RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516914.2

RNU6-677P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 677, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-677P, Length 101 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-677P-201ENST00000516914 GYPAP02724 150 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 MYH4Q9Y623 1939 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 DNAH6Q9C0G6 4158 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 LYSTQ99698 3801 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 A0A1B0GUT8 65 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 RGPD2P0DJD1 1756 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 FAT3Q8TDW7 4589 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 STARD9Q9P2P6 4700 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 ALKQ9UM73 1620 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 PREX1Q8TCU6 1659 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 PKD1L3Q7Z443 1732 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 UBR3Q6ZT12 1888 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 ATP7BP35670 1465 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 LRRC7Q96NW7 1537 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 SPG11Q96JI7 2443 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 DNAH9Q9NYC9 4486 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 MT1AP04731 61 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 SMIM11AP58511 58 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 PKIAP61925 76 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 PLGLAQ15195 96 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 GAFA1Q96PS6 74 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 SPRR2FQ96RM1 72 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 EPG5Q9HCE0 2579 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 TACC2O95359 2948 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 IQCF6A8MYZ5 107 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 S100A8P05109 93 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 RGPD1P0DJD0 1748 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 PEA15Q15121 130 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 HIVEP1P15822 2718 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 RPL38P63173 70 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP-1.03□□□□□ -2.58
RNU6-677P-201ENST00000516914 RGPD5Q99666 1765 aa-1.03□□□□□ -2.58
RNU6-677P-201ENST00000516914 CEP162Q5TB80 1403 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-677P-201ENST00000516914 TRAV21A0A0B4J279 112 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-677P-201ENST00000516914 MT4P47944 62 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-677P-201ENST00000516914 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-677P-201ENST00000516914 MYO3AQ8NEV4 1616 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-677P-201ENST00000516914 UBR1Q8IWV7 1749 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-677P-201ENST00000516914 CUBNO60494 3623 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-677P-201ENST00000516914 CYB5AP00167 134 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-677P-201ENST00000516914 FASNP49327 2511 aaKnown RBP-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-677P-201ENST00000516914 C4AP0C0L4 1744 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-677P-201ENST00000516914 C4BP0C0L5 1744 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-677P-201ENST00000516914 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-677P-201ENST00000516914 PYY3Q5JQD4 70 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-677P-201ENST00000516914 UBR4Q5T4S7 5183 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-677P-201ENST00000516914 USH2AO75445 5202 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-677P-201ENST00000516914 HTTP42858 3142 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-677P-201ENST00000516914 USP32Q8NFA0 1604 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-677P-201ENST00000516914 VPS13DQ5THJ4 4388 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-677P-201ENST00000516914 DMXL1Q9Y485 3027 aa-1.1□□□□□ -2.58
RNU6-677P-201ENST00000516914 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 AKAP12Q02952 1782 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 H3BNG1 76 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZZEF1O43149 2961 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 AKAP9Q99996 3911 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 HERC2O95714 4834 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 WFDC9Q8NEX5 89 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 MUC17Q685J3 4493 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 C3orf79P0CE67 100 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 PRO3102Q9H379 93 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 PLIN4Q96Q06 1357 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 DNAH3Q8TD57 4116 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 C9orf92A6NGG3 77 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 DSPP15924 2871 aaKnown RBP-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 K7EP34 96 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 LINC00158P58513 81 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 LINC00643Q86TS7 51 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 RABAC1Q9UI14 185 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 TIAM2Q8IVF5 1701 aa-1.15□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 ITPR3Q14573 2671 aa-1.15□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 CCNB3Q8WWL7 1395 aa-1.15□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 CEBPZOSA8MTT3 80 aa-1.15□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP-1.15□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP-1.15□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa-1.15□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa-1.16□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP-1.16□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 WIZO95785 1651 aa-1.16□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 PLXNC1O60486 1568 aa-1.16□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 NWD1Q149M9 1564 aa-1.16□□□□□ -2.59
RNU6-677P-201ENST00000516914 APOBP04114 4563 aaKnown RBP-1.16□□□□□ -2.6
RNU6-677P-201ENST00000516914 NDUFB1O75438 58 aa-1.16□□□□□ -2.6
RNU6-677P-201ENST00000516914 LAMA1P25391 3075 aa-1.16□□□□□ -2.6
RNU6-677P-201ENST00000516914 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP-1.16□□□□□ -2.6
RNU6-677P-201ENST00000516914 NCOA2Q15596 1464 aa-1.17□□□□□ -2.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms