 98 aa17.65■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr1195Q8VG21 308 aa17.65■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tnfsf15Q5UBV8 252 aa17.65■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hcfc2Q9D968 241 aa17.65■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cml3Q9JIY8 226 aa17.65■□□□□ 0.42
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Trdv2-2Q5R1A4 116 aa17.64■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Borcs7Q9CRC6 105 aa17.64■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Plpp2Q9DAX2 276 aa17.64■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dpm3Q9D1Q4 92 aa17.63■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Trav7-5A0A0G2JFX6 112 aa17.63■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm94Q3V2D2 93 aa17.63■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr1431Q8VF59 312 aa17.63■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr365Q8VFT2 312 aa17.63■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ly86O88188 162 aa17.62■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 SbsponQ3UPR9 264 aa17.62■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hist2h2beQ64524 126 aa17.62■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 CnfnQ6PCW6 111 aa17.62■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm9961Q8BNV2 113 aa17.62■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 UrahQ9CRB3 118 aa17.62■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zfp867E9Q2M4 473 aa17.62■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Srp14P16254 110 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Shisa9Q9CZN4 424 aa17.62■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ighv1-16A0A075B5U1 98 aa17.61■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Bri3P28662 125 aa17.61■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tmem241Q3UME2 297 aa17.61■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Arl11Q6P3A9 176 aa17.61■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr1262Q8VGN2 304 aa17.6■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Trav12-3A0A075B648 115 aa17.6■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm10521E9PZK0 135 aa17.6■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pmp2P24526 132 aa17.6■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hspe1Q64433 102 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ifitm2Q99J93 144 aa17.6■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gtsf1lQ9CWD0 151 aa17.6■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ube2l6Q9QZU9 153 aa17.6■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zfp462B1AWL2 2495 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zfp248Q640N4 576 aa17.59■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Vsig8Q6P3A4 417 aa17.59■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Vmn1r202Q8R259 302 aa17.59■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Q9D7E4 109 aa17.59■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Q9DAB9 146 aa17.59■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pla2g2eQ9QUL3 142 aa17.59■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nav3Q80TN7 2359 aa17.59■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 1810011H11RikE9PVZ2 95 aa17.59■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ormdl3Q9CPZ6 153 aa17.59■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zmat5Q9CQR5 170 aa17.59■□□□□ 0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 P01793 123 aa17.58■□□□□ 0.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Foxc2Q61850 494 aa17.58■□□□□ 0.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Psmb11Q8BG41 302 aa17.58■□□□□ 0.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fam103a1Q9CQY2 119 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mrpl53Q9D1H8 118 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ighv1-80A0A075B5Y3 117 aa17.57■□□□□ 0.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm20517G3UVU6 152 aa17.57■□□□□ 0.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 TbpP29037 316 aa17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.9 ms