RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCL18P55774 89 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q8N9L7 120 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRR4Q16378 134 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3C-201ENST00000361441 CXCL6P80162 114 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q8N814 137 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3C-201ENST00000361441 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3C-201ENST00000361441 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3C-201ENST00000361441 NDUFS5O43920 106 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3C-201ENST00000361441 ERC2-IT1O76042 136 aa7.47□□□□□ -1.21
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.47□□□□□ -1.21
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF462Q96JM2 2506 aa7.47□□□□□ -1.21
APOBEC3C-201ENST00000361441 UBE2L6O14933 153 aa7.47□□□□□ -1.21
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q5VV11 94 aa7.47□□□□□ -1.21
APOBEC3C-201ENST00000361441 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa7.46□□□□□ -1.21
APOBEC3C-201ENST00000361441 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa7.46□□□□□ -1.22
APOBEC3C-201ENST00000361441 HCG22E2RYF7 251 aa7.46□□□□□ -1.22
APOBEC3C-201ENST00000361441 COX7B2Q8TF08 81 aa7.46□□□□□ -1.22
APOBEC3C-201ENST00000361441 LYRM9A8MSI8 78 aa7.46□□□□□ -1.22
APOBEC3C-201ENST00000361441 B4DSR2 109 aa7.46□□□□□ -1.22
APOBEC3C-201ENST00000361441 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.45□□□□□ -1.22
APOBEC3C-201ENST00000361441 OCR1Q9BZK8 76 aa7.45□□□□□ -1.22
APOBEC3C-201ENST00000361441 FN1P02751 2386 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.45□□□□□ -1.22
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A096LNT2 108 aa7.44□□□□□ -1.22
APOBEC3C-201ENST00000361441 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC00167Q96N53 147 aa7.44□□□□□ -1.22
APOBEC3C-201ENST00000361441 PSCAO43653 123 aa7.43□□□□□ -1.22
APOBEC3C-201ENST00000361441 UBE2AP49459 152 aa7.43□□□□□ -1.22
APOBEC3C-201ENST00000361441 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa7.43□□□□□ -1.22
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.43□□□□□ -1.22
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC01006Q8NI28 216 aa7.43□□□□□ -1.22
APOBEC3C-201ENST00000361441 MDFIQ99750 246 aa7.43□□□□□ -1.22
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF702PQ9H963 129 aa7.43□□□□□ -1.22
APOBEC3C-201ENST00000361441 MTORP42345 2549 aa7.43□□□□□ -1.22
APOBEC3C-201ENST00000361441 A6NN06 94 aa7.42□□□□□ -1.22
APOBEC3C-201ENST00000361441 PLA2G2AP14555 144 aa7.42□□□□□ -1.22
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
APOBEC3C-201ENST00000361441 MAP6D1Q9H9H5 199 aa7.42□□□□□ -1.22
APOBEC3C-201ENST00000361441 CELA1Q9UNI1 258 aa7.41□□□□□ -1.22
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.41□□□□□ -1.22
APOBEC3C-201ENST00000361441 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.41□□□□□ -1.22
APOBEC3C-201ENST00000361441 LCA10Q71F78 164 aa7.41□□□□□ -1.22
APOBEC3C-201ENST00000361441 ACANP16112 2415 aa7.41□□□□□ -1.22
APOBEC3C-201ENST00000361441 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.4□□□□□ -1.22
APOBEC3C-201ENST00000361441 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.4□□□□□ -1.23
APOBEC3C-201ENST00000361441 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.4□□□□□ -1.23
APOBEC3C-201ENST00000361441 DIRC1Q969H9 104 aa7.4□□□□□ -1.23
APOBEC3C-201ENST00000361441 WFDC10AQ9H1F0 79 aa7.4□□□□□ -1.23
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.4□□□□□ -1.23
APOBEC3C-201ENST00000361441 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP10-9P60411 292 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3C-201ENST00000361441 A8MTW9 85 aa7.37□□□□□ -1.23
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APOBEC3C-201ENST00000361441 CR1P17927 2039 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3C-201ENST00000361441 A6NED7 52 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3C-201ENST00000361441 ITPR3Q14573 2671 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3C-201ENST00000361441 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3C-201ENST00000361441 INSP01308 110 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3C-201ENST00000361441 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3C-201ENST00000361441 C6orf99Q4VX62 202 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGKV4-1P06312 121 aa7.35□□□□□ -1.23
APOBEC3C-201ENST00000361441 MUC7Q8TAX7 377 aa7.35□□□□□ -1.23
APOBEC3C-201ENST00000361441 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A0A0MQY5 61 aa7.35□□□□□ -1.23
APOBEC3C-201ENST00000361441 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q6YL49 198 aa7.34□□□□□ -1.23
APOBEC3C-201ENST00000361441 DEFB114Q30KQ6 69 aa7.34□□□□□ -1.23
APOBEC3C-201ENST00000361441 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.34□□□□□ -1.23
APOBEC3C-201ENST00000361441 K7EQD1 137 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3C-201ENST00000361441 APCP25054 2843 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3C-201ENST00000361441 C10orf25Q5T742 122 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV4-31P0DP07 118 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3C-201ENST00000361441 SMIM29Q86T20 159 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3C-201ENST00000361441 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.31□□□□□ -1.24
APOBEC3C-201ENST00000361441 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.31□□□□□ -1.24
APOBEC3C-201ENST00000361441 USP24Q9UPU5 2620 aa7.31□□□□□ -1.24
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.31□□□□□ -1.24
APOBEC3C-201ENST00000361441 C9orf66Q5T8R8 295 aa7.31□□□□□ -1.24
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC00575Q6W349 94 aa7.31□□□□□ -1.24
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q6ZQY7 126 aa7.31□□□□□ -1.24
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRAC1Q96KF2 57 aa7.31□□□□□ -1.24
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A096LPF7 62 aa7.3□□□□□ -1.24
APOBEC3C-201ENST00000361441 PDE6GP18545 87 aa7.3□□□□□ -1.24
APOBEC3C-201ENST00000361441 LIMD2Q9BT23 127 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3C-201ENST00000361441 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3C-201ENST00000361441 MOBPQ13875 183 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3C-201ENST00000361441 C4orf3Q8WVX3 66 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3C-201ENST00000361441 DEFB130BP0DP73 79 aa7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3C-201ENST00000361441 DEFB130AP0DP74 79 aa7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3C-201ENST00000361441 DSCR9P59020 149 aa7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC01554Q52M75 96 aa7.25□□□□□ -1.25
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