RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264658.10

FBXL20-201, Transcript of F-box and leucine rich repeat protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FBXL20, Length 10,388 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.22□□□□□ -1.57
FBXL20-201ENST00000264658 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.22□□□□□ -1.57
FBXL20-201ENST00000264658 NBEAQ8NFP9 2946 aa5.22□□□□□ -1.57
FBXL20-201ENST00000264658 LAMA1P25391 3075 aa5.21□□□□□ -1.58
FBXL20-201ENST00000264658 ATMQ13315 3056 aa5.2□□□□□ -1.58
FBXL20-201ENST00000264658 SZT2Q5T011 3432 aa5.19□□□□□ -1.58
FBXL20-201ENST00000264658 COL6A3P12111 3177 aa5.19□□□□□ -1.58
FBXL20-201ENST00000264658 NDUFAF8A1L188 74 aa5.18□□□□□ -1.58
FBXL20-201ENST00000264658 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa5.18□□□□□ -1.58
FBXL20-201ENST00000264658 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
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FBXL20-201ENST00000264658 CELSR2Q9HCU4 2923 aa5.16□□□□□ -1.58
FBXL20-201ENST00000264658 REV3LO60673 3130 aa5.14□□□□□ -1.59
FBXL20-201ENST00000264658 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
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FBXL20-201ENST00000264658 COL12A1Q99715 3063 aa5.1□□□□□ -1.59
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FBXL20-201ENST00000264658 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
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FBXL20-201ENST00000264658 EYSQ5T1H1 3165 aa4.99□□□□□ -1.61
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FBXL20-201ENST00000264658 TENM2Q9NT68 2774 aa4.98□□□□□ -1.61
FBXL20-201ENST00000264658 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP4.97□□□□□ -1.61
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FBXL20-201ENST00000264658 TENM3Q9P273 2699 aa4.89□□□□□ -1.63
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FBXL20-201ENST00000264658 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa4.83□□□□□ -1.64
FBXL20-201ENST00000264658 TPRXLQ17RH7 258 aa4.82□□□□□ -1.64
FBXL20-201ENST00000264658 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa4.81□□□□□ -1.64
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FBXL20-201ENST00000264658 MYO15AQ9UKN7 3530 aa4.79□□□□□ -1.64
FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP12-2P59991 146 aa4.78□□□□□ -1.64
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FBXL20-201ENST00000264658 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa4.73□□□□□ -1.65
FBXL20-201ENST00000264658 PP632Q6XCG6 107 aa4.73□□□□□ -1.65
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FBXL20-201ENST00000264658 PDZD2O15018 2839 aa4.63□□□□□ -1.67
FBXL20-201ENST00000264658 CSMD1Q96PZ7 3565 aa4.63□□□□□ -1.67
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FBXL20-201ENST00000264658 LAMA5O15230 3695 aa4.59□□□□□ -1.67
FBXL20-201ENST00000264658 ZFHX4Q86UP3 3567 aa4.59□□□□□ -1.68
FBXL20-201ENST00000264658 DMDP11532 3685 aa4.58□□□□□ -1.68
FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.57□□□□□ -1.68
FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP12-1P59990 96 aa4.56□□□□□ -1.68
FBXL20-201ENST00000264658 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.55□□□□□ -1.68
FBXL20-201ENST00000264658 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
FBXL20-201ENST00000264658 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.54□□□□□ -1.68
FBXL20-201ENST00000264658 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.69
FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.51□□□□□ -1.69
FBXL20-201ENST00000264658 ZFHX3Q15911 3703 aa4.5□□□□□ -1.69
FBXL20-201ENST00000264658 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa4.48□□□□□ -1.69
FBXL20-201ENST00000264658 FBN3Q75N90 2809 aa4.47□□□□□ -1.69
FBXL20-201ENST00000264658 OTOGQ6ZRI0 2925 aa4.42□□□□□ -1.7
FBXL20-201ENST00000264658 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa4.39□□□□□ -1.71
FBXL20-201ENST00000264658 SVEP1Q4LDE5 3571 aa4.39□□□□□ -1.71
FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
FBXL20-201ENST00000264658 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa4.37□□□□□ -1.71
FBXL20-201ENST00000264658 VPS13CQ709C8 3753 aa4.35□□□□□ -1.71
FBXL20-201ENST00000264658 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
FBXL20-201ENST00000264658 COL7A1Q02388 2944 aa4.34□□□□□ -1.71
FBXL20-201ENST00000264658 MT1HL1P0DM35 61 aa4.34□□□□□ -1.71
FBXL20-201ENST00000264658 CSMD2Q7Z408 3487 aa4.31□□□□□ -1.72
FBXL20-201ENST00000264658 CUBNO60494 3623 aa4.26□□□□□ -1.73
FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP10-12P60413 245 aa4.25□□□□□ -1.73
FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa4.25□□□□□ -1.73
FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa4.24□□□□□ -1.73
FBXL20-201ENST00000264658 ALMS1Q8TCU4 4167 aa4.23□□□□□ -1.73
FBXL20-201ENST00000264658 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
FBXL20-201ENST00000264658 LCE3AQ5TA76 89 aa4.17□□□□□ -1.74
FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
FBXL20-201ENST00000264658 CSMD3Q7Z407 3707 aa4.15□□□□□ -1.74
FBXL20-201ENST00000264658 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
FBXL20-201ENST00000264658 MUC3AQ02505 3323 aa4.11□□□□□ -1.75
FBXL20-201ENST00000264658 AKAP9Q99996 3911 aa4.1□□□□□ -1.75
FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP12-3P60328 96 aa4.1□□□□□ -1.75
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