RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395789.5

C6orf48-209, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene C6orf48, Length 952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-209ENST00000395789 SLC25A20O43772 301 aa7.55□□□□□ -1.2
C6orf48-209ENST00000395789 Q6ZQY7 126 aa7.55□□□□□ -1.2
C6orf48-209ENST00000395789 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.54□□□□□ -1.2
C6orf48-209ENST00000395789 A6NJY4 79 aa7.54□□□□□ -1.2
C6orf48-209ENST00000395789 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.54□□□□□ -1.2
C6orf48-209ENST00000395789 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.52□□□□□ -1.21
C6orf48-209ENST00000395789 K7ERJ3 54 aa7.52□□□□□ -1.21
C6orf48-209ENST00000395789 SMIM6P0DI80 62 aa7.52□□□□□ -1.21
C6orf48-209ENST00000395789 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
C6orf48-209ENST00000395789 PRO1933Q9H354 126 aa7.52□□□□□ -1.21
C6orf48-209ENST00000395789 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.51□□□□□ -1.21
C6orf48-209ENST00000395789 A0A0G2JQZ4 141 aa7.51□□□□□ -1.21
C6orf48-209ENST00000395789 H0YGX0 51 aa7.5□□□□□ -1.21
C6orf48-209ENST00000395789 TRIAP1O43715 76 aa7.49□□□□□ -1.21
C6orf48-209ENST00000395789 CD164Q04900 197 aa7.49□□□□□ -1.21
C6orf48-209ENST00000395789 TPRXLQ17RH7 258 aa7.49□□□□□ -1.21
C6orf48-209ENST00000395789 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
C6orf48-209ENST00000395789 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.49□□□□□ -1.21
C6orf48-209ENST00000395789 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.48□□□□□ -1.21
C6orf48-209ENST00000395789 XP32Q5T750 250 aa7.48□□□□□ -1.21
C6orf48-209ENST00000395789 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.47□□□□□ -1.21
C6orf48-209ENST00000395789 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.46□□□□□ -1.22
C6orf48-209ENST00000395789 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.45□□□□□ -1.22
C6orf48-209ENST00000395789 A0A1B0GX51 115 aa7.44□□□□□ -1.22
C6orf48-209ENST00000395789 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.44□□□□□ -1.22
C6orf48-209ENST00000395789 Q5XG85 94 aa7.44□□□□□ -1.22
C6orf48-209ENST00000395789 CLEC2BQ92478 149 aa7.44□□□□□ -1.22
C6orf48-209ENST00000395789 F8WEM9 126 aa7.42□□□□□ -1.22
C6orf48-209ENST00000395789 IGFL1Q6UW32 110 aa7.42□□□□□ -1.22
C6orf48-209ENST00000395789 LIMD2Q9BT23 127 aa7.42□□□□□ -1.22
C6orf48-209ENST00000395789 RNF213Q63HN8 5207 aa7.42□□□□□ -1.22
C6orf48-209ENST00000395789 H3BUT2 72 aa7.4□□□□□ -1.22
C6orf48-209ENST00000395789 SNCGO76070 127 aa7.4□□□□□ -1.22
C6orf48-209ENST00000395789 PSMB2P49721 201 aa7.4□□□□□ -1.22
C6orf48-209ENST00000395789 Q6JHZ5 121 aa7.4□□□□□ -1.22
C6orf48-209ENST00000395789 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.4□□□□□ -1.22
C6orf48-209ENST00000395789 CDIP1Q9H305 208 aa7.39□□□□□ -1.23
C6orf48-209ENST00000395789 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
C6orf48-209ENST00000395789 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
C6orf48-209ENST00000395789 C1orf195Q5TG92 126 aa7.38□□□□□ -1.23
C6orf48-209ENST00000395789 M0R143 59 aa7.37□□□□□ -1.23
C6orf48-209ENST00000395789 COX6CP09669 75 aa7.37□□□□□ -1.23
C6orf48-209ENST00000395789 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.36□□□□□ -1.23
C6orf48-209ENST00000395789 TSTD3H0UI37 97 aa7.36□□□□□ -1.23
C6orf48-209ENST00000395789 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.36□□□□□ -1.23
C6orf48-209ENST00000395789 MUC17Q685J3 4493 aa7.36□□□□□ -1.23
C6orf48-209ENST00000395789 LST1O00453 97 aa7.34□□□□□ -1.23
C6orf48-209ENST00000395789 TRACP01848 142 aa7.34□□□□□ -1.23
C6orf48-209ENST00000395789 GHRHP01286 108 aa7.33□□□□□ -1.24
C6orf48-209ENST00000395789 FABP2P12104 132 aa7.33□□□□□ -1.24
