RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299687.9

ZNF407-201, Transcript of zinc finger protein 407, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF407, Length 7,948 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407-201ENST00000299687 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa7.75□□□□□ -1.17
ZNF407-201ENST00000299687 TNP2Q05952 138 aa7.74□□□□□ -1.17
ZNF407-201ENST00000299687 ITPR3Q14573 2671 aa7.72□□□□□ -1.17
ZNF407-201ENST00000299687 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.17
ZNF407-201ENST00000299687 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.17
ZNF407-201ENST00000299687 KRTAP10-3P60369 221 aa7.71□□□□□ -1.18
ZNF407-201ENST00000299687 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
ZNF407-201ENST00000299687 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
ZNF407-201ENST00000299687 OCR1Q9BZK8 76 aa7.7□□□□□ -1.18
ZNF407-201ENST00000299687 CHD6Q8TD26 2715 aa7.69□□□□□ -1.18
ZNF407-201ENST00000299687 TEX15Q9BXT5 2789 aa7.69□□□□□ -1.18
ZNF407-201ENST00000299687 LAMA3Q16787 3333 aa7.68□□□□□ -1.18
ZNF407-201ENST00000299687 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
ZNF407-201ENST00000299687 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
ZNF407-201ENST00000299687 PRAC1Q96KF2 57 aa7.65□□□□□ -1.18
ZNF407-201ENST00000299687 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.64□□□□□ -1.19
ZNF407-201ENST00000299687 ROMO1P60602 79 aa7.63□□□□□ -1.19
ZNF407-201ENST00000299687 A0A0C4DFX4 3053 aa7.63□□□□□ -1.19
ZNF407-201ENST00000299687 STAB2Q8WWQ8 2551 aa7.63□□□□□ -1.19
ZNF407-201ENST00000299687 RPL37P61927 97 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
ZNF407-201ENST00000299687 M0QZ58 72 aa7.6□□□□□ -1.19
ZNF407-201ENST00000299687 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF407-201ENST00000299687 SZT2Q5T011 3432 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF407-201ENST00000299687 Q5VSD8 79 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF407-201ENST00000299687 COL6A5A8TX70 2615 aa7.57□□□□□ -1.2
ZNF407-201ENST00000299687 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.57□□□□□ -1.2
ZNF407-201ENST00000299687 A0A096LNT2 108 aa7.56□□□□□ -1.2
ZNF407-201ENST00000299687 OXTP01178 125 aa7.56□□□□□ -1.2
ZNF407-201ENST00000299687 UNC79Q9P2D8 2635 aa7.55□□□□□ -1.2
ZNF407-201ENST00000299687 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ZNF407-201ENST00000299687 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
ZNF407-201ENST00000299687 USP34Q70CQ2 3546 aa7.53□□□□□ -1.2
ZNF407-201ENST00000299687 Q5W150 140 aa7.53□□□□□ -1.2
ZNF407-201ENST00000299687 TRIOO75962 3097 aa7.52□□□□□ -1.2
ZNF407-201ENST00000299687 FREM2Q5SZK8 3169 aa7.5□□□□□ -1.21
ZNF407-201ENST00000299687 VPS13AQ96RL7 3174 aa7.5□□□□□ -1.21
ZNF407-201ENST00000299687 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.5□□□□□ -1.21
ZNF407-201ENST00000299687 BAHCC1Q9P281 2608 aa7.5□□□□□ -1.21
ZNF407-201ENST00000299687 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.49□□□□□ -1.21
ZNF407-201ENST00000299687 UNC80Q8N2C7 3258 aa7.49□□□□□ -1.21
ZNF407-201ENST00000299687 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
ZNF407-201ENST00000299687 Q5VV11 94 aa7.48□□□□□ -1.21
ZNF407-201ENST00000299687 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.47□□□□□ -1.21
ZNF407-201ENST00000299687 VCANP13611 3396 aa7.46□□□□□ -1.21
ZNF407-201ENST00000299687 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
ZNF407-201ENST00000299687 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.45□□□□□ -1.22
ZNF407-201ENST00000299687 NOTCH1P46531 2555 aa7.42□□□□□ -1.22
ZNF407-201ENST00000299687 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.42□□□□□ -1.22
ZNF407-201ENST00000299687 ITPR2Q14571 2701 aa7.42□□□□□ -1.22
