RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528627.1

NSD3-208, Transcript of nuclear receptor binding SET domain protein 3, human

TSL 2

Gene NSD3, Length 1,524 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSD3-208	ENST00000528627		H0Y9P7	68 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NSD3-208	ENST00000528627	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NSD3-208	ENST00000528627	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NSD3-208	ENST00000528627	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NSD3-208	ENST00000528627	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
NSD3-208	ENST00000528627	ZNF292	O60281	2723 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NSD3-208	ENST00000528627	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NSD3-208	ENST00000528627	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NSD3-208	ENST00000528627		A0A1B0GU69	56 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NSD3-208	ENST00000528627		H3BQF6	201 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NSD3-208	ENST00000528627	S100A3	P33764	101 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NSD3-208	ENST00000528627	GNGT1	P63211	74 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NSD3-208	ENST00000528627	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NSD3-208	ENST00000528627		Q8IZM0	81 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NSD3-208	ENST00000528627	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NSD3-208	ENST00000528627	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NSD3-208	ENST00000528627	PLCE1	Q9P212	2302 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NSD3-208	ENST00000528627	SPTBN2	O15020	2390 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NSD3-208	ENST00000528627	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NSD3-208	ENST00000528627	WFDC2	Q14508	124 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NSD3-208	ENST00000528627	ATP10B	O94823	1461 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	IGLC2	P0DOY2	106 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	IGLC3	P0DOY3	106 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	PEA15	Q15121	130 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	MDN1	Q9NU22	5596 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	NMS	Q5H8A3	153 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	CEP162	Q5TB80	1403 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	SLIT1	O75093	1534 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	PAPPA	Q13219	1627 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	USF3	Q68DE3	2245 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	PIGY	Q3MUY2	71 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	DEFB123	Q8N688	67 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	NEB	P20929	6669 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627		K7EQZ3	153 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	MED14	O60244	1454 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	HMGN3	Q15651	99 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	FANCA	O15360	1455 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627		Q5BKY6	102 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
NSD3-208	ENST00000528627	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	0.4	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	COL6A3	P12111	3177 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	SPRR1B	P22528	89 aa		0.39	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	SPRR1A	P35321	89 aa		0.39	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	SMIM11A	P58511	58 aa		0.39	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	IGF2R	P11717	2491 aa		0.39	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	ABCC2	Q92887	1545 aa		0.39	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		0.38	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	KLK9	Q2XQG4	91 aa		0.38	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	LINC00643	Q86TS7	51 aa		0.38	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	ABCC3	O15438	1527 aa		0.38	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		0.38	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	CACNA1A	O00555	2505 aa		0.38	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		0.38	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		0.38	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	MYH4	Q9Y623	1939 aa		0.38	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	MUC2	Q02817	5179 aa		0.37	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	SAMD9	Q5K651	1589 aa		0.37	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		0.37	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	AKAP6	Q13023	2319 aa		0.37	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		0.37	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	SPINK1	P00995	79 aa		0.37	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		0.37	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	UACA	Q9BZF9	1416 aa		0.37	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		0.37	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	0.37	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	CUX1	P39880	1505 aa		0.36	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	SHPRH	Q149N8	1683 aa		0.36	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	COX6B1	P14854	86 aa		0.36	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	PLGLA	Q15195	96 aa		0.36	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	LELP1	Q5T871	98 aa		0.36	□□□□□ -2.35
NSD3-208	ENST00000528627	RABAC1	Q9UI14	185 aa		0.36	□□□□□ -2.35

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