C6orf48-209ENST00000395789 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.33□□□□□ -1.24
C6orf48-209ENST00000395789 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.33□□□□□ -1.24
C6orf48-209ENST00000395789 MUC2Q02817 5179 aa7.33□□□□□ -1.24
C6orf48-209ENST00000395789 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.32□□□□□ -1.24
C6orf48-209ENST00000395789 H3BMG7 143 aa7.32□□□□□ -1.24
C6orf48-209ENST00000395789 Q6Q795 121 aa7.32□□□□□ -1.24
C6orf48-209ENST00000395789 TCL1BO95988 128 aa7.31□□□□□ -1.24
C6orf48-209ENST00000395789 DNAL4O96015 105 aa7.31□□□□□ -1.24
C6orf48-209ENST00000395789 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.31□□□□□ -1.24
C6orf48-209ENST00000395789 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
C6orf48-209ENST00000395789 H3BQ85 93 aa7.29□□□□□ -1.24
C6orf48-209ENST00000395789 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.29□□□□□ -1.24
C6orf48-209ENST00000395789 TEN1Q86WV5 123 aa7.29□□□□□ -1.24
C6orf48-209ENST00000395789 A0A1W2PNM2 257 aa7.28□□□□□ -1.24
C6orf48-209ENST00000395789 UBE2V1Q13404 147 aa7.28□□□□□ -1.24
C6orf48-209ENST00000395789 C9orf92A6NGG3 77 aa7.26□□□□□ -1.25
C6orf48-209ENST00000395789 BATFQ16520 125 aa7.26□□□□□ -1.25
C6orf48-209ENST00000395789 A0A1B0GV72 72 aa7.24□□□□□ -1.25
C6orf48-209ENST00000395789 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.24□□□□□ -1.25
C6orf48-209ENST00000395789 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.24□□□□□ -1.25
C6orf48-209ENST00000395789 A0A087WSZ3 146 aa7.23□□□□□ -1.25
C6orf48-209ENST00000395789 TAX1BP3O14907 124 aa7.23□□□□□ -1.25
C6orf48-209ENST00000395789 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.23□□□□□ -1.25
C6orf48-209ENST00000395789 Q96NJ1 140 aa7.23□□□□□ -1.25
C6orf48-209ENST00000395789 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.22□□□□□ -1.25
C6orf48-209ENST00000395789 ATXN8Q156A1 80 aa7.22□□□□□ -1.25
C6orf48-209ENST00000395789 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.21□□□□□ -1.26
C6orf48-209ENST00000395789 C9orf118A6NHY6 69 aa7.2□□□□□ -1.26
C6orf48-209ENST00000395789 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
C6orf48-209ENST00000395789 CCKP06307 115 aa7.18□□□□□ -1.26
C6orf48-209ENST00000395789 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
C6orf48-209ENST00000395789 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.17□□□□□ -1.26
C6orf48-209ENST00000395789 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.17□□□□□ -1.26
C6orf48-209ENST00000395789 A0A1W2PPM0 123 aa7.16□□□□□ -1.26
C6orf48-209ENST00000395789 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.16□□□□□ -1.26
C6orf48-209ENST00000395789 C9JAW5 83 aa7.14□□□□□ -1.27
C6orf48-209ENST00000395789 PCOTHQ58A44 107 aa7.14□□□□□ -1.27
C6orf48-209ENST00000395789 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.14□□□□□ -1.27
C6orf48-209ENST00000395789 RPL37P61927 97 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
C6orf48-209ENST00000395789 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.13□□□□□ -1.27
C6orf48-209ENST00000395789 DSCR8Q96T75 97 aa7.13□□□□□ -1.27
C6orf48-209ENST00000395789 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.11□□□□□ -1.27
C6orf48-209ENST00000395789 Q6ZQT0 140 aa7.11□□□□□ -1.27
C6orf48-209ENST00000395789 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.1□□□□□ -1.27
C6orf48-209ENST00000395789 VPS25Q9BRG1 176 aa7.09□□□□□ -1.27
C6orf48-209ENST00000395789 DEFB116Q30KQ4 102 aa7.08□□□□□ -1.28
C6orf48-209ENST00000395789 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.08□□□□□ -1.28
C6orf48-209ENST00000395789 MTURNQ8N3F0 131 aa7.08□□□□□ -1.28
C6orf48-209ENST00000395789 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.08□□□□□ -1.28
C6orf48-209ENST00000395789 A0A0U1RQV1 116 aa7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.4 ms