ZNF407-201ENST00000299687 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa7.41□□□□□ -1.22
ZNF407-201ENST00000299687 WDFY4Q6ZS81 3184 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF407-201ENST00000299687 SPEGQ15772 3267 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF407-201ENST00000299687 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
ZNF407-201ENST00000299687 LCE6AA0A183 80 aa7.38□□□□□ -1.23
ZNF407-201ENST00000299687 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
ZNF407-201ENST00000299687 Q8NDZ9 215 aa7.38□□□□□ -1.23
ZNF407-201ENST00000299687 MGAQ8IWI9 3026 aa7.38□□□□□ -1.23
ZNF407-201ENST00000299687 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
ZNF407-201ENST00000299687 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.37□□□□□ -1.23
ZNF407-201ENST00000299687 Q5XG85 94 aa7.37□□□□□ -1.23
ZNF407-201ENST00000299687 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.36□□□□□ -1.23
ZNF407-201ENST00000299687 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.35□□□□□ -1.23
ZNF407-201ENST00000299687 FRYQ5TBA9 3013 aa7.35□□□□□ -1.23
ZNF407-201ENST00000299687 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
ZNF407-201ENST00000299687 SPRR1AP35321 89 aa7.32□□□□□ -1.24
ZNF407-201ENST00000299687 MYO15AQ9UKN7 3530 aa7.32□□□□□ -1.24
ZNF407-201ENST00000299687 APCP25054 2843 aa7.31□□□□□ -1.24
ZNF407-201ENST00000299687 SPRR1BP22528 89 aa7.3□□□□□ -1.24
ZNF407-201ENST00000299687 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa7.28□□□□□ -1.24
ZNF407-201ENST00000299687 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.28□□□□□ -1.24
ZNF407-201ENST00000299687 PANO1I0J062 215 aa7.27□□□□□ -1.25
ZNF407-201ENST00000299687 KRTAP10-1P60331 282 aa7.26□□□□□ -1.25
ZNF407-201ENST00000299687 TRANK1O15050 2925 aa7.26□□□□□ -1.25
ZNF407-201ENST00000299687 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
ZNF407-201ENST00000299687 COL6A3P12111 3177 aa7.24□□□□□ -1.25
ZNF407-201ENST00000299687 DSPP15924 2871 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
ZNF407-201ENST00000299687 Q6ZR54 194 aa7.23□□□□□ -1.25
ZNF407-201ENST00000299687 CHD7Q9P2D1 2997 aa7.23□□□□□ -1.25
ZNF407-201ENST00000299687 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.23□□□□□ -1.25
ZNF407-201ENST00000299687 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.23□□□□□ -1.25
ZNF407-201ENST00000299687 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
ZNF407-201ENST00000299687 A8MUU9 505 aa7.22□□□□□ -1.25
ZNF407-201ENST00000299687 ZNF292O60281 2723 aa7.22□□□□□ -1.25
ZNF407-201ENST00000299687 ASPMQ8IZT6 3477 aa7.21□□□□□ -1.25
ZNF407-201ENST00000299687 FRYLO94915 3013 aa7.21□□□□□ -1.25
ZNF407-201ENST00000299687 HTTP42858 3142 aa7.21□□□□□ -1.26
ZNF407-201ENST00000299687 LAMA1P25391 3075 aa7.2□□□□□ -1.26
ZNF407-201ENST00000299687 KRTAP10-2P60368 255 aa7.2□□□□□ -1.26
ZNF407-201ENST00000299687 KALRNO60229 2985 aa7.18□□□□□ -1.26
ZNF407-201ENST00000299687 NDUFAF8A1L188 74 aa7.16□□□□□ -1.26
ZNF407-201ENST00000299687 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.16□□□□□ -1.26
ZNF407-201ENST00000299687 IGSF10Q6WRI0 2623 aa7.15□□□□□ -1.26
ZNF407-201ENST00000299687 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.14□□□□□ -1.27
ZNF407-201ENST00000299687 TNP1P09430 55 aa7.13□□□□□ -1.27
ZNF407-201ENST00000299687 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa7.12□□□□□ -1.27
ZNF407-201ENST00000299687 LRBAP50851 2863 aa7.12□□□□□ -1.27
ZNF407-201ENST00000299687 LAMA5O15230 3695 aa7.12□□□□□ -1.27
ZNF407-201ENST00000299687 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.11□□□□□ -1.27
ZNF407-201ENST00000299687 EYSQ5T1H1 3165 aa7.11□□□□□ -1.27
ZNF407-201ENST00000299687 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 123.3 ms