RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 M0QZ58 72 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP4-201ENST00000344528 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-201ENST00000344528 ZANQ9Y493 2812 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-201ENST00000344528 COL6A3P12111 3177 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-201ENST00000344528 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP4-201ENST00000344528 DCHS2Q6V1P9 2916 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP4-201ENST00000344528 ADM2Q7Z4H4 148 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-201ENST00000344528 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-201ENST00000344528 PRAC1Q96KF2 57 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-201ENST00000344528 ROMO1P60602 79 aa9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-201ENST00000344528 PLAC4Q8WY50 150 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-201ENST00000344528 SPATA8Q6RVD6 105 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAH14Q0VDD8 3507 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP4-201ENST00000344528 DMXL1Q9Y485 3027 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP4-201ENST00000344528 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-201ENST00000344528 TENM3Q9P273 2699 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-201ENST00000344528 NF1P21359 2839 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-201ENST00000344528 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-201ENST00000344528 A8MUU9 505 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-201ENST00000344528 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-201ENST00000344528 FBN2P35556 2912 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-201ENST00000344528 TENM1Q9UKZ4 2725 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-201ENST00000344528 USP34Q70CQ2 3546 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-201ENST00000344528 MXRA5Q9NR99 2828 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP4-201ENST00000344528 A8MU10 97 aa8.86□□□□□ -0.99
SH3BP4-201ENST00000344528 SPEGQ15772 3267 aa8.86□□□□□ -0.99
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A0A0MQY5 61 aa8.83□□□□□ -1
SH3BP4-201ENST00000344528 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
SH3BP4-201ENST00000344528 LOC400499M0QZD8 3231 aa8.82□□□□□ -1
SH3BP4-201ENST00000344528 TENM2Q9NT68 2774 aa8.81□□□□□ -1
SH3BP4-201ENST00000344528 XP32Q5T750 250 aa8.8□□□□□ -1
SH3BP4-201ENST00000344528 A6NN06 94 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-201ENST00000344528 TPRXLQ17RH7 258 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-201ENST00000344528 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.68□□□□□ -1.02
SH3BP4-201ENST00000344528 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-201ENST00000344528 TNP1P09430 55 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-201ENST00000344528 MYO15AQ9UKN7 3530 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-201ENST00000344528 DCHS1Q96JQ0 3298 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP4-201ENST00000344528 H3BS24 57 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1B0GVY2 172 aa8.54□□□□□ -1.04
SH3BP4-201ENST00000344528 TGP01266 2768 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-201ENST00000344528 PDZD2O15018 2839 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP10-8P60410 259 aa8.48□□□□□ -1.05
SH3BP4-201ENST00000344528 VWFP04275 2813 aa8.46□□□□□ -1.05
SH3BP4-201ENST00000344528 RELNP78509 3460 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-201ENST00000344528 PP632Q6XCG6 107 aa8.4□□□□□ -1.06
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP10-10P60014 251 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-201ENST00000344528 OTOGQ6ZRI0 2925 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-201ENST00000344528 H0YAA0 97 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP4-201ENST00000344528 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
SH3BP4-201ENST00000344528 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-201ENST00000344528 P0C880 135 aa8.27□□□□□ -1.09
SH3BP4-201ENST00000344528 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.26□□□□□ -1.09
SH3BP4-201ENST00000344528 NDUFAF8A1L188 74 aa8.23□□□□□ -1.09
SH3BP4-201ENST00000344528 PRO2289Q9P1D8 64 aa8.23□□□□□ -1.09
SH3BP4-201ENST00000344528 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
SH3BP4-201ENST00000344528 LAMA5O15230 3695 aa8.09□□□□□ -1.11
SH3BP4-201ENST00000344528 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa8.08□□□□□ -1.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ZFHX3Q15911 3703 aa8.05□□□□□ -1.12
SH3BP4-201ENST00000344528 FBN3Q75N90 2809 aa8□□□□□ -1.13
SH3BP4-201ENST00000344528 ASPMQ8IZT6 3477 aa7.97□□□□□ -1.13
SH3BP4-201ENST00000344528 ZFHX4Q86UP3 3567 aa7.94□□□□□ -1.14
SH3BP4-201ENST00000344528 MUC3AQ02505 3323 aa7.92□□□□□ -1.14
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.89□□□□□ -1.15
SH3BP4-201ENST00000344528 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP12-2P59991 146 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-201ENST00000344528 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-201ENST00000344528 COL7A1Q02388 2944 aa7.83□□□□□ -1.16
SH3BP4-201ENST00000344528 MT1HL1P0DM35 61 aa7.8□□□□□ -1.16
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP12-1P59990 96 aa7.79□□□□□ -1.16
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.79□□□□□ -1.16
SH3BP4-201ENST00000344528 DMDP11532 3685 aa7.75□□□□□ -1.17
SH3BP4-201ENST00000344528 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.7□□□□□ -1.18
SH3BP4-201ENST00000344528 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
SH3BP4-201ENST00000344528 CSMD2Q7Z408 3487 aa7.7□□□□□ -1.18
SH3BP4-201ENST00000344528 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.65□□□□□ -1.18
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
SH3BP4-201ENST00000344528 SVEP1Q4LDE5 3571 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-201ENST00000344528 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-201ENST00000344528 CUBNO60494 3623 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.41□□□□□ -1.22
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.39□□□□□ -1.23
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.39□□□□□ -1.23
SH3BP4-201ENST00000344528 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SH3BP4-201ENST00000344528 BSNQ9UPA5 3926 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP10-12P60413 245 aa7.21□□□□□ -1.25
SH3BP4-201ENST00000344528 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.17□□□□□ -1.26
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.09□□□□□ -1.27
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAH9Q9NYC9 4486 aa7.07□□□□□ -1.28
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP23-1A1A580 65 aa7□□□□□ -1.29
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP12-3P60328 96 aa7□□□□□ -1.29
SH3BP4-201ENST00000344528 VPS13CQ709C8 3753 aa6.99□□□□□ -1.29
SH3BP4-201ENST00000344528 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.6 ms