RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-208ENST00000510829 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-208ENST00000510829 STAB1Q9NY15 2570 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-208ENST00000510829 MAST4O15021 2626 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-208ENST00000510829 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-208ENST00000510829 REG3AQ06141 175 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-208ENST00000510829 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-208ENST00000510829 COX7A2LO14548 114 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-208ENST00000510829 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-208ENST00000510829 KLK12Q9UKR0 248 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGEF1-208ENST00000510829 SIGMAR1Q99720 223 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGEF1-208ENST00000510829 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.62□□□□□ -1.19
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RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP10-11P60412 298 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGEF1-208ENST00000510829 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGEF1-208ENST00000510829 CCL18P55774 89 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-208ENST00000510829 LELP1Q5T871 98 aa7.6□□□□□ -1.19
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RABGEF1-208ENST00000510829 Q8IZM0 81 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-208ENST00000510829 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-208ENST00000510829 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-208ENST00000510829 Q6ZTC4 211 aa7.58□□□□□ -1.2
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RABGEF1-208ENST00000510829 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-208ENST00000510829 COL6A5A8TX70 2615 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-208ENST00000510829 H3BT86 120 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-208ENST00000510829 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-208ENST00000510829 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-208ENST00000510829 DNAL4O96015 105 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-208ENST00000510829 SPAG11BQ08648 103 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-208ENST00000510829 DEFB121Q5J5C9 76 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-208ENST00000510829 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A0J9YWU9 116 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-208ENST00000510829 SPATA25Q9BR10 227 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-208ENST00000510829 CXCL5P42830 114 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-208ENST00000510829 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-208ENST00000510829 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-208ENST00000510829 MRAPQ8TCY5 172 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-208ENST00000510829 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-208ENST00000510829 IGKV2D-28P01615 120 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-208ENST00000510829 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-208ENST00000510829 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-208ENST00000510829 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-208ENST00000510829 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-208ENST00000510829 Q9HAA7 133 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-208ENST00000510829 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-208ENST00000510829 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-208ENST00000510829 C6orf223Q8N319 242 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-208ENST00000510829 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
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RABGEF1-208ENST00000510829 CDIP1Q9H305 208 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-208ENST00000510829 TRACP01848 142 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-208ENST00000510829 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-208ENST00000510829 CYSRT1A8MQ03 144 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGEF1-208ENST00000510829 ENHOQ6UWT2 76 aa7.5□□□□□ -1.21
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RABGEF1-208ENST00000510829 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGEF1-208ENST00000510829 LECT2O14960 151 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGEF1-208ENST00000510829 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGEF1-208ENST00000510829 C10orf25Q5T742 122 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGEF1-208ENST00000510829 XGP55808 180 aa7.49□□□□□ -1.21
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RABGEF1-208ENST00000510829 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
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RABGEF1-208ENST00000510829 PRR34Q9NV39 138 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A087WYN8 130 aa7.47□□□□□ -1.21
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RABGEF1-208ENST00000510829 SVIPQ8NHG7 77 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-208ENST00000510829 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-208ENST00000510829 H3BNG1 76 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-208ENST00000510829 TMEM126AQ9H061 195 aa7.47□□□□□ -1.21
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RABGEF1-208ENST00000510829 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-208ENST00000510829 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-208ENST00000510829 SLPIP03973 132 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-208ENST00000510829 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-208ENST00000510829 MGAM2Q2M2H8 2515 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-208ENST00000510829 TENM3Q9P273 2699 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-208ENST00000510829 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-208ENST00000510829 SCGB1A1P11684 91 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-208ENST00000510829 NDUFC2O95298 119 aa7.43□□□□□ -1.22
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