RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253332.5

AKAP12-201, Transcript of A-kinase anchoring protein 12, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene AKAP12, Length 6,597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP12-201ENST00000253332 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.32□□□□□ -1.08
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AKAP12-201ENST00000253332 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
AKAP12-201ENST00000253332 IGSF10Q6WRI0 2623 aa8.26□□□□□ -1.09
AKAP12-201ENST00000253332 KALRNO60229 2985 aa8.25□□□□□ -1.09
AKAP12-201ENST00000253332 TACC2O95359 2948 aa8.25□□□□□ -1.09
AKAP12-201ENST00000253332 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
AKAP12-201ENST00000253332 TRANK1O15050 2925 aa8.22□□□□□ -1.09
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AKAP12-201ENST00000253332 P0C880 135 aa8.19□□□□□ -1.1
AKAP12-201ENST00000253332 PRO2289Q9P1D8 64 aa8.16□□□□□ -1.1
AKAP12-201ENST00000253332 LRBAP50851 2863 aa8.16□□□□□ -1.1
AKAP12-201ENST00000253332 HIVEP1P15822 2718 aa8.15□□□□□ -1.1
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AKAP12-201ENST00000253332 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.11□□□□□ -1.11
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AKAP12-201ENST00000253332 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa8.11□□□□□ -1.11
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AKAP12-201ENST00000253332 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.49□□□□□ -1.21
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AKAP12-201ENST00000253332 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP7.37□□□□□ -1.23
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AKAP12-201ENST00000253332 ZANQ9Y493 2812 aa7.35□□□□□ -1.23
AKAP12-201ENST00000253332 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.34□□□□□ -1.23
AKAP12-201ENST00000253332 ZFHX3Q15911 3703 aa7.31□□□□□ -1.24
AKAP12-201ENST00000253332 KRTAP12-1P59990 96 aa7.29□□□□□ -1.24
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AKAP12-201ENST00000253332 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.22□□□□□ -1.25
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AKAP12-201ENST00000253332 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.78□□□□□ -1.32
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AKAP12-201ENST00000253332 FBN3Q75N90 2809 aa6.76□□□□□ -1.33
AKAP12-201ENST00000253332 KRTAP10-5P60370 271 aa6.76□□□□□ -1.33
AKAP12-201ENST00000253332 LCE3AQ5TA76 89 aa6.75□□□□□ -1.33
AKAP12-201ENST00000253332 KRTAP12-3P60328 96 aa6.74□□□□□ -1.33
AKAP12-201ENST00000253332 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
AKAP12-201ENST00000253332 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.7□□□□□ -1.34
AKAP12-201ENST00000253332 COL7A1Q02388 2944 aa6.7□□□□□ -1.34
AKAP12-201ENST00000253332 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.63□□□□□ -1.35
AKAP12-201ENST00000253332 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.62□□□□□ -1.35
AKAP12-201ENST00000253332 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.62□□□□□ -1.35
AKAP12-201ENST00000253332 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.57□□□□□ -1.36
AKAP12-201ENST00000253332 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.56□□□□□ -1.36
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