RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430930.5

TNS1-207, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 5,900 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-207ENST00000430930 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TNS1-207ENST00000430930 HIVEP1P15822 2718 aa6.52□□□□□ -1.37
TNS1-207ENST00000430930 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
TNS1-207ENST00000430930 KALRNO60229 2985 aa6.47□□□□□ -1.37
TNS1-207ENST00000430930 LAMA1P25391 3075 aa6.47□□□□□ -1.37
TNS1-207ENST00000430930 VPS13AQ96RL7 3174 aa6.45□□□□□ -1.38
TNS1-207ENST00000430930 BRCA2P51587 3418 aa6.45□□□□□ -1.38
TNS1-207ENST00000430930 LRBAP50851 2863 aa6.44□□□□□ -1.38
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP12-2P59991 146 aa6.44□□□□□ -1.38
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.43□□□□□ -1.38
TNS1-207ENST00000430930 FLNCQ14315 2725 aa6.4□□□□□ -1.38
TNS1-207ENST00000430930 XIRP2A4UGR9 3374 aa6.4□□□□□ -1.39
TNS1-207ENST00000430930 CDH23Q9H251 3354 aa6.4□□□□□ -1.39
TNS1-207ENST00000430930 ATMQ13315 3056 aa6.4□□□□□ -1.39
TNS1-207ENST00000430930 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.4□□□□□ -1.39
TNS1-207ENST00000430930 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa6.35□□□□□ -1.39
TNS1-207ENST00000430930 REV3LO60673 3130 aa6.35□□□□□ -1.39
TNS1-207ENST00000430930 COL12A1Q99715 3063 aa6.34□□□□□ -1.39
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP12-1P59990 96 aa6.34□□□□□ -1.4
TNS1-207ENST00000430930 COL6A3P12111 3177 aa6.33□□□□□ -1.4
TNS1-207ENST00000430930 EYSQ5T1H1 3165 aa6.32□□□□□ -1.4
TNS1-207ENST00000430930 TENM4Q6N022 2769 aa6.31□□□□□ -1.4
TNS1-207ENST00000430930 TACC2O95359 2948 aa6.31□□□□□ -1.4
TNS1-207ENST00000430930 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.28□□□□□ -1.4
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.26□□□□□ -1.41
TNS1-207ENST00000430930 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.26□□□□□ -1.41
TNS1-207ENST00000430930 SZT2Q5T011 3432 aa6.26□□□□□ -1.41
TNS1-207ENST00000430930 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
TNS1-207ENST00000430930 DNAH14Q0VDD8 3507 aa6.23□□□□□ -1.41
TNS1-207ENST00000430930 FRYLO94915 3013 aa6.21□□□□□ -1.41
TNS1-207ENST00000430930 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa6.21□□□□□ -1.41
TNS1-207ENST00000430930 ZZEF1O43149 2961 aa6.21□□□□□ -1.42
TNS1-207ENST00000430930 VCANP13611 3396 aa6.21□□□□□ -1.42
TNS1-207ENST00000430930 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
TNS1-207ENST00000430930 FREM2Q5SZK8 3169 aa6.19□□□□□ -1.42
TNS1-207ENST00000430930 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.18□□□□□ -1.42
TNS1-207ENST00000430930 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.16□□□□□ -1.42
TNS1-207ENST00000430930 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
TNS1-207ENST00000430930 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.14□□□□□ -1.43
TNS1-207ENST00000430930 USP34Q70CQ2 3546 aa6.14□□□□□ -1.43
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.14□□□□□ -1.43
TNS1-207ENST00000430930 NBEAQ8NFP9 2946 aa6.13□□□□□ -1.43
TNS1-207ENST00000430930 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
TNS1-207ENST00000430930 TGP01266 2768 aa6.1□□□□□ -1.43
TNS1-207ENST00000430930 TENM2Q9NT68 2774 aa6.08□□□□□ -1.44
TNS1-207ENST00000430930 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa6.06□□□□□ -1.44
TNS1-207ENST00000430930 ZANQ9Y493 2812 aa6.05□□□□□ -1.44
TNS1-207ENST00000430930 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.03□□□□□ -1.44
