RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485529.5

PRRX1-204, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 2

Gene PRRX1, Length 329 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-204ENST00000485529 MYO5CQ9NQX4 1742 aa0□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 SCN11AQ9UI33 1791 aa0□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 CACNA1HO95180 2353 aa-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 MYH4Q9Y623 1939 aa-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 NESP48681 1621 aa-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 TIAM1Q13009 1591 aa-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 AGLP35573 1532 aa-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 A0A096LNI7 61 aa-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 RPL39P62891 51 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 LINC01590Q5TEZ4 76 aa-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 URB1O60287 2271 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 OTOGQ6ZRI0 2925 aa-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 PPLO60437 1756 aa-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 LTN1O94822 1766 aa-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 NRAPQ86VF7 1730 aa-0.01□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 PLCH1Q4KWH8 1693 aa-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 NHSQ6T4R5 1651 aa-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 FAT4Q6V0I7 4981 aa-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 ABCA2Q9BZC7 2435 aa-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 C2CD3Q4AC94 2353 aa-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 PLCE1Q9P212 2302 aa-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 FANCD2Q9BXW9 1451 aa-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 SSPOA2VEC9 5147 aa-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 HTN1P15515 57 aa-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 DEFB136Q30KP8 78 aa-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 PCNX1Q96RV3 2341 aa-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 C4AP0C0L4 1744 aa-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 C4BP0C0L5 1744 aa-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 QSER1Q2KHR3 1735 aa-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 FRAS1Q86XX4 4008 aa-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 UBR1Q8IWV7 1749 aa-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 KIF1AQ12756 1690 aa-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 CFAP43Q8NDM7 1665 aa-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 MAST1Q9Y2H9 1570 aa-0.02□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 PTPN13Q12923 2485 aa-0.03□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 ANKRD36A6QL64 1941 aa-0.03□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 TJP1Q07157 1748 aa-0.03□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 TIAM2Q8IVF5 1701 aa-0.03□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa-0.03□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 DEFB4AO15263 64 aa-0.03□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 MT4P47944 62 aa-0.03□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 MT1HP80294 61 aa-0.03□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 HMCN2Q8NDA2 5059 aa-0.03□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 ADCY10Q96PN6 1610 aa-0.03□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa-0.03□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 ABCC8Q09428 1581 aa-0.03□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP-0.03□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 TRPM2O94759 1503 aa-0.03□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 BDP1A6H8Y1 2624 aa-0.03□□□□□ -2.41
PRRX1-204ENST00000485529 CELSR2Q9HCU4 2923 aa-0.03□□□□□ -2.42
PRRX1-204ENST00000485529 APCP25054 2843 aa-0.04□□□□□ -2.42
PRRX1-204ENST00000485529 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
PRRX1-204ENST00000485529 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa-0.04□□□□□ -2.42
PRRX1-204ENST00000485529 F8P00451 2351 aa-0.04□□□□□ -2.42
PRRX1-204ENST00000485529 CROCC2H7BZ55 1655 aa-0.04□□□□□ -2.42
PRRX1-204ENST00000485529 CD52P31358 61 aa-0.04□□□□□ -2.42
PRRX1-204ENST00000485529 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
PRRX1-204ENST00000485529 DEFB133Q30KQ1 61 aa-0.04□□□□□ -2.42
PRRX1-204ENST00000485529 PIEZO1Q92508 2521 aa-0.04□□□□□ -2.42
PRRX1-204ENST00000485529 NCOR2Q9Y618 2525 aa-0.04□□□□□ -2.42
PRRX1-204ENST00000485529 HSPG2P98160 4391 aa-0.04□□□□□ -2.42
PRRX1-204ENST00000485529 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa-0.04□□□□□ -2.42
PRRX1-204ENST00000485529 CSPG4Q6UVK1 2322 aa-0.04□□□□□ -2.42
PRRX1-204ENST00000485529 ITSN1Q15811 1721 aa-0.04□□□□□ -2.42
PRRX1-204ENST00000485529 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
PRRX1-204ENST00000485529 PREX2Q70Z35 1606 aa-0.05□□□□□ -2.42
PRRX1-204ENST00000485529 ZFHX3Q15911 3703 aa-0.05□□□□□ -2.42
PRRX1-204ENST00000485529 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
PRRX1-204ENST00000485529 MT1EP04732 61 aa-0.05□□□□□ -2.42
PRRX1-204ENST00000485529 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa-0.05□□□□□ -2.42
PRRX1-204ENST00000485529 TTTY10Q9BZA0 68 aa-0.05□□□□□ -2.42
PRRX1-204ENST00000485529 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa-0.05□□□□□ -2.42
PRRX1-204ENST00000485529 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
PRRX1-204ENST00000485529 SONP18583 2426 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
PRRX1-204ENST00000485529 C3P01024 1663 aa-0.05□□□□□ -2.42
PRRX1-204ENST00000485529 LMO7Q8WWI1 1683 aa-0.05□□□□□ -2.42
PRRX1-204ENST00000485529 ALS2Q96Q42 1657 aa-0.05□□□□□ -2.42
PRRX1-204ENST00000485529 ITSN2Q9NZM3 1697 aa-0.05□□□□□ -2.42
PRRX1-204ENST00000485529 UNC79Q9P2D8 2635 aa-0.05□□□□□ -2.42
PRRX1-204ENST00000485529 TNXBP22105 4242 aa-0.05□□□□□ -2.42
PRRX1-204ENST00000485529 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
PRRX1-204ENST00000485529 CACNA1AO00555 2505 aa-0.06□□□□□ -2.42
PRRX1-204ENST00000485529 MUC2Q02817 5179 aa-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68 ms