RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547376.5

PTPRQ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRQ, Length 1,700 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-201ENST00000547376 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
PTPRQ-201ENST00000547376 CHIC1Q5VXU3 224 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRQ-201ENST00000547376 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
PTPRQ-201ENST00000547376 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
PTPRQ-201ENST00000547376 PLPPR3Q6T4P5 718 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRQ-201ENST00000547376 FOXD1Q16676 465 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRQ-201ENST00000547376 PPP6R1Q9UPN7 881 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRQ-201ENST00000547376 ADRA2BP18089 450 aa15.07■□□□□ 0
PTPRQ-201ENST00000547376 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRQ-201ENST00000547376 KCNA4P22459 653 aa14.17□□□□□ -0.14
PTPRQ-201ENST00000547376 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.08□□□□□ -0.16
PTPRQ-201ENST00000547376 MSH5O43196 834 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRQ-201ENST00000547376 EHMT2Q96KQ7 1210 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRQ-201ENST00000547376 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
PTPRQ-201ENST00000547376 NPM3O75607 178 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
PTPRQ-201ENST00000547376 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
PTPRQ-201ENST00000547376 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
PTPRQ-201ENST00000547376 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRQ-201ENST00000547376 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
PTPRQ-201ENST00000547376 CSRNP3Q8WYN3 585 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRQ-201ENST00000547376 DMRT2Q9Y5R5 561 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRQ-201ENST00000547376 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
PTPRQ-201ENST00000547376 DNAJC5BQ9UF47 199 aa13.18□□□□□ -0.3
PTPRQ-201ENST00000547376 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRQ-201ENST00000547376 ZBTB22O15209 634 aa13.11□□□□□ -0.31
PTPRQ-201ENST00000547376 SLC24A1O60721 1099 aa12.96□□□□□ -0.34
PTPRQ-201ENST00000547376 FOXD4L1Q9NU39 408 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRQ-201ENST00000547376 SLC4A2P04920 1241 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRQ-201ENST00000547376 DCAF8L1A6NGE4 600 aa12.63□□□□□ -0.39
PTPRQ-201ENST00000547376 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
PTPRQ-201ENST00000547376 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
PTPRQ-201ENST00000547376 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
PTPRQ-201ENST00000547376 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP12.45□□□□□ -0.42
PTPRQ-201ENST00000547376 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.43
PTPRQ-201ENST00000547376 ATXN8OSP0DMR3 200 aa12.36□□□□□ -0.43
PTPRQ-201ENST00000547376 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
PTPRQ-201ENST00000547376 POTEDQ86YR6 584 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRQ-201ENST00000547376 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
PTPRQ-201ENST00000547376 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
PTPRQ-201ENST00000547376 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
PTPRQ-201ENST00000547376 RNF39Q9H2S5 420 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRQ-201ENST00000547376 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
PTPRQ-201ENST00000547376 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
PTPRQ-201ENST00000547376 FKBP8Q14318 412 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRQ-201ENST00000547376 APLP2Q06481 763 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRQ-201ENST00000547376 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PTPRQ-201ENST00000547376 TRHP20396 242 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
PTPRQ-201ENST00000547376 CAPN15O75808 1086 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRQ-201ENST00000547376 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
PTPRQ-201ENST00000547376 POLA2Q14181 598 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRQ-201ENST00000547376 ABCB7O75027 752 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRQ-201ENST00000547376 DSG3P32926 999 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRQ-201ENST00000547376 PLCB2Q00722 1185 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRQ-201ENST00000547376 FBLN2P98095 1184 aa11.56□□□□□ -0.56
PTPRQ-201ENST00000547376 SPDYE4A6NLX3 237 aa11.55□□□□□ -0.56
PTPRQ-201ENST00000547376 PROM2Q8N271 834 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRQ-201ENST00000547376 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
PTPRQ-201ENST00000547376 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.58
PTPRQ-201ENST00000547376 BCANQ96GW7 911 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRQ-201ENST00000547376 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
PTPRQ-201ENST00000547376 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
PTPRQ-201ENST00000547376 OSCARQ8IYS5 282 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRQ-201ENST00000547376 TAOK2Q9UL54 1235 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRQ-201ENST00000547376 VSIG10Q8N0Z9 540 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRQ-201ENST00000547376 FBXO3Q9UK99 471 aa11.27□□□□□ -0.61
PTPRQ-201ENST00000547376 SSUH2Q9Y2M2 353 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRQ-201ENST00000547376 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PTPRQ-201ENST00000547376 SPDYE2BA6NHP3 402 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRQ-201ENST00000547376 SPDYE6P0CI01 402 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRQ-201ENST00000547376 SPDYE2Q495Y8 402 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRQ-201ENST00000547376 VASPP50552 380 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
PTPRQ-201ENST00000547376 DCAF8L2P0C7V8 631 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRQ-201ENST00000547376 TPRNQ4KMQ1 711 aa11.15□□□□□ -0.63
PTPRQ-201ENST00000547376 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP11.15□□□□□ -0.63
PTPRQ-201ENST00000547376 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
PTPRQ-201ENST00000547376 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRQ-201ENST00000547376 PKD2Q13563 968 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRQ-201ENST00000547376 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRQ-201ENST00000547376 STAG3Q9UJ98 1225 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRQ-201ENST00000547376 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
PTPRQ-201ENST00000547376 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
PTPRQ-201ENST00000547376 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
PTPRQ-201ENST00000547376 AKT1S1Q96B36 256 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRQ-201ENST00000547376 PLCD3Q8N3E9 789 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRQ-201ENST00000547376 MIER1Q8N108 512 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRQ-201ENST00000547376 KLHL34Q8N239 644 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRQ-201ENST00000547376 CFAP44Q96MT7 982 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRQ-201ENST00000547376 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
PTPRQ-201ENST00000547376 SPOCK2Q92563 424 aa10.84□□□□□ -0.67
PTPRQ-201ENST00000547376 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP10.84□□□□□ -0.67
PTPRQ-201ENST00000547376 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa10.84□□□□□ -0.67
PTPRQ-201ENST00000547376 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
PTPRQ-201ENST00000547376 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
PTPRQ-201ENST00000547376 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
PTPRQ-201ENST00000547376 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
PTPRQ-201ENST00000547376 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRQ-201ENST00000547376 ARXQ96QS3 562 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRQ-201ENST00000547376 CLEC11AQ9Y240 323 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRQ-201ENST00000547376 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRQ-201ENST00000547376 PITPNM1O00562 1244 aa10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.9 ms