RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528627.1

NSD3-208, Transcript of nuclear receptor binding SET domain protein 3, human

TSL 2

Gene NSD3, Length 1,524 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSD3-208	ENST00000528627	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		0.21	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	TNXB	P22105	4242 aa		0.21	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	UMAD1	C9J7I0	102 aa		0.21	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	SPINK4	O60575	86 aa		0.21	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		0.2	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	CLIP1	P30622	1438 aa		0.2	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		0.2	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		0.2	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		0.2	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	NREP	Q16612	68 aa		0.19	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		0.19	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		0.19	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	SPTA1	P02549	2419 aa		0.19	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		0.18	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	NDUFB1	O75438	58 aa		0.18	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	0.18	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	PIK3C2B	O00750	1634 aa		0.18	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	SCRIB	Q14160	1630 aa		0.18	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		0.18	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	PTPN13	Q12923	2485 aa		0.18	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		0.18	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		0.17	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		0.17	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		0.17	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	CCL22	O00626	93 aa		0.17	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		0.17	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	COL7A1	Q02388	2944 aa		0.16	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		0.16	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	RYR3	Q15413	4870 aa		0.16	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	DEFA5	Q01523	94 aa		0.16	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		0.16	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	COL6A5	A8TX70	2615 aa		0.15	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	HERC1	Q15751	4861 aa		0.15	□□□□□ -2.38
NSD3-208	ENST00000528627	LCE6A	A0A183	80 aa		0.15	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627		H3BVH4	76 aa		0.15	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	NDUFA4	O00483	81 aa		0.15	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	ABCC1	P33527	1531 aa		0.15	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	BPTF	Q12830	3046 aa		0.14	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	KNL1	Q8NG31	2342 aa		0.14	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		0.14	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	LTN1	O94822	1766 aa		0.14	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		0.14	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	TRANK1	O15050	2925 aa		0.13	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		0.13	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		0.13	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		0.13	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		0.13	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		0.13	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		0.13	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		0.12	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	CREBBP	Q92793	2442 aa		0.12	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	ABCA8	O94911	1581 aa		0.12	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	MAP3K1	Q13233	1512 aa		0.12	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		0.12	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	0.12	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	HSPG2	P98160	4391 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	AKAP13	Q12802	2813 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	SPRR2D	P22532	72 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	0.11	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		0.1	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	NWD1	Q149M9	1564 aa		0.1	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627		M0R2T5	61 aa		0.1	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	HIVEP1	P15822	2718 aa		0.1	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		0.09	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	FLNC	Q14315	2725 aa		0.09	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	LINC00158	P58513	81 aa		0.09	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	ENHO	Q6UWT2	76 aa		0.09	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		0.09	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		0.09	□□□□□ -2.39
NSD3-208	ENST00000528627	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
NSD3-208	ENST00000528627	DIP2A	Q14689	1571 aa		0.09	□□□□□ -2.4
NSD3-208	ENST00000528627	USH2A	O75445	5202 aa		0.08	□□□□□ -2.4
NSD3-208	ENST00000528627		H0YAA0	97 aa		0.08	□□□□□ -2.4
NSD3-208	ENST00000528627	PDCD5	O14737	125 aa		0.08	□□□□□ -2.4
NSD3-208	ENST00000528627	PRO3102	Q9H379	93 aa		0.08	□□□□□ -2.4
NSD3-208	ENST00000528627	RICTOR	Q6R327	1708 aa		0.07	□□□□□ -2.4
NSD3-208	ENST00000528627	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		0.07	□□□□□ -2.4
NSD3-208	ENST00000528627	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	0.07	□□□□□ -2.4
NSD3-208	ENST00000528627	KMT2A	Q03164	3969 aa		0.07	□□□□□ -2.4
NSD3-208	ENST00000528627	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		0.07	□□□□□ -2.4
NSD3-208	ENST00000528627	DEFB135	Q30KP9	77 aa		0.07	□□□□□ -2.4
NSD3-208	ENST00000528627	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		0.07	□□□□□ -2.4
NSD3-208	ENST00000528627	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	0.07	□□□□□ -2.4

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