RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641549.1

PTPRVP-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

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Gene PTPRVP, Length 5,067 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-205ENST00000641549 EYSQ5T1H1 3165 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRVP-205ENST00000641549 NBEAQ8NFP9 2946 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRVP-205ENST00000641549 ZZEF1O43149 2961 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRVP-205ENST00000641549 H3BS24 57 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRVP-205ENST00000641549 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRVP-205ENST00000641549 PLAC4Q8WY50 150 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRVP-205ENST00000641549 A8MUU9 505 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRVP-205ENST00000641549 COL6A3P12111 3177 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRVP-205ENST00000641549 ZANQ9Y493 2812 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRVP-205ENST00000641549 FREM2Q5SZK8 3169 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRVP-205ENST00000641549 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRVP-205ENST00000641549 CELSR2Q9HCU4 2923 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRVP-205ENST00000641549 A6NN06 94 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRVP-205ENST00000641549 REV3LO60673 3130 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRVP-205ENST00000641549 DNAH14Q0VDD8 3507 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRVP-205ENST00000641549 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRVP-205ENST00000641549 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRVP-205ENST00000641549 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRVP-205ENST00000641549 DCHS2Q6V1P9 2916 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRVP-205ENST00000641549 DMXL1Q9Y485 3027 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRVP-205ENST00000641549 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRVP-205ENST00000641549 USP34Q70CQ2 3546 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRVP-205ENST00000641549 A0A0A0MQY5 61 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRVP-205ENST00000641549 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRVP-205ENST00000641549 A8MU10 97 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRVP-205ENST00000641549 XP32Q5T750 250 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRVP-205ENST00000641549 NF1P21359 2839 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRVP-205ENST00000641549 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRVP-205ENST00000641549 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRVP-205ENST00000641549 TPRXLQ17RH7 258 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRVP-205ENST00000641549 FBN2P35556 2912 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRVP-205ENST00000641549 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRVP-205ENST00000641549 MXRA5Q9NR99 2828 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRVP-205ENST00000641549 LOC400499M0QZD8 3231 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRVP-205ENST00000641549 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRVP-205ENST00000641549 TNP1P09430 55 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRVP-205ENST00000641549 TENM3Q9P273 2699 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRVP-205ENST00000641549 A0A1B0GVY2 172 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRVP-205ENST00000641549 SPEGQ15772 3267 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRVP-205ENST00000641549 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRVP-205ENST00000641549 TENM2Q9NT68 2774 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRVP-205ENST00000641549 KRTAP10-8P60410 259 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRVP-205ENST00000641549 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRVP-205ENST00000641549 PDZD2O15018 2839 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRVP-205ENST00000641549 PP632Q6XCG6 107 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRVP-205ENST00000641549 H0YAA0 97 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRVP-205ENST00000641549 NDUFAF8A1L188 74 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRVP-205ENST00000641549 TGP01266 2768 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRVP-205ENST00000641549 KRTAP10-10P60014 251 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRVP-205ENST00000641549 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRVP-205ENST00000641549 MYO15AQ9UKN7 3530 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRVP-205ENST00000641549 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRVP-205ENST00000641549 RELNP78509 3460 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRVP-205ENST00000641549 P0C880 135 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRVP-205ENST00000641549 DCHS1Q96JQ0 3298 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRVP-205ENST00000641549 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRVP-205ENST00000641549 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRVP-205ENST00000641549 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa6.69□□□□□ -1.34
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PTPRVP-205ENST00000641549 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
PTPRVP-205ENST00000641549 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRVP-205ENST00000641549 LAMA5O15230 3695 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRVP-205ENST00000641549 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRVP-205ENST00000641549 ASPMQ8IZT6 3477 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRVP-205ENST00000641549 KRTAP12-2P59991 146 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRVP-205ENST00000641549 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRVP-205ENST00000641549 KRTAP12-1P59990 96 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRVP-205ENST00000641549 ZFHX4Q86UP3 3567 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRVP-205ENST00000641549 MT1HL1P0DM35 61 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRVP-205ENST00000641549 DMDP11532 3685 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRVP-205ENST00000641549 FBN3Q75N90 2809 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRVP-205ENST00000641549 ZFHX3Q15911 3703 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRVP-205ENST00000641549 MUC3AQ02505 3323 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRVP-205ENST00000641549 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRVP-205ENST00000641549 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRVP-205ENST00000641549 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRVP-205ENST00000641549 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRVP-205ENST00000641549 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRVP-205ENST00000641549 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRVP-205ENST00000641549 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRVP-205ENST00000641549 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRVP-205ENST00000641549 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRVP-205ENST00000641549 COL7A1Q02388 2944 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRVP-205ENST00000641549 CSMD2Q7Z408 3487 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRVP-205ENST00000641549 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRVP-205ENST00000641549 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRVP-205ENST00000641549 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRVP-205ENST00000641549 BSNQ9UPA5 3926 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRVP-205ENST00000641549 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRVP-205ENST00000641549 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRVP-205ENST00000641549 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRVP-205ENST00000641549 CUBNO60494 3623 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRVP-205ENST00000641549 DNAH9Q9NYC9 4486 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRVP-205ENST00000641549 KRTAP10-12P60413 245 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRVP-205ENST00000641549 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRVP-205ENST00000641549 DNAH5Q8TE73 4624 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRVP-205ENST00000641549 VPS13CQ709C8 3753 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRVP-205ENST00000641549 DNAH10Q8IVF4 4471 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRVP-205ENST00000641549 KRTAP12-3P60328 96 aa5.74□□□□□ -1.49
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