RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MPV17L2Q567V2 206 aa6.4□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.4□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.4□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.4□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.4□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF815PA8K554 130 aa6.39□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.39□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LRP2P98164 4655 aa6.39□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-201ENST00000412640 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.39□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.39□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-201ENST00000412640 Q9H8V8 135 aa6.39□□□□□ -1.39
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TM2D2Q9BX73 214 aa6.38□□□□□ -1.39
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.37□□□□□ -1.39
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.37□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.37□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SPINK8P0C7L1 97 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GCSHP23434 173 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BATFQ16520 125 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TTC32Q5I0X7 151 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-201ENST00000412640 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRR34Q9NV39 138 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A087WZ39 114 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SS18Q15532 418 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CEND1Q8N111 149 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.34□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A0J9YXY3 114 aa6.34□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NDUFA1O15239 70 aa6.34□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TIMM17BO60830 172 aa6.34□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ESRGQ1W209 222 aa6.34□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.34□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.34□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A6NDN8 102 aa6.33□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FXYD2P54710 66 aa6.33□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 REG3AQ06141 175 aa6.33□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.33□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HIST1H4GQ99525 98 aa6.33□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LITAFQ99732 161 aa6.33□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.33□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A1B0GWB2 263 aa6.32□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM238C9JI98 176 aa6.32□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TAX1BP3O14907 124 aa6.32□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 Q6ZVH6 145 aa6.32□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 Q8N3U1 123 aa6.32□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.32□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SPANXCQ9NY87 97 aa6.32□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.32□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.31□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A1B0GV90 55 aa6.31□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGHV3-30P01768 117 aa6.31□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.31□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HERV-K104P63124 156 aa6.31□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.31□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SFTA2Q6UW10 78 aa6.31□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ENHOQ6UWT2 76 aa6.31□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.31□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A087WTM6 91 aa6.3□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.3□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 XCL1P47992 114 aa6.3□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PTTG1IPP53801 180 aa6.3□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 COX7B2Q8TF08 81 aa6.3□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.3□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 COX11Q9Y6N1 276 aa6.3□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 K7EP13 123 aa6.29□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 COX7A2LO14548 114 aa6.29□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SMIM13P0DJ93 91 aa6.29□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FOXI1Q12951 378 aa6.29□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MIAQ16674 131 aa6.29□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.29□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C5orf38Q86SI9 138 aa6.29□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 Q8IZM0 81 aa6.29□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 UPK3BQ9BT76 320 aa6.29□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KLK12Q9UKR0 248 aa6.29□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IFITM1P13164 125 aa6.28□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C9orf118A6NHY6 69 aa6.27□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGHV3-33P01772 117 aa6.27□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KIAA0087Q14695 138 aa6.27□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.27□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.27□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.26□□□□□ -1.41
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