RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545170.5

ATXN3-216, Transcript of ataxin 3, humanhuman

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Gene ATXN3, Length 6,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-216ENST00000545170 F8P00451 2351 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-216ENST00000545170 ACANP16112 2415 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-216ENST00000545170 NOTCH2Q04721 2471 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-216ENST00000545170 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
ATXN3-216ENST00000545170 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
ATXN3-216ENST00000545170 ABCA12Q86UK0 2595 aa4.89□□□□□ -1.63
ATXN3-216ENST00000545170 TLN2Q9Y4G6 2542 aa4.89□□□□□ -1.63
ATXN3-216ENST00000545170 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
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ATXN3-216ENST00000545170 PKD1L2Q7Z442 2459 aa4.88□□□□□ -1.63
ATXN3-216ENST00000545170 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
ATXN3-216ENST00000545170 CHD7Q9P2D1 2997 aa4.87□□□□□ -1.63
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ATXN3-216ENST00000545170 P0C880 135 aa4.85□□□□□ -1.63
ATXN3-216ENST00000545170 SZT2Q5T011 3432 aa4.85□□□□□ -1.63
ATXN3-216ENST00000545170 IGF2RP11717 2491 aa4.85□□□□□ -1.63
ATXN3-216ENST00000545170 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
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ATXN3-216ENST00000545170 H0YAA0 97 aa4.82□□□□□ -1.64
ATXN3-216ENST00000545170 CHD8Q9HCK8 2581 aa4.81□□□□□ -1.64
ATXN3-216ENST00000545170 PP632Q6XCG6 107 aa4.8□□□□□ -1.64
ATXN3-216ENST00000545170 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa4.79□□□□□ -1.64
ATXN3-216ENST00000545170 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
ATXN3-216ENST00000545170 KRTAP1-1Q07627 177 aa4.79□□□□□ -1.64
ATXN3-216ENST00000545170 COL6A3P12111 3177 aa4.78□□□□□ -1.64
ATXN3-216ENST00000545170 REV3LO60673 3130 aa4.78□□□□□ -1.64
ATXN3-216ENST00000545170 KRTAP10-1P60331 282 aa4.78□□□□□ -1.64
ATXN3-216ENST00000545170 JMJD1CQ15652 2540 aa4.77□□□□□ -1.65
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ATXN3-216ENST00000545170 NCOR2Q9Y618 2525 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-216ENST00000545170 KRTAP10-8P60410 259 aa4.77□□□□□ -1.65
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ATXN3-216ENST00000545170 ZNF292O60281 2723 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-216ENST00000545170 KRTAP10-2P60368 255 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-216ENST00000545170 PIEZO1Q92508 2521 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-216ENST00000545170 Q5VSD8 79 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-216ENST00000545170 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.73□□□□□ -1.65
ATXN3-216ENST00000545170 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa4.73□□□□□ -1.65
ATXN3-216ENST00000545170 UNC80Q8N2C7 3258 aa4.72□□□□□ -1.65
ATXN3-216ENST00000545170 DNAH12Q6ZR08 3092 aa4.71□□□□□ -1.65
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ATXN3-216ENST00000545170 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.66□□□□□ -1.66
ATXN3-216ENST00000545170 CDH23Q9H251 3354 aa4.66□□□□□ -1.66
ATXN3-216ENST00000545170 MUC3AQ02505 3323 aa4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-216ENST00000545170 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-216ENST00000545170 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
ATXN3-216ENST00000545170 POLQO75417 2590 aa4.63□□□□□ -1.67
ATXN3-216ENST00000545170 XIRP2A4UGR9 3374 aa4.63□□□□□ -1.67
ATXN3-216ENST00000545170 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
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ATXN3-216ENST00000545170 VCANP13611 3396 aa4.51□□□□□ -1.69
ATXN3-216ENST00000545170 CEP295Q9C0D2 2601 aa4.51□□□□□ -1.69
ATXN3-216ENST00000545170 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
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ATXN3-216ENST00000545170 ZFHX4Q86UP3 3567 aa4.48□□□□□ -1.69
ATXN3-216ENST00000545170 KRTAP12-2P59991 146 aa4.48□□□□□ -1.69
ATXN3-216ENST00000545170 A0A0C4DFX4 3053 aa4.47□□□□□ -1.69
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ATXN3-216ENST00000545170 EPG5Q9HCE0 2579 aa4.45□□□□□ -1.7
ATXN3-216ENST00000545170 DCHS1Q96JQ0 3298 aa4.45□□□□□ -1.7
ATXN3-216ENST00000545170 DMXL1Q9Y485 3027 aa4.44□□□□□ -1.7
ATXN3-216ENST00000545170 TRIOO75962 3097 aa4.44□□□□□ -1.7
ATXN3-216ENST00000545170 FASNP49327 2511 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
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ATXN3-216ENST00000545170 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa4.44□□□□□ -1.7
ATXN3-216ENST00000545170 DMDP11532 3685 aa4.44□□□□□ -1.7
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ATXN3-216ENST00000545170 CFAP46Q8IYW2 2715 aa4.39□□□□□ -1.71
ATXN3-216ENST00000545170 C5orf42Q9H799 3197 aa4.38□□□□□ -1.71
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ATXN3-216ENST00000545170 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.37□□□□□ -1.71
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ATXN3-216ENST00000545170 INE1O15225 51 aa4.37□□□□□ -1.71
ATXN3-216ENST00000545170 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
ATXN3-216ENST00000545170 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.36□□□□□ -1.71
ATXN3-216ENST00000545170 WDFY4Q6ZS81 3184 aa4.35□□□□□ -1.71
ATXN3-216ENST00000545170 BAHCC1Q9P281 2608 aa4.35□□□□□ -1.71
ATXN3-216ENST00000545170 SPEGQ15772 3267 aa4.34□□□□□ -1.71
ATXN3-216ENST00000545170 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.33□□□□□ -1.72
ATXN3-216ENST00000545170 ZZEF1O43149 2961 aa4.33□□□□□ -1.72
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