RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-202ENST00000444658 UBE2D1P51668 147 aa6.4□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.4□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 CEND1Q8N111 149 aa6.4□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.39□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.39□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A0J9YXV3 536 aa6.39□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF815PA8K554 130 aa6.39□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 J3QQQ9 107 aa6.39□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 TCTAP57738 103 aa6.39□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.39□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.39□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.39□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.39□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 DNHD1Q96M86 4753 aa6.39□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 HTN3P15516 51 aa6.38□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 HERVK_113P63121 156 aa6.38□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 VAMP3Q15836 100 aa6.38□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.37□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q6ZUT4 128 aa6.37□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 HIST1H4GQ99525 98 aa6.37□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.36□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A1B0GWB2 263 aa6.36□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 C9orf118A6NHY6 69 aa6.36□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM262E9PQX1 116 aa6.36□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 SMIM13P0DJ93 91 aa6.36□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 GCSHP23434 173 aa6.36□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 GAGE6Q13070 117 aa6.36□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.36□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.36□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.36□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 VPS25Q9BRG1 176 aa6.36□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.35□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.34□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.34□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 FXYD2P54710 66 aa6.34□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q6ZVH6 145 aa6.34□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.34□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.34□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.33□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.33□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM238C9JI98 176 aa6.33□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 ESRGQ1W209 222 aa6.33□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 RNF151Q2KHN1 245 aa6.33□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.33□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRR34Q9NV39 138 aa6.33□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.33□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.32□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.32□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 TIMM17BO60830 172 aa6.32□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 COX6A2Q02221 97 aa6.32□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 SS18Q15532 418 aa6.32□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A087WZ39 114 aa6.31□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.31□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGHV3-30P01768 117 aa6.31□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.31□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A0J9YXY3 114 aa6.3□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A1W2PPM0 123 aa6.3□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 NDUFA1O15239 70 aa6.3□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 REG3AQ06141 175 aa6.3□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.3□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.3□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.3□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.3□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.3□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPANXCQ9NY87 97 aa6.3□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.3□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.29□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 GAGE10A6NGK3 116 aa6.29□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 H3BUT2 72 aa6.29□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 SCGB1A1P11684 91 aa6.29□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 CCL18P55774 89 aa6.29□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.29□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 UPK3BQ9BT76 320 aa6.29□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 TENM3Q9P273 2699 aa6.29□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.28□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPINK8P0C7L1 97 aa6.28□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.28□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 FABP2P12104 132 aa6.28□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 IFITM1P13164 125 aa6.28□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 HERV-K104P63124 156 aa6.28□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 SFTA2Q6UW10 78 aa6.28□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.28□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGLL5B9A064 214 aa6.28□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 K7EP34 96 aa6.28□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 MIAQ16674 131 aa6.28□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 COPS9Q8WXC6 57 aa6.28□□□□□ -1.4
CCNDBP1-202ENST00000444658 RAB37Q96AX2 223 aa6.28□□□□□ -1.4
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