RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 SLC25A20O43772 301 aa6.09□□□□□ -1.43
ACTB-208ENST00000464611 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.09□□□□□ -1.43
ACTB-208ENST00000464611 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.09□□□□□ -1.43
ACTB-208ENST00000464611 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.09□□□□□ -1.43
ACTB-208ENST00000464611 CUBNO60494 3623 aa6.08□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.08□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.08□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.08□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 LINC01620Q4KN68 170 aa6.08□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.08□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.08□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.08□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 ZFHX3Q15911 3703 aa6.08□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 NACAE9PAV3 2078 aa6.07□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.07□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.07□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.07□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 SPINK8P0C7L1 97 aa6.07□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 Q6ZTI0 123 aa6.07□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.07□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.07□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.07□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 SORL1Q92673 2214 aa6.07□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.06□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.06□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 A0A1W2PRX2 142 aa6.06□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 C9JAW5 83 aa6.06□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.06□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 CARD19Q96LW7 228 aa6.06□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.06□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 GAGE12JA6NER3 117 aa6.05□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.05□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 GAGE4Q13068 117 aa6.05□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 GAGE5Q13069 117 aa6.05□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.05□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.05□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.05□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 C3orf56Q8N813 242 aa6.05□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.05□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 Q9H8V8 135 aa6.05□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.04□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.04□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.04□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 A0A1B0GV72 72 aa6.04□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.04□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 LST1O00453 97 aa6.04□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 TRIAP1O43715 76 aa6.04□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 PRM2P04554 102 aa6.04□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.04□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.04□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 Q9UF83 564 aa6.04□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 C2CD3Q4AC94 2353 aa6.04□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 A0A1B0GUV1 79 aa6.03□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.03□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 F5H768 121 aa6.03□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 GAGE7O76087 117 aa6.03□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 ACYP1P07311 99 aa6.03□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 GAGE12FP0CL80 117 aa6.03□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 GAGE12GP0CL81 117 aa6.03□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 GAGE12IP0CL82 117 aa6.03□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 COX6A2Q02221 97 aa6.03□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 FHL2Q14192 279 aa6.03□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.03□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 C2orf82Q6UX34 121 aa6.03□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 CITED1Q99966 193 aa6.03□□□□□ -1.44
ACTB-208ENST00000464611 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.02□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 LYRM9A8MSI8 78 aa6.02□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.02□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 H7C2G1 150 aa6.02□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 COX7A2LO14548 114 aa6.02□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 TRACP01848 142 aa6.02□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 LINC00694P0DN24 101 aa6.02□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.02□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.02□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.02□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 COX7B2Q8TF08 81 aa6.02□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 A0A087WZ39 114 aa6.01□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 Q6Q795 121 aa6.01□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 MUC7Q8TAX7 377 aa6.01□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 UBE2WQ96B02 151 aa6.01□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 CDIP1Q9H305 208 aa6.01□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 JMJD1CQ15652 2540 aa6.01□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 H0YGX0 51 aa6□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 KRTAP10-3P60369 221 aa6□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 SS18Q15532 418 aa6□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 LINC00482Q8N8I6 264 aa6□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 SPATA3Q8NHX4 192 aa6□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
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