RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547376.5

PTPRQ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRQ, Length 1,700 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-201ENST00000547376 UBE2D3P61077 147 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 UBE2D2P62837 147 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 Q5VV11 94 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 UQCR10Q9UDW1 63 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 PI4KAP42356 2102 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 FAM208BQ5VWN6 2430 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 NOTCH2Q04721 2471 aa2.14□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 MAST4O15021 2626 aa2.14□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 TPRP12270 2363 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 TRAV22A0A0B4J277 110 aa2.14□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa2.14□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 NDUFC1O43677 76 aa2.14□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 NPVFQ9HCQ7 196 aa2.14□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 PRO1854Q9UHT4 67 aa2.14□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 ZFHX4Q86UP3 3567 aa2.14□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.13□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 ZNF292O60281 2723 aa2.13□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 SFT2D2O95562 160 aa2.13□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 SPAG11BQ08648 103 aa2.13□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 SPAG11AQ6PDA7 123 aa2.13□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 FAIMQ9NVQ4 179 aa2.13□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 ACACBO00763 2458 aa2.13□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 USP34Q70CQ2 3546 aa2.13□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 HMGN4O00479 90 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 CD52P31358 61 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 CCL18P55774 89 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 Q8N6K4 173 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 TRIOO75962 3097 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 DCHS1Q96JQ0 3298 aa2.11□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 FAM186AA6NE01 2351 aa2.11□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa2.11□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 Q9Y3F1 56 aa2.11□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 R4GMQ9 66 aa2.11□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 DOCK11Q5JSL3 2073 aa2.11□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 MYO7AQ13402 2215 aa2.11□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 USP24Q9UPU5 2620 aa2.11□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa2.11□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 GYPAP02724 150 aa2.11□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 COX6CP09669 75 aa2.11□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 KRTAP12-3P60328 96 aa2.11□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 PYY3Q5JQD4 70 aa2.11□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 SERP2Q8N6R1 65 aa2.11□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 Q96NJ1 140 aa2.11□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 WFDC6Q9BQY6 131 aa2.11□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.11□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 PRO1933Q9H354 126 aa2.11□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 V9GYH0 126 aa2.11□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 NAV2Q8IVL1 2488 aa2.11□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 MED13LQ71F56 2210 aa2.11□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 NCOR2Q9Y618 2525 aa2.1□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 WDFY4Q6ZS81 3184 aa2.1□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.1□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 C6orf52Q5T4I8 152 aa2.1□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 SORL1Q92673 2214 aa2.1□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 LYNX1P0DP58 116 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 KRTAP12-4P60329 112 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 TRGV9Q99603 122 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 TSC2P49815 1807 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
PTPRQ-201ENST00000547376 FAUP35544 74 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
PTPRQ-201ENST00000547376 CACFD1Q9UGQ2 172 aa2.08□□□□□ -2.08
PTPRQ-201ENST00000547376 CACNA1HO95180 2353 aa2.08□□□□□ -2.08
PTPRQ-201ENST00000547376 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
PTPRQ-201ENST00000547376 ABCA1O95477 2261 aa2.08□□□□□ -2.08
PTPRQ-201ENST00000547376 ZNF462Q96JM2 2506 aa2.08□□□□□ -2.08
PTPRQ-201ENST00000547376 APOC3P02656 99 aa2.08□□□□□ -2.08
PTPRQ-201ENST00000547376 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
PTPRQ-201ENST00000547376 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa2.08□□□□□ -2.08
PTPRQ-201ENST00000547376 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
PTPRQ-201ENST00000547376 LCN9Q8WX39 176 aa2.07□□□□□ -2.08
PTPRQ-201ENST00000547376 DMDP11532 3685 aa2.07□□□□□ -2.08
PTPRQ-201ENST00000547376 VPS13AQ96RL7 3174 aa2.07□□□□□ -2.08
PTPRQ-201ENST00000547376 MYO15AQ9UKN7 3530 aa2.06□□□□□ -2.08
PTPRQ-201ENST00000547376 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa2.06□□□□□ -2.08
PTPRQ-201ENST00000547376 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa2.06□□□□□ -2.08
PTPRQ-201ENST00000547376 TRAPPC2P0DI81 140 aa2.06□□□□□ -2.08
PTPRQ-201ENST00000547376 TRAPPC2BP0DI82 140 aa2.06□□□□□ -2.08
PTPRQ-201ENST00000547376 TMEM170BQ5T4T1 132 aa2.06□□□□□ -2.08
PTPRQ-201ENST00000547376 BAGE3Q86Y29 109 aa2.06□□□□□ -2.08
PTPRQ-201ENST00000547376 BPESC1Q9GZL8 116 aa2.06□□□□□ -2.08
PTPRQ-201ENST00000547376 FRYLO94915 3013 aa2.06□□□□□ -2.08
PTPRQ-201ENST00000547376 A0A096LNT2 108 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-201ENST00000547376 M0R135 149 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-201ENST00000547376 SPINK13Q1W4C9 94 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-201ENST00000547376 SFTA2Q6UW10 78 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-201ENST00000547376 VMO1Q7Z5L0 202 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-201ENST00000547376 AMELXQ99217 191 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-201ENST00000547376 DMXL1Q9Y485 3027 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-201ENST00000547376 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-201ENST00000547376 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms