RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 M0QZ58 72 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP4-201ENST00000344528 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-201ENST00000344528 ZANQ9Y493 2812 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-201ENST00000344528 COL6A3P12111 3177 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP4-201ENST00000344528 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP4-201ENST00000344528 DCHS2Q6V1P9 2916 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP4-201ENST00000344528 ADM2Q7Z4H4 148 aa9.22□□□□□ -0.93
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SH3BP4-201ENST00000344528 VWFP04275 2813 aa8.46□□□□□ -1.05
SH3BP4-201ENST00000344528 RELNP78509 3460 aa8.42□□□□□ -1.06
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SH3BP4-201ENST00000344528 H0YAA0 97 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP4-201ENST00000344528 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
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SH3BP4-201ENST00000344528 ZFHX3Q15911 3703 aa8.05□□□□□ -1.12
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SH3BP4-201ENST00000344528 ASPMQ8IZT6 3477 aa7.97□□□□□ -1.13
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SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.89□□□□□ -1.15
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SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP12-2P59991 146 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-201ENST00000344528 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-201ENST00000344528 COL7A1Q02388 2944 aa7.83□□□□□ -1.16
SH3BP4-201ENST00000344528 MT1HL1P0DM35 61 aa7.8□□□□□ -1.16
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP12-1P59990 96 aa7.79□□□□□ -1.16
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.79□□□□□ -1.16
SH3BP4-201ENST00000344528 DMDP11532 3685 aa7.75□□□□□ -1.17
SH3BP4-201ENST00000344528 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.7□□□□□ -1.18
SH3BP4-201ENST00000344528 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
SH3BP4-201ENST00000344528 CSMD2Q7Z408 3487 aa7.7□□□□□ -1.18
SH3BP4-201ENST00000344528 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.65□□□□□ -1.18
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SH3BP4-201ENST00000344528 SVEP1Q4LDE5 3571 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.51□□□□□ -1.21
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SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.39□□□□□ -1.23
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.39□□□□□ -1.23
SH3BP4-201ENST00000344528 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SH3BP4-201ENST00000344528 BSNQ9UPA5 3926 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP10-12P60413 245 aa7.21□□□□□ -1.25
SH3BP4-201ENST00000344528 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.17□□□□□ -1.26
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.09□□□□□ -1.27
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAH9Q9NYC9 4486 aa7.07□□□□□ -1.28
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP23-1A1A580 65 aa7□□□□□ -1.29
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP12-3P60328 96 aa7□□□□□ -1.29
SH3BP4-201ENST00000344528 VPS13CQ709C8 3753 aa6.99□□□□□ -1.29
SH3BP4-201ENST00000344528 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
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