TNS1-207ENST00000430930 NF1P21359 2839 aa6□□□□□ -1.45
TNS1-207ENST00000430930 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa5.97□□□□□ -1.45
TNS1-207ENST00000430930 MT1HL1P0DM35 61 aa5.96□□□□□ -1.45
TNS1-207ENST00000430930 DMXL1Q9Y485 3027 aa5.94□□□□□ -1.46
TNS1-207ENST00000430930 TENM3Q9P273 2699 aa5.92□□□□□ -1.46
TNS1-207ENST00000430930 FBN2P35556 2912 aa5.92□□□□□ -1.46
TNS1-207ENST00000430930 INE1O15225 51 aa5.9□□□□□ -1.46
TNS1-207ENST00000430930 SPEGQ15772 3267 aa5.89□□□□□ -1.47
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.88□□□□□ -1.47
TNS1-207ENST00000430930 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP10-12P60413 245 aa5.87□□□□□ -1.47
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.87□□□□□ -1.47
TNS1-207ENST00000430930 PDZD2O15018 2839 aa5.87□□□□□ -1.47
TNS1-207ENST00000430930 MXRA5Q9NR99 2828 aa5.87□□□□□ -1.47
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.82□□□□□ -1.48
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
TNS1-207ENST00000430930 ALMS1Q8TCU4 4167 aa5.77□□□□□ -1.49
TNS1-207ENST00000430930 MYO15AQ9UKN7 3530 aa5.76□□□□□ -1.49
TNS1-207ENST00000430930 LOC400499M0QZD8 3231 aa5.74□□□□□ -1.49
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP12-3P60328 96 aa5.69□□□□□ -1.5
TNS1-207ENST00000430930 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa5.67□□□□□ -1.5
TNS1-207ENST00000430930 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa5.66□□□□□ -1.5
TNS1-207ENST00000430930 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
TNS1-207ENST00000430930 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.64□□□□□ -1.51
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.64□□□□□ -1.51
TNS1-207ENST00000430930 LCE3AQ5TA76 89 aa5.6□□□□□ -1.51
TNS1-207ENST00000430930 DMDP11532 3685 aa5.58□□□□□ -1.52
TNS1-207ENST00000430930 OTOGQ6ZRI0 2925 aa5.58□□□□□ -1.52
TNS1-207ENST00000430930 ASPMQ8IZT6 3477 aa5.57□□□□□ -1.52
TNS1-207ENST00000430930 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa5.57□□□□□ -1.52
TNS1-207ENST00000430930 RELNP78509 3460 aa5.57□□□□□ -1.52
TNS1-207ENST00000430930 VWFP04275 2813 aa5.53□□□□□ -1.52
TNS1-207ENST00000430930 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
TNS1-207ENST00000430930 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
TNS1-207ENST00000430930 DCHS1Q96JQ0 3298 aa5.44□□□□□ -1.54
TNS1-207ENST00000430930 FBN3Q75N90 2809 aa5.44□□□□□ -1.54
TNS1-207ENST00000430930 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa5.43□□□□□ -1.54
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.41□□□□□ -1.54
TNS1-207ENST00000430930 ZFHX4Q86UP3 3567 aa5.4□□□□□ -1.55
TNS1-207ENST00000430930 CSMD1Q96PZ7 3565 aa5.38□□□□□ -1.55
TNS1-207ENST00000430930 LAMA5O15230 3695 aa5.36□□□□□ -1.55
TNS1-207ENST00000430930 MUC3AQ02505 3323 aa5.36□□□□□ -1.55
TNS1-207ENST00000430930 ZFHX3Q15911 3703 aa5.35□□□□□ -1.55
TNS1-207ENST00000430930 DNAH2Q9P225 4427 aa5.34□□□□□ -1.55
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP10-5P60370 271 aa5.29□□□□□ -1.56
TNS1-207ENST00000430930 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa5.28□□□□□ -1.56
TNS1-207ENST00000430930 DNAH9Q9NYC9 4486 aa5.27□□□□□ -1.57
TNS1-207ENST00000430930 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
TNS1-207ENST00000430930 MT1HP80294 61 aa5.26□□□□□ -1.57
TNS1-207ENST00000430930 DNAH1Q9P2D7 4330 aa5.26□□□□□ -1.57
TNS1-207ENST00000430930 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.21□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms