RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 SMCO4Q9NRQ5 59 aa4.94□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa4.94□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa4.93□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 IGIPA6NJ69 53 aa4.93□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 PRSS47A8MTI9 375 aa4.93□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.93□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP10-8P60410 259 aa4.93□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 RAB5BP61020 215 aa4.93□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 HERVK_113P63121 156 aa4.93□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 SEC11AP67812 179 aa4.93□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 FABP9Q0Z7S8 132 aa4.93□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 CLLU1Q5K131 121 aa4.93□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 AMELXQ99217 191 aa4.93□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM218A2RU14 115 aa4.92□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 ADCYAP1P18509 176 aa4.92□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 FA2HQ7L5A8 372 aa4.92□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 RPS10P5Q9NQ39 176 aa4.92□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 GAGE10A6NGK3 116 aa4.91□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 H0Y9J4 135 aa4.91□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 K7EMI3 77 aa4.91□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 SPINK8P0C7L1 97 aa4.91□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 ERASQ7Z444 233 aa4.91□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 COMMD7Q86VX2 200 aa4.91□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 Q8IZM0 81 aa4.91□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 TOMM6Q96B49 74 aa4.91□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 RPL37AP8A6NKH3 93 aa4.9□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 F8VRH5 84 aa4.9□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 GHRHP01286 108 aa4.9□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 UQCC3Q6UW78 93 aa4.9□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.9□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 LINC01561Q8N1V8 128 aa4.9□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 COX7B2Q8TF08 81 aa4.9□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 TIMM17AQ99595 171 aa4.9□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 C22orf24Q9Y442 160 aa4.9□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 TNXBP22105 4242 aa4.89□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 PFN2P35080 140 aa4.89□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 IFITM2Q01629 132 aa4.89□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 GNB1LQ9BYB4 327 aa4.89□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 CST9LQ9H4G1 147 aa4.89□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa4.88□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa4.88□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 SMIM1B2RUZ4 78 aa4.88□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 H3BRM9 83 aa4.88□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 NPSP0C0P6 89 aa4.88□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 PMVKQ15126 192 aa4.88□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 PMCHL1Q16048 86 aa4.88□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.88□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 SEC11CQ9BY50 192 aa4.88□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 ATP5LO75964 103 aa4.87□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 TSPAN13O95857 204 aa4.87□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 CXCL5P42830 114 aa4.87□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 PRR4Q16378 134 aa4.87□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 PDZD11Q5EBL8 140 aa4.87□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa4.87□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa4.87□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF861PO60384 105 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 COX19Q49B96 90 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 LINC01549A6NIU2 74 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 NUPR1O60356 82 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 SCO1O75880 301 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 APOC3P02656 99 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 RPL28P46779 137 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 UBE2AP49459 152 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 RHEBQ15382 184 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM170BQ5T4T1 132 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 LINC00167Q96N53 147 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 BCE1O60756 84 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 IGKV2D-28P01615 120 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 LINC00614P0C842 121 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 BAGE3Q86Y29 109 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-209ENST00000480420 A0A0U1RRA0 63 aa4.83□□□□□ -1.64
CTPS1-209ENST00000480420 HBDP02042 147 aa4.83□□□□□ -1.64
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa4.83□□□□□ -1.64
CTPS1-209ENST00000480420 NDUFA5Q16718 116 aa4.83□□□□□ -1.64
CTPS1-209ENST00000480420 C18orf32Q8TCD1 76 aa4.83□□□□□ -1.64
CTPS1-209ENST00000480420 ANAPC11Q9NYG5 84 aa4.83□□□□□ -1.64
CTPS1-209ENST00000480420 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.82□□□□□ -1.64
CTPS1-209ENST00000480420 LINC01546A6NGU7 62 aa4.82□□□□□ -1.64
CTPS1-209ENST00000480420 ATP6V1G1O75348 118 aa4.82□□□□□ -1.64
CTPS1-209ENST00000480420 IGLC3P0DOY3 106 aa4.82□□□□□ -1.64
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CTPS1-209ENST00000480420 TYMSOSQ8TAI1 123 aa4.82□□□□□ -1.64
CTPS1-209ENST00000480420 TP73-AS1Q9UF72 201 aa4.82□□□□□ -1.64
CTPS1-209ENST00000480420 ERG28Q9UKR5 140 aa4.82□□□□□ -1.64
CTPS1-209ENST00000480420 H0Y8G0 127 aa4.81□□□□□ -1.64
CTPS1-209ENST00000480420 SNAPINO95295 136 aa4.81□□□□□ -1.64
CTPS1-209ENST00000480420 CRYGAP11844 174 aa4.81□□□□□ -1.64
CTPS1-209ENST00000480420 LINC00158P58513 81 aa4.81□□□□□ -1.64
CTPS1-209ENST00000480420 PRLHP81277 87 aa4.81□□□□□ -1.64
CTPS1-209ENST00000480420 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa4.81□□□□□ -1.64
CTPS1-209ENST00000480420 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.81□□□□□ -1.64
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