RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 APCP25054 2843 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRM-211ENST00000580170 XP32Q5T750 250 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRM-211ENST00000580170 LRBAP50851 2863 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRM-211ENST00000580170 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
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PTPRM-211ENST00000580170 ZFHX4Q86UP3 3567 aa9.9□□□□□ -0.82
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PTPRM-211ENST00000580170 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa9.83□□□□□ -0.84
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PTPRM-211ENST00000580170 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
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PTPRM-211ENST00000580170 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa9.23□□□□□ -0.93
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PTPRM-211ENST00000580170 KRTAP23-1A1A580 65 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRM-211ENST00000580170 CSMD2Q7Z408 3487 aa9.16□□□□□ -0.94
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PTPRM-211ENST00000580170 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PTPRM-211ENST00000580170 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PTPRM-211ENST00000580170 ALMS1Q8TCU4 4167 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRM-211ENST00000580170 LORP23490 312 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
PTPRM-211ENST00000580170 COL7A1Q02388 2944 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRM-211ENST00000580170 CUBNO60494 3623 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRM-211ENST00000580170 BSNQ9UPA5 3926 aa8.95□□□□□ -0.98
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