RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622166.1

IGHV3-54-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-54 (pseudogene), humanhuman

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Gene IGHV3-54, Length 353 nt, Biotype IG V pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-54-201ENST00000622166 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.74□□□□□ -1.33
IGHV3-54-201ENST00000622166 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.74□□□□□ -1.33
IGHV3-54-201ENST00000622166 A0A0U1RRA0 63 aa6.74□□□□□ -1.33
IGHV3-54-201ENST00000622166 MYO18BQ8IUG5 2567 aa6.74□□□□□ -1.33
IGHV3-54-201ENST00000622166 PTPN13Q12923 2485 aa6.74□□□□□ -1.33
IGHV3-54-201ENST00000622166 COL12A1Q99715 3063 aa6.74□□□□□ -1.33
IGHV3-54-201ENST00000622166 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.73□□□□□ -1.33
IGHV3-54-201ENST00000622166 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.73□□□□□ -1.33
IGHV3-54-201ENST00000622166 A0A087WZ39 114 aa6.73□□□□□ -1.33
IGHV3-54-201ENST00000622166 SNCGO76070 127 aa6.73□□□□□ -1.33
IGHV3-54-201ENST00000622166 PLA2G2AP14555 144 aa6.73□□□□□ -1.33
IGHV3-54-201ENST00000622166 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
IGHV3-54-201ENST00000622166 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.73□□□□□ -1.33
IGHV3-54-201ENST00000622166 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.73□□□□□ -1.33
IGHV3-54-201ENST00000622166 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.73□□□□□ -1.33
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZANQ9Y493 2812 aa6.73□□□□□ -1.33
IGHV3-54-201ENST00000622166 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.73□□□□□ -1.33
IGHV3-54-201ENST00000622166 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.72□□□□□ -1.33
IGHV3-54-201ENST00000622166 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.72□□□□□ -1.33
IGHV3-54-201ENST00000622166 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.72□□□□□ -1.33
IGHV3-54-201ENST00000622166 GAGE2BQ13066 116 aa6.72□□□□□ -1.33
IGHV3-54-201ENST00000622166 GAGE2EQ4V326 116 aa6.72□□□□□ -1.33
IGHV3-54-201ENST00000622166 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.72□□□□□ -1.33
IGHV3-54-201ENST00000622166 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.72□□□□□ -1.33
IGHV3-54-201ENST00000622166 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.72□□□□□ -1.33
IGHV3-54-201ENST00000622166 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.72□□□□□ -1.33
IGHV3-54-201ENST00000622166 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.71□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.71□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 A0A1B0GUV1 79 aa6.71□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 CRLF1O75462 422 aa6.71□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 ACYP1P07311 99 aa6.71□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 KRTAP10-3P60369 221 aa6.71□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.71□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.7□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 IGKV2D-28P01615 120 aa6.7□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 CRPP02741 224 aa6.7□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.7□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 X6R8D5 127 aa6.7□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.69□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 CCL18P55774 89 aa6.69□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 LINC00158P58513 81 aa6.69□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.69□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.69□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 C22orf24Q9Y442 160 aa6.69□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 VPS13CQ709C8 3753 aa6.69□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 LRRK2Q5S007 2527 aa6.68□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.68□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 H0YGX0 51 aa6.68□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 GYPEP15421 78 aa6.68□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 SS18Q15532 418 aa6.68□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 C5orf38Q86SI9 138 aa6.68□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.68□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.68□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 PRO0255Q9UI72 69 aa6.68□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 ITPR3Q14573 2671 aa6.68□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.68□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 WNK1Q9H4A3 2382 aa6.67□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.67□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 LYRM9A8MSI8 78 aa6.67□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 J3QKU1 62 aa6.67□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 DEFB130BP0DP73 79 aa6.67□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 DEFB130AP0DP74 79 aa6.67□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 Q8IZM0 81 aa6.67□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 TTC32Q5I0X7 151 aa6.66□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.66□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.66□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.66□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 MYO9AB2RTY4 2548 aa6.66□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 ABCA12Q86UK0 2595 aa6.65□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 APCP25054 2843 aa6.65□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 LY6G6DO95868 133 aa6.65□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.65□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 MALP21145 153 aa6.65□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.65□□□□□ -1.34
IGHV3-54-201ENST00000622166 PAX4O43316 350 aa6.64□□□□□ -1.35
IGHV3-54-201ENST00000622166 IMUPQ9GZP8 106 aa6.64□□□□□ -1.35
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa6.64□□□□□ -1.35
IGHV3-54-201ENST00000622166 PFN2P35080 140 aa6.63□□□□□ -1.35
IGHV3-54-201ENST00000622166 KIAA0087Q14695 138 aa6.63□□□□□ -1.35
IGHV3-54-201ENST00000622166 LINC00643Q86TS7 51 aa6.63□□□□□ -1.35
IGHV3-54-201ENST00000622166 CHD6Q8TD26 2715 aa6.63□□□□□ -1.35
IGHV3-54-201ENST00000622166 CXCL5P42830 114 aa6.62□□□□□ -1.35
IGHV3-54-201ENST00000622166 XCL1P47992 114 aa6.62□□□□□ -1.35
IGHV3-54-201ENST00000622166 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.62□□□□□ -1.35
IGHV3-54-201ENST00000622166 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.62□□□□□ -1.35
IGHV3-54-201ENST00000622166 PDZD2O15018 2839 aa6.61□□□□□ -1.35
IGHV3-54-201ENST00000622166 A0A087WYN8 130 aa6.61□□□□□ -1.35
IGHV3-54-201ENST00000622166 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.61□□□□□ -1.35
IGHV3-54-201ENST00000622166 A0A1B0GX51 115 aa6.61□□□□□ -1.35
IGHV3-54-201ENST00000622166 NDUFC2O95298 119 aa6.61□□□□□ -1.35
IGHV3-54-201ENST00000622166 APOC4P55056 127 aa6.61□□□□□ -1.35
IGHV3-54-201ENST00000622166 COX17Q14061 63 aa6.61□□□□□ -1.35
IGHV3-54-201ENST00000622166 LINC00167Q96N53 147 aa6.61□□□□□ -1.35
IGHV3-54-201ENST00000622166 Q9HAA7 133 aa6.61□□□□□ -1.35
IGHV3-54-201ENST00000622166 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.61□□□□□ -1.35
IGHV3-54-201ENST00000622166 SONP18583 2426 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
IGHV3-54-201ENST00000622166 EPG5Q9HCE0 2579 aa6.6□□□□□ -1.35
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