RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC00173Q6ZV60 143 aa5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1-204ENST00000459646 Q8IZM0 81 aa5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1-204ENST00000459646 SCGB3A1Q96QR1 104 aa5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1-204ENST00000459646 AMELXQ99217 191 aa5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1-204ENST00000459646 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1-204ENST00000459646 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1-204ENST00000459646 IGIPA6NJ69 53 aa5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 K7EMI3 77 aa5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 GAGE10A6NGK3 116 aa5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 RPL37AP8A6NKH3 93 aa5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 F8VRH5 84 aa5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF861PO60384 105 aa5.14□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 NUPR1O60356 82 aa5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 NPSP0C0P6 89 aa5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 COX7B2Q8TF08 81 aa5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 TOMM6Q96B49 74 aa5.13□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 SPINK8P0C7L1 97 aa5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 ADCYAP1P18509 176 aa5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 S100PP25815 95 aa5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 NDUFA6P56556 154 aa5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 ERASQ7Z444 233 aa5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 TIMM17AQ99595 171 aa5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 SMCO4Q9NRQ5 59 aa5.12□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 LPAP08519 4548 aa5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 CXCL5P42830 114 aa5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 PDZD11Q5EBL8 140 aa5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 FA2HQ7L5A8 372 aa5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC00167Q96N53 147 aa5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 SMIM1B2RUZ4 78 aa5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 BCE1O60756 84 aa5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 PFN2P35080 140 aa5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 UBE2AP49459 152 aa5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 FABP9Q0Z7S8 132 aa5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 CST9LQ9H4G1 147 aa5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 H3BRM9 83 aa5.09□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 ATP5LO75964 103 aa5.09□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 CRYGAP11844 174 aa5.09□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 PMVKQ15126 192 aa5.09□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.09□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 TP73-AS1Q9UF72 201 aa5.09□□□□□ -1.59
SH3BP1-204ENST00000459646 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa5.08□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC01549A6NIU2 74 aa5.08□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 SCO1O75880 301 aa5.08□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 IGKV2D-28P01615 120 aa5.08□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 CLLU1Q5K131 121 aa5.08□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 GNB1LQ9BYB4 327 aa5.08□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.08□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.07□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa5.07□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A087X002 238 aa5.07□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM218A2RU14 115 aa5.07□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 UQCC3Q6UW78 93 aa5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 RPS10P5Q9NQ39 176 aa5.06□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa5.05□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.05□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 COX19Q49B96 90 aa5.05□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.05□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 PRLHP81277 87 aa5.04□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 PMCHL1Q16048 86 aa5.04□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM170BQ5T4T1 132 aa5.04□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 SEC11CQ9BY50 192 aa5.04□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 ERG28Q9UKR5 140 aa5.04□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa5.04□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 MUC2Q02817 5179 aa5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A0U1RQV1 116 aa5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A0U1RRA0 63 aa5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC01546A6NGU7 62 aa5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM238C9JI98 176 aa5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 ATP6V1G1O75348 118 aa5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 COMMD7Q86VX2 200 aa5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 BAGE3Q86Y29 109 aa5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1-204ENST00000459646 HBDP02042 147 aa5.02□□□□□ -1.61
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC00614P0C842 121 aa5.02□□□□□ -1.61
SH3BP1-204ENST00000459646 IGLC3P0DOY3 106 aa5.02□□□□□ -1.61
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC00158P58513 81 aa5.02□□□□□ -1.61
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.02□□□□□ -1.61
SH3BP1-204ENST00000459646 CBLN2Q8IUK8 224 aa5.01□□□□□ -1.61
SH3BP1-204ENST00000459646 HIGD2AQ9BW72 106 aa5.01□□□□□ -1.61
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM126AQ9H061 195 aa5.01□□□□□ -1.61
SH3BP1-204ENST00000459646 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa5□□□□□ -1.